More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1584 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  100 
 
 
422 aa  847    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3086  type II secretion system protein  44.37 
 
 
439 aa  363  3e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  42.82 
 
 
406 aa  347  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  41.65 
 
 
405 aa  347  3e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  43.76 
 
 
419 aa  344  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  42.22 
 
 
404 aa  342  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  42.08 
 
 
405 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  41 
 
 
405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  43.44 
 
 
408 aa  336  5e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  41.41 
 
 
405 aa  335  9e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  42.82 
 
 
407 aa  334  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  41.71 
 
 
405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  41.49 
 
 
401 aa  326  5e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  42.48 
 
 
406 aa  325  8.000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  41.94 
 
 
405 aa  324  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  41.15 
 
 
403 aa  319  5e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  40.66 
 
 
406 aa  319  7e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  38.65 
 
 
417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  38.65 
 
 
417 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  39.95 
 
 
419 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  40.38 
 
 
404 aa  306  4.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  38.16 
 
 
417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  37.98 
 
 
403 aa  299  6e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  39.14 
 
 
406 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  38.39 
 
 
407 aa  295  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  38.44 
 
 
407 aa  291  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  35.8 
 
 
401 aa  289  6e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  38.13 
 
 
409 aa  289  6e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  39.23 
 
 
417 aa  288  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  40.58 
 
 
403 aa  288  2e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  36.9 
 
 
411 aa  285  9e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  40.77 
 
 
401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  35.89 
 
 
405 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  38.04 
 
 
409 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  35.63 
 
 
402 aa  282  7.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  35.99 
 
 
409 aa  282  9e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  34.94 
 
 
424 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  34.94 
 
 
420 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  38.97 
 
 
404 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  38.97 
 
 
404 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  35.02 
 
 
402 aa  277  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  36.08 
 
 
412 aa  278  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  34.78 
 
 
421 aa  276  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  34.78 
 
 
421 aa  276  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  37.14 
 
 
410 aa  276  6e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  35.55 
 
 
403 aa  276  7e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  35.78 
 
 
405 aa  275  9e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  35.63 
 
 
410 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  37.2 
 
 
403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  34.06 
 
 
424 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  36.38 
 
 
403 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  34.69 
 
 
406 aa  271  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  35.75 
 
 
405 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  36.99 
 
 
416 aa  271  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  38.46 
 
 
409 aa  271  2e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  34.06 
 
 
405 aa  271  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  33.82 
 
 
405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  33.65 
 
 
417 aa  269  8e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  34.3 
 
 
405 aa  268  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  34.3 
 
 
404 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  35.31 
 
 
409 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  34.13 
 
 
407 aa  266  5.999999999999999e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  37.83 
 
 
407 aa  265  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  39.57 
 
 
403 aa  265  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2175  type II secretion system protein  38.73 
 
 
410 aa  264  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357882  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  35.02 
 
 
406 aa  263  4e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  35.58 
 
 
405 aa  263  4.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  36.63 
 
 
407 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  36.63 
 
 
407 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  36.63 
 
 
407 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  36.63 
 
 
407 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  33.41 
 
 
419 aa  262  6.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  34.06 
 
 
408 aa  262  8e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  35.97 
 
 
409 aa  262  8e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  35.58 
 
 
405 aa  262  8e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  35.08 
 
 
406 aa  262  1e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  34.78 
 
 
406 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  34.78 
 
 
408 aa  261  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  35.63 
 
 
401 aa  261  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4589  general secretion pathway protein F  36.64 
 
 
413 aa  261  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  35.02 
 
 
402 aa  261  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  33.82 
 
 
408 aa  261  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  33.73 
 
 
405 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  35.73 
 
 
417 aa  260  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0719  general secretion pathway protein F  36.36 
 
 
409 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.975907  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0718  general secretion pathway protein F  36.36 
 
 
409 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  34.78 
 
 
412 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  36.39 
 
 
407 aa  259  6e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0233  general secretion pathway protein F  33.73 
 
 
406 aa  259  8e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  36.21 
 
 
407 aa  259  9e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  37.25 
 
 
404 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  34.77 
 
 
419 aa  257  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  32.37 
 
 
407 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00603  general secretion pathway protein F  33.89 
 
 
406 aa  258  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  37.62 
 
 
409 aa  256  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  33.57 
 
 
406 aa  256  5e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  33.09 
 
 
419 aa  256  7e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  34.3 
 
 
422 aa  255  8e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  36.06 
 
 
463 aa  255  9e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  32.94 
 
 
405 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>