More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1824 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 
409 aa  817    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  63.14 
 
 
416 aa  558  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  66.26 
 
 
410 aa  546  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  60.99 
 
 
409 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  62.99 
 
 
417 aa  530  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  52.09 
 
 
411 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  45.06 
 
 
405 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  44.11 
 
 
406 aa  354  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  44.08 
 
 
405 aa  348  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  44.3 
 
 
405 aa  345  8e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  44.81 
 
 
405 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  44.11 
 
 
407 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  43.58 
 
 
404 aa  335  7e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  42.72 
 
 
417 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  42.72 
 
 
417 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  44.25 
 
 
406 aa  328  9e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  43.34 
 
 
417 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  40.84 
 
 
407 aa  326  5e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  44.33 
 
 
405 aa  324  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  43.7 
 
 
401 aa  323  4e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  42.89 
 
 
419 aa  323  5e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  42.07 
 
 
405 aa  322  8e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  42.51 
 
 
409 aa  321  9.999999999999999e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  41.63 
 
 
406 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  41.77 
 
 
403 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  45.64 
 
 
406 aa  317  2e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  41.75 
 
 
408 aa  312  7.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  41.87 
 
 
401 aa  311  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  40.35 
 
 
407 aa  309  5e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  42 
 
 
402 aa  308  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  46.19 
 
 
403 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  40.59 
 
 
404 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  37.87 
 
 
403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  43.11 
 
 
404 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  41.04 
 
 
404 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  41.04 
 
 
404 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  43.21 
 
 
401 aa  299  5e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  40.93 
 
 
410 aa  298  2e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  41.1 
 
 
403 aa  296  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  39.05 
 
 
403 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  39.26 
 
 
417 aa  290  5.0000000000000004e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  40.35 
 
 
412 aa  289  7e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  36.39 
 
 
405 aa  288  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  39.4 
 
 
402 aa  288  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  39 
 
 
405 aa  286  4e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  37.16 
 
 
401 aa  286  5e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  37.53 
 
 
421 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  38.5 
 
 
405 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  39.35 
 
 
408 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  37.84 
 
 
407 aa  283  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  39.5 
 
 
405 aa  283  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  37.23 
 
 
406 aa  281  2e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  42.24 
 
 
403 aa  281  2e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  39.75 
 
 
405 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  39.8 
 
 
408 aa  279  5e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  38.04 
 
 
424 aa  278  9e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  40.56 
 
 
409 aa  278  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  39.7 
 
 
409 aa  276  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  38.35 
 
 
403 aa  276  6e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  37.19 
 
 
424 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  38.85 
 
 
405 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  36.78 
 
 
407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  37.19 
 
 
420 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0952  type II secretion system protein  40.45 
 
 
402 aa  273  5.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  35.66 
 
 
408 aa  272  6e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  37.5 
 
 
421 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  38.71 
 
 
405 aa  271  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  37.95 
 
 
405 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  37.22 
 
 
401 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  39.36 
 
 
405 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0681  type II secretion system protein  42.98 
 
 
407 aa  267  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.524718  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  37.75 
 
 
417 aa  267  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  36.93 
 
 
405 aa  266  7e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3255  type II secretion system protein  35.95 
 
 
403 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  38.85 
 
 
404 aa  263  3e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  35.89 
 
 
402 aa  264  3e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  36.7 
 
 
401 aa  263  4e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  37.62 
 
 
422 aa  262  8.999999999999999e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  34.16 
 
 
404 aa  259  4e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  35.95 
 
 
419 aa  257  2e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2903  type II secretion system protein  37.31 
 
 
405 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  32.84 
 
 
401 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  35.43 
 
 
403 aa  257  3e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0425  type II secretion system protein  37.84 
 
 
406 aa  256  4e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126236  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  35.47 
 
 
409 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  36.48 
 
 
401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  34.67 
 
 
406 aa  252  8.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  34.67 
 
 
406 aa  252  9.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  37.03 
 
 
463 aa  251  1e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00171  pili biogenesis protein  41.62 
 
 
426 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  35.89 
 
 
423 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  36.78 
 
 
463 aa  251  2e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1745  type II secretion system protein  38.84 
 
 
377 aa  251  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41063  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  36.05 
 
 
409 aa  250  3e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  37.59 
 
 
419 aa  250  4e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0774  type II secretion system protein  37.56 
 
 
405 aa  249  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  36 
 
 
405 aa  249  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  35.14 
 
 
406 aa  248  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2707  type II secretion system protein  36.19 
 
 
401 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  34.55 
 
 
408 aa  247  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>