More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4697 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  100 
 
 
406 aa  823    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  61.58 
 
 
407 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  59.26 
 
 
407 aa  511  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  59.21 
 
 
404 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  59.21 
 
 
404 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  59.21 
 
 
404 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  56.48 
 
 
410 aa  471  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1745  type II secretion system protein  53.31 
 
 
377 aa  390  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41063  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00171  pili biogenesis protein  49.41 
 
 
426 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  41.79 
 
 
405 aa  332  5e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  41.18 
 
 
410 aa  332  9e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  41.48 
 
 
405 aa  332  9e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  40.8 
 
 
405 aa  328  9e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  41.83 
 
 
409 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  39.3 
 
 
406 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  40.3 
 
 
405 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  40.69 
 
 
406 aa  318  1e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  40.55 
 
 
401 aa  316  5e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  39.21 
 
 
411 aa  315  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  41.16 
 
 
405 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  39.8 
 
 
405 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  43.82 
 
 
404 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  39.75 
 
 
416 aa  312  6.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  41.63 
 
 
409 aa  312  6.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  40.9 
 
 
419 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  39.55 
 
 
407 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  42.75 
 
 
403 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  40.45 
 
 
406 aa  308  8e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  39.49 
 
 
417 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  38.46 
 
 
408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  39.51 
 
 
417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  39.55 
 
 
417 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  39.24 
 
 
417 aa  302  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  36.54 
 
 
403 aa  297  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  37.1 
 
 
409 aa  293  4e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  38.37 
 
 
408 aa  292  9e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  40.69 
 
 
401 aa  291  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  40.35 
 
 
417 aa  290  3e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  38.42 
 
 
422 aa  290  4e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  34.98 
 
 
402 aa  288  8e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  37.93 
 
 
401 aa  288  9e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  37.44 
 
 
421 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  40.51 
 
 
403 aa  287  2e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  38.18 
 
 
404 aa  288  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  37.34 
 
 
408 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  37.28 
 
 
424 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  37.13 
 
 
406 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  36.84 
 
 
408 aa  282  9e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06891  Type II secretory pathway component PulF-like protein  40.88 
 
 
453 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.807158  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  35.29 
 
 
409 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  36.34 
 
 
407 aa  280  4e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  35.16 
 
 
402 aa  279  5e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  38.06 
 
 
412 aa  279  7e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  37.44 
 
 
404 aa  278  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  34.48 
 
 
463 aa  278  1e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  36.18 
 
 
403 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  34.48 
 
 
463 aa  277  2e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  35.34 
 
 
421 aa  276  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  36.04 
 
 
420 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  36.04 
 
 
424 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0681  type II secretion system protein  39.59 
 
 
407 aa  273  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.524718  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  34.84 
 
 
405 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  35.4 
 
 
409 aa  273  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  35.43 
 
 
405 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  35.71 
 
 
403 aa  272  7e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  34.84 
 
 
405 aa  272  8.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  36.52 
 
 
403 aa  272  9e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  34.42 
 
 
407 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  35.22 
 
 
402 aa  270  4e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  35.78 
 
 
419 aa  269  5e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  34.59 
 
 
405 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  37.28 
 
 
419 aa  268  8.999999999999999e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  35.5 
 
 
405 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  35.91 
 
 
401 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  34.09 
 
 
419 aa  268  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3255  type II secretion system protein  36 
 
 
403 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  37.16 
 
 
433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1187  Type II secretory pathway component PulF-like  39 
 
 
446 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.497537  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1087  type II secretion system protein  40.24 
 
 
419 aa  266  7e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0972  type IV pilus biogenesis protein PilC  40.24 
 
 
419 aa  266  7e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.910627  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  36.6 
 
 
417 aa  265  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  34.34 
 
 
405 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  36.41 
 
 
409 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  36.07 
 
 
403 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  33.83 
 
 
401 aa  264  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  34.32 
 
 
401 aa  263  3e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  33.99 
 
 
405 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  34.24 
 
 
422 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  32.92 
 
 
405 aa  263  6e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  35.54 
 
 
422 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0719  general secretion pathway protein F  36.41 
 
 
409 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.975907  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  33.92 
 
 
405 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  35.31 
 
 
401 aa  262  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0424  type II secretion system protein  35.34 
 
 
421 aa  262  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440885 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0718  general secretion pathway protein F  36.41 
 
 
409 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0481  type II secretion system protein, type IV pilus biogenesis protein PilC  37.91 
 
 
410 aa  261  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  34.24 
 
 
406 aa  260  3e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  35.93 
 
 
405 aa  260  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  34.24 
 
 
406 aa  259  4e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  35.45 
 
 
422 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>