More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0508 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  100 
 
 
408 aa  819    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  76.77 
 
 
409 aa  639    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  76.73 
 
 
405 aa  654    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  77.48 
 
 
405 aa  658    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  77.94 
 
 
408 aa  635    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  76.73 
 
 
405 aa  627  1e-179  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  75.74 
 
 
405 aa  629  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  76.24 
 
 
405 aa  626  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  76.98 
 
 
405 aa  627  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  74.02 
 
 
407 aa  610  1e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2903  type II secretion system protein  73.02 
 
 
405 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  70.34 
 
 
408 aa  596  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  66.83 
 
 
402 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  65.85 
 
 
407 aa  552  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  60.44 
 
 
424 aa  520  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  59.85 
 
 
424 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  60.25 
 
 
421 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  60.05 
 
 
420 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  64.14 
 
 
409 aa  512  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  61.52 
 
 
421 aa  505  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  55.36 
 
 
403 aa  455  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  53.58 
 
 
405 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  52.72 
 
 
405 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  53 
 
 
406 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  54.98 
 
 
405 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0774  type II secretion system protein  55.72 
 
 
405 aa  435  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  54.55 
 
 
405 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  52.11 
 
 
405 aa  434  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  52.91 
 
 
402 aa  431  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  55.16 
 
 
404 aa  420  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  50 
 
 
419 aa  420  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  52.27 
 
 
419 aa  421  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  51.77 
 
 
406 aa  416  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  51.77 
 
 
406 aa  416  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  51.52 
 
 
419 aa  418  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  51.88 
 
 
463 aa  414  1e-114  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  51.88 
 
 
463 aa  414  1e-114  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58760  type 4 fimbrial biogenesis protein pilC  56.53 
 
 
373 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.95906  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2682  type II secretion system protein  52.66 
 
 
406 aa  409  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0414992  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  50.12 
 
 
417 aa  409  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  51.52 
 
 
401 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0862  type IV pilus biogenesis protein PilC  48.11 
 
 
405 aa  396  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  45.12 
 
 
422 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  49.11 
 
 
412 aa  387  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2185  Type II secretion system F domain protein  51.64 
 
 
403 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.170941  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  45 
 
 
423 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0063  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilC  51.26 
 
 
407 aa  383  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000657868  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  44.31 
 
 
423 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0068  type II secretion system protein  51.01 
 
 
407 aa  383  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000163403  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3943  type II secretion system protein  45.5 
 
 
423 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  45.26 
 
 
422 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  45.5 
 
 
420 aa  373  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  45.75 
 
 
419 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4061  type II secretion system protein  44.18 
 
 
423 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.505472 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0481  type II secretion system protein, type IV pilus biogenesis protein PilC  48.86 
 
 
410 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0418  type II secretion system protein  45.25 
 
 
423 aa  364  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.11378  hitchhiker  0.00766616 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  44.36 
 
 
421 aa  361  1e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3606  type II secretion system protein  45.11 
 
 
421 aa  359  5e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  43.86 
 
 
419 aa  358  6e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3424  type II secretion system protein  45.86 
 
 
421 aa  358  8e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.760778  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  43.57 
 
 
422 aa  355  1e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  42.57 
 
 
405 aa  350  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3390  type II secretion system protein  42.89 
 
 
422 aa  349  6e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0424  type II secretion system protein  44.11 
 
 
421 aa  346  3e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440885 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  44.55 
 
 
405 aa  344  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2175  type II secretion system protein  43.66 
 
 
410 aa  345  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357882  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  42.93 
 
 
405 aa  343  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  41.4 
 
 
405 aa  341  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0150  type II secretion system protein  40.25 
 
 
410 aa  340  4e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  44.78 
 
 
401 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  42.43 
 
 
404 aa  338  8e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  39.8 
 
 
406 aa  338  9e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0972  type IV pilus biogenesis protein PilC  44.58 
 
 
419 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.910627  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1087  type II secretion system protein  44.58 
 
 
419 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  41.9 
 
 
405 aa  330  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  40.9 
 
 
405 aa  329  7e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  42.42 
 
 
403 aa  329  7e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  39.71 
 
 
417 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  39.47 
 
 
417 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  41.01 
 
 
404 aa  321  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  39.23 
 
 
417 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  40.54 
 
 
407 aa  316  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  41.56 
 
 
419 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  45.16 
 
 
401 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  37.82 
 
 
401 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  38.58 
 
 
407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  42.29 
 
 
403 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  39.8 
 
 
410 aa  300  4e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  38.83 
 
 
417 aa  299  5e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  38.31 
 
 
409 aa  299  6e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2001  type IV pilin biogenesis protein PilC  41.67 
 
 
408 aa  298  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148255  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  38.94 
 
 
406 aa  297  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  36.82 
 
 
408 aa  295  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  40.4 
 
 
407 aa  294  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  37.34 
 
 
406 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  37.97 
 
 
406 aa  291  1e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  38.81 
 
 
416 aa  290  3e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  38.04 
 
 
407 aa  287  2.9999999999999996e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  37.97 
 
 
403 aa  285  9e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  37.78 
 
 
404 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>