More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2560 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  100 
 
 
403 aa  817    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  73.7 
 
 
403 aa  629  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  42.33 
 
 
403 aa  333  3e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  38.65 
 
 
402 aa  315  7e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  38.9 
 
 
401 aa  311  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  38.85 
 
 
409 aa  308  8e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  39.6 
 
 
405 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0302  Type II secretion system F domain protein  37.19 
 
 
412 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  39.95 
 
 
404 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  40.7 
 
 
401 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  37.78 
 
 
410 aa  303  4.0000000000000003e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  38.81 
 
 
405 aa  300  3e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  38.57 
 
 
405 aa  300  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  39.13 
 
 
407 aa  297  3e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  38 
 
 
405 aa  296  4e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  38.21 
 
 
417 aa  294  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  37.35 
 
 
407 aa  293  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  37.86 
 
 
406 aa  292  6e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  38.04 
 
 
405 aa  292  6e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  39.05 
 
 
409 aa  291  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  37.04 
 
 
404 aa  290  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  36.82 
 
 
417 aa  290  3e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  37.35 
 
 
404 aa  286  5e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  38.65 
 
 
405 aa  286  7e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  37.16 
 
 
411 aa  285  7e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  35.71 
 
 
406 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  35.65 
 
 
419 aa  280  3e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  42.14 
 
 
401 aa  280  4e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  36.84 
 
 
416 aa  280  4e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  37.25 
 
 
404 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  34.32 
 
 
408 aa  278  1e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  38.42 
 
 
409 aa  278  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  36.97 
 
 
422 aa  278  2e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  35.63 
 
 
406 aa  277  2e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  35.73 
 
 
403 aa  276  4e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  37.77 
 
 
407 aa  276  5e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  35.09 
 
 
417 aa  275  8e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  35.09 
 
 
401 aa  275  9e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  34.84 
 
 
417 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  36.46 
 
 
405 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  34.59 
 
 
417 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  36.2 
 
 
405 aa  272  7e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  36.74 
 
 
404 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  37.97 
 
 
408 aa  271  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  36.74 
 
 
404 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  35.22 
 
 
409 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2101  type II secretion system protein  35.5 
 
 
404 aa  271  2e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  36.52 
 
 
403 aa  271  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  37.94 
 
 
405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  35.7 
 
 
407 aa  268  1e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  36.05 
 
 
406 aa  268  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  34.83 
 
 
419 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  35.22 
 
 
409 aa  266  4e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  37.22 
 
 
408 aa  266  5.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  34.94 
 
 
406 aa  266  7e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  35.45 
 
 
410 aa  264  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  37.22 
 
 
405 aa  263  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  36.46 
 
 
407 aa  262  8.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  35.7 
 
 
409 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  33.5 
 
 
403 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  35.26 
 
 
408 aa  261  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  37.09 
 
 
405 aa  260  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  34.35 
 
 
402 aa  261  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  34.5 
 
 
406 aa  261  2e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2707  type II secretion system protein  34.28 
 
 
401 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  37.37 
 
 
433 aa  259  4e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2185  Type II secretion system F domain protein  36.46 
 
 
403 aa  258  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.170941  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0063  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilC  39.04 
 
 
407 aa  258  2e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000657868  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  36.27 
 
 
403 aa  257  3e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  34.94 
 
 
405 aa  256  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  35.01 
 
 
405 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  35.7 
 
 
405 aa  256  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  35.43 
 
 
409 aa  256  4e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0068  type II secretion system protein  39.04 
 
 
407 aa  256  4e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000163403  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  38.57 
 
 
403 aa  256  7e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  32.83 
 
 
404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  35.64 
 
 
402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  32.35 
 
 
401 aa  254  3e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  34.67 
 
 
405 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  31.75 
 
 
406 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  33.92 
 
 
405 aa  252  6e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  32.17 
 
 
406 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  33.92 
 
 
406 aa  251  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  33.91 
 
 
406 aa  251  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0150  type II secretion system protein  34.67 
 
 
410 aa  251  1e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0425  type II secretion system protein  34.5 
 
 
406 aa  251  2e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126236  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  34.43 
 
 
424 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  31.51 
 
 
405 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  35.47 
 
 
409 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  33.83 
 
 
405 aa  251  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  34.16 
 
 
406 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  33.33 
 
 
405 aa  251  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  32.42 
 
 
401 aa  250  3e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3343  type II secretion system protein  33 
 
 
405 aa  250  4e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000142203  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1745  type II secretion system protein  39.48 
 
 
377 aa  250  4e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41063  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  32.35 
 
 
412 aa  249  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0862  type IV pilus biogenesis protein PilC  35.18 
 
 
405 aa  249  6e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  35.7 
 
 
406 aa  249  8e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3831  type II secretion system protein  34.74 
 
 
406 aa  248  9e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00398408  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0488  type II secretion system protein  34.08 
 
 
406 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00834812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>