More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2512 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  81.08 
 
 
405 aa  654    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  83.7 
 
 
405 aa  694    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  80.34 
 
 
405 aa  647    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  100 
 
 
405 aa  810    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  81.57 
 
 
406 aa  676    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  82.96 
 
 
404 aa  672    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  81.82 
 
 
407 aa  651    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  68.89 
 
 
405 aa  546  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  58.25 
 
 
417 aa  471  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  57.75 
 
 
417 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  56.93 
 
 
405 aa  463  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  57.75 
 
 
417 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  58.21 
 
 
419 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  56.3 
 
 
403 aa  429  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  50.62 
 
 
401 aa  423  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  53.69 
 
 
403 aa  421  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  49.38 
 
 
404 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  51.12 
 
 
401 aa  383  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  43.35 
 
 
409 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  42.64 
 
 
408 aa  355  7.999999999999999e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  43.67 
 
 
402 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  42.14 
 
 
420 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  43.07 
 
 
407 aa  346  4e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  42.39 
 
 
403 aa  346  4e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  42.14 
 
 
424 aa  346  4e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  41.15 
 
 
421 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  44 
 
 
410 aa  341  2e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  42.3 
 
 
408 aa  340  2.9999999999999998e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  44.08 
 
 
409 aa  338  9.999999999999999e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  41.65 
 
 
405 aa  336  5e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  41.79 
 
 
417 aa  335  5.999999999999999e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  40.74 
 
 
403 aa  335  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  41.9 
 
 
405 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  40.2 
 
 
417 aa  333  2e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  41.83 
 
 
406 aa  333  3e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  43.39 
 
 
412 aa  332  5e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0681  type II secretion system protein  47.83 
 
 
407 aa  332  8e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.524718  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  40.65 
 
 
421 aa  331  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  42.54 
 
 
404 aa  330  2e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  41.63 
 
 
409 aa  330  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  42.32 
 
 
417 aa  330  3e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  40.8 
 
 
406 aa  328  9e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  39.9 
 
 
424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  41.4 
 
 
408 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  39.8 
 
 
406 aa  328  1.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  40.76 
 
 
422 aa  328  1.0000000000000001e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  42.05 
 
 
404 aa  326  5e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  39.41 
 
 
419 aa  326  6e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  39.27 
 
 
463 aa  325  8.000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  39.27 
 
 
463 aa  325  1e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  39.5 
 
 
401 aa  324  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  39.7 
 
 
411 aa  323  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  38.71 
 
 
419 aa  323  3e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  40.35 
 
 
406 aa  322  9.000000000000001e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  39.9 
 
 
405 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  40.05 
 
 
407 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  40.44 
 
 
407 aa  320  3e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  41.04 
 
 
404 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  41.04 
 
 
404 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  39.4 
 
 
405 aa  319  6e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  39.65 
 
 
408 aa  319  6e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  38.93 
 
 
410 aa  315  7e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  40.35 
 
 
419 aa  314  9.999999999999999e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  38.61 
 
 
416 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  41.96 
 
 
403 aa  313  4.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  38.15 
 
 
402 aa  313  4.999999999999999e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  41.44 
 
 
405 aa  311  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  40.55 
 
 
405 aa  311  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  38.71 
 
 
409 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  40.15 
 
 
405 aa  311  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  40.59 
 
 
406 aa  310  4e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  40.59 
 
 
406 aa  309  5.9999999999999995e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  40.25 
 
 
409 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  38.46 
 
 
422 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  38.21 
 
 
423 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  37.91 
 
 
407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0862  type IV pilus biogenesis protein PilC  42.17 
 
 
405 aa  306  3e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2682  type II secretion system protein  38.82 
 
 
406 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0414992  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1087  type II secretion system protein  42.93 
 
 
419 aa  306  6e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0972  type IV pilus biogenesis protein PilC  42.93 
 
 
419 aa  306  6e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.910627  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2185  Type II secretion system F domain protein  42.57 
 
 
403 aa  305  6e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.170941  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  39.15 
 
 
420 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  39.65 
 
 
405 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  39.05 
 
 
405 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  41.91 
 
 
406 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  39.11 
 
 
422 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  37.97 
 
 
423 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  37.91 
 
 
422 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  39.37 
 
 
419 aa  301  1e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  37.91 
 
 
405 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  37.81 
 
 
421 aa  300  3e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  36.27 
 
 
402 aa  298  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  36.43 
 
 
409 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  38.56 
 
 
405 aa  296  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  36.56 
 
 
405 aa  296  5e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  37.62 
 
 
419 aa  296  6e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  37.09 
 
 
403 aa  295  8e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2903  type II secretion system protein  39.15 
 
 
405 aa  295  8e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0774  type II secretion system protein  40.9 
 
 
405 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3606  type II secretion system protein  38.06 
 
 
421 aa  294  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>