More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2894 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2894  general secretion pathway protein F  100 
 
 		 410 aa  809    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196755  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1115  general secretion pathway protein F  49.58 
 
 		 364 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02677  general secretion pathway protein F  41.52 
 
 		 405 aa  309  6.999999999999999e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4159  type II secretion system protein  40.85 
 
 		 427 aa  298  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287604 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0547  type II secretion system protein  40.54 
 
 		 406 aa  279  5e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0476697 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0770  type II secretion system protein  41.42 
 
 		 405 aa  278  8e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  38.55 
 
 		 409 aa  276  6e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1300  type II secretion system protein  39.61 
 
 		 405 aa  275  8e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254672 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0857  general secretory pathway protein F  41.18 
 
 		 405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  36.1 
 
 		 409 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  36.3 
 
 		 401 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  34.81 
 
 		 405 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  36.67 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  33.75 
 
 		 405 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2090  type II secretion system protein  38.54 
 
 		 402 aa  262  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0804302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  35.44 
 
 		 401 aa  257  3e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  34.83 
 
 		 403 aa  256  5e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  34.79 
 
 		 410 aa  255  9e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  34.36 
 
 		 419 aa  254  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  35.56 
 
 		 401 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  33.42 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  33 
 
 		 405 aa  254  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  31.93 
 
 		 404 aa  254  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  34.24 
 
 		 405 aa  253  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  35.92 
 
 		 409 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  33.66 
 
 		 405 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2182  general secretion pathway protein F  38.39 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 419 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  36.34 
 
 		 405 aa  250  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  33.75 
 
 		 417 aa  249  7e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  31.6 
 
 		 401 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  34.31 
 
 		 409 aa  246  4e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  35.61 
 
 		 405 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  34.16 
 
 		 405 aa  245  8e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  37.24 
 
 		 405 aa  245  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  35.28 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3242  general secretion pathway protein F  35.7 
 
 		 405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  33.25 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  31.36 
 
 		 401 aa  243  3e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  35.21 
 
 		 405 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  35.21 
 
 		 405 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  35.21 
 
 		 405 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  35.21 
 
 		 405 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  35.21 
 
 		 405 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  35.21 
 
 		 405 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0687  type II secretion system protein  39.72 
 
 		 416 aa  243  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0719  general secretion pathway protein F  35.92 
 
 		 409 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.975907  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0718  general secretion pathway protein F  35.92 
 
 		 409 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  35.21 
 
 		 405 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  34.3 
 
 		 401 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  34.64 
 
 		 403 aa  242  9e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  33.17 
 
 		 405 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1409  type II secretion system protein  32.77 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205741  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0079  general secretion pathway protein F  35.21 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  35.54 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0010  general secretion pathway protein F  35.21 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  33.09 
 
 		 407 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  33.17 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0060  general secretion pathway protein F  35.45 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3072  general secretion pathway protein F  35.7 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000734436 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0060  general secretion pathway protein F  35.21 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211909  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  34.96 
 
 		 405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  31.84 
 
 		 422 aa  240  2.9999999999999997e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  32.34 
 
 		 417 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0050  general secretion pathway protein F  35.21 
 
 		 405 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899692  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  31.62 
 
 		 406 aa  239  5e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  32.59 
 
 		 417 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  31.02 
 
 		 403 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  33.25 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  32.76 
 
 		 408 aa  238  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  34.56 
 
 		 411 aa  238  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  32.67 
 
 		 417 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  32.84 
 
 		 401 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  37.71 
 
 		 403 aa  237  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1923  type II secretion system protein  32.6 
 
 		 402 aa  236  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.919085  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  33.5 
 
 		 405 aa  237  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0061  general secretion pathway protein F  34.47 
 
 		 405 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  32.68 
 
 		 408 aa  236  6e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  29.85 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  33.25 
 
 		 419 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  35.73 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  33.25 
 
 		 424 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  36.89 
 
 		 403 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  33.25 
 
 		 420 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3086  type II secretion system protein  36.3 
 
 		 439 aa  233  4.0000000000000004e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  35.32 
 
 		 402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  31.53 
 
 		 402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.28 
 
 		 405 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3150  type II secretion system protein  37.75 
 
 		 400 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  33.66 
 
 		 409 aa  233  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  33.25 
 
 		 405 aa  233  6e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1301  general secretion pathway protein F  35.61 
 
 		 408 aa  231  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  33.17 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3366  general secretion pathway protein F  35.35 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0261754 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2175  type II secretion system protein  36.39 
 
 		 410 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357882  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  31.3 
 
 		 408 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  34.06 
 
 		 407 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  34.06 
 
 		 407 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  34.06 
 
 		 407 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  34.06 
 
 		 407 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>