More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1279 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1279  general secretion pathway protein F  100 
 
 
403 aa  778    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0681  general secretion pathway protein F  54.59 
 
 
403 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3366  general secretion pathway protein F  54.32 
 
 
403 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0261754 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0593  general secretion pathway protein F  53.32 
 
 
400 aa  388  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0607  general secretion pathway protein F  52.83 
 
 
400 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000348524 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0327  general secretion pathway protein F  52.85 
 
 
403 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  38.52 
 
 
407 aa  290  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4356  general secretion pathway protein F  38.27 
 
 
407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0233  general secretion pathway protein F  37.78 
 
 
406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  37.78 
 
 
407 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  37.78 
 
 
407 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  37.78 
 
 
407 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  37.78 
 
 
407 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0107  general secretion pathway protein F  38.73 
 
 
410 aa  281  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1301  general secretion pathway protein F  40.79 
 
 
408 aa  280  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0123  general secretion pathway protein F  38.52 
 
 
407 aa  279  5e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1472  general secretion pathway protein F  41.5 
 
 
408 aa  279  8e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.655662  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  37.53 
 
 
407 aa  278  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  36.05 
 
 
407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3072  general secretion pathway protein F  38.42 
 
 
405 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000734436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  38.16 
 
 
412 aa  273  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4589  general secretion pathway protein F  38.44 
 
 
413 aa  273  4.0000000000000004e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  37.68 
 
 
405 aa  272  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  37.93 
 
 
405 aa  272  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3617  general secretion pathway protein F  37.04 
 
 
406 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0060  general secretion pathway protein F  38.73 
 
 
405 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  38.08 
 
 
405 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  38.08 
 
 
405 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  38.08 
 
 
405 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  38.08 
 
 
405 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0061  general secretion pathway protein F  38.33 
 
 
405 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  38.08 
 
 
405 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  38.69 
 
 
409 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  38.08 
 
 
405 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0050  general secretion pathway protein F  38.73 
 
 
405 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  38.08 
 
 
405 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3242  general secretion pathway protein F  38.08 
 
 
405 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  38.08 
 
 
405 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0079  general secretion pathway protein F  38.48 
 
 
405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0010  general secretion pathway protein F  38.48 
 
 
405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0060  general secretion pathway protein F  38.48 
 
 
405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211909  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  40.44 
 
 
409 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  39.22 
 
 
404 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0158  general secretion pathway protein F  38.52 
 
 
407 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0153  general secretion pathway protein F  38.52 
 
 
407 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2922  general secretion pathway protein F  34.9 
 
 
405 aa  265  8.999999999999999e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24010  general secretion pathway protein F  38.37 
 
 
405 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0168  general secretion pathway protein F  38.27 
 
 
407 aa  263  4e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2031  general secretion pathway protein F  38.52 
 
 
405 aa  263  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0171  general secretion pathway protein F  37.78 
 
 
407 aa  263  6e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1314  type II secretory pathway protein LspF  37.41 
 
 
399 aa  262  8e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1071  general secretion pathway protein F  38.67 
 
 
405 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  39.14 
 
 
402 aa  261  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2858  general secretion pathway protein F  40 
 
 
408 aa  261  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0153  general secretion pathway protein F  37.68 
 
 
407 aa  261  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0143  general secretion pathway protein F  39.8 
 
 
407 aa  260  4e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2392  general secretion pathway protein F  38.63 
 
 
404 aa  260  4e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000517266 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1317  type II secretory pathway protein LspF  36.92 
 
 
399 aa  259  5.0000000000000005e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0718  general secretion pathway protein F  40.69 
 
 
409 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0719  general secretion pathway protein F  40.69 
 
 
409 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.975907  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03958  general secretion pathway protein F  36.86 
 
 
408 aa  257  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0005  general secretion pathway protein F  39.02 
 
 
407 aa  255  9e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.138499 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1414  general secretion pathway protein F  39.51 
 
 
408 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1350  general secretion pathway protein F  37.06 
 
 
403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3394  general secretion pathway protein F  36.98 
 
 
405 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955056  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00603  general secretion pathway protein F  34.24 
 
 
406 aa  252  8.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5703  general secretion pathway protein F  35.7 
 
 
408 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0555477  normal  0.0587373 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0099  general secretion pathway protein F  37.18 
 
 
396 aa  251  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  34.73 
 
 
406 aa  250  3e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  35.16 
 
 
408 aa  249  6e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0252  general secretion pathway protein F  33.75 
 
 
404 aa  249  6e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3231  general secretion pathway protein F  37.53 
 
 
405 aa  249  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0101612  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  35.19 
 
 
409 aa  249  7e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1414  general secretion pathway protein F  39.01 
 
 
405 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0648646  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2371  general secretion pathway protein F  39.57 
 
 
410 aa  247  3e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3173  general secretion pathway protein F  37.13 
 
 
403 aa  247  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131882  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  34 
 
 
401 aa  247  3e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3136  general secretion pathway protein F  38.52 
 
 
407 aa  246  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2209  general secretion pathway protein F  36.63 
 
 
399 aa  246  4e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616736  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1331  general secretion pathway protein F  36.89 
 
 
410 aa  245  8e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.466659  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4178  general secretion pathway protein F  40.94 
 
 
400 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363514  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0754  general secretion pathway protein F  34.95 
 
 
412 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  35.16 
 
 
403 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3138  general secretory pathway protein F  38.08 
 
 
404 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000899303 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3054  general secretion pathway protein F  38.52 
 
 
403 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  33.42 
 
 
406 aa  241  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1071  general secretion pathway protein F  35.63 
 
 
411 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3401  general secretion pathway protein F  38.02 
 
 
403 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.54461 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3425  general secretion pathway protein F  37.78 
 
 
407 aa  240  4e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3410  general secretion pathway protein GspF  38.48 
 
 
407 aa  239  5e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001890  general secretion pathway protein F  34.57 
 
 
405 aa  239  5.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  34.41 
 
 
406 aa  238  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3116  general secretory pathway F transmembrane protein  37.68 
 
 
403 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205783  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  33.74 
 
 
410 aa  238  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  31.09 
 
 
405 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02836  hypothetical type II secretion protein GspF  37.78 
 
 
407 aa  237  3e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000156909  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02786  hypothetical protein  37.78 
 
 
407 aa  237  3e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000209561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3245  general secretion pathway protein GspF  37.78 
 
 
407 aa  237  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.750263 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4249  general secretion pathway protein F  36.32 
 
 
403 aa  236  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0204352 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3429  general secretion pathway protein F  35.31 
 
 
405 aa  236  6e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>