More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03958 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0233  general secretion pathway protein F  78.43 
 
 		 406 aa  668    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03958  general secretion pathway protein F  100 
 
 		 408 aa  828    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  60.93 
 
 		 407 aa  523  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4589  general secretion pathway protein F  58.98 
 
 		 413 aa  520  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  59.95 
 
 		 407 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  59.95 
 
 		 407 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  59.95 
 
 		 407 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  59.95 
 
 		 407 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0153  general secretion pathway protein F  61.18 
 
 		 407 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0158  general secretion pathway protein F  60.44 
 
 		 407 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0153  general secretion pathway protein F  60.44 
 
 		 407 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0107  general secretion pathway protein F  60 
 
 		 410 aa  508  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0123  general secretion pathway protein F  60.54 
 
 		 407 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  59.46 
 
 		 407 aa  502  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4356  general secretion pathway protein F  59.21 
 
 		 407 aa  501  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3617  general secretion pathway protein F  59.21 
 
 		 406 aa  498  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  58.05 
 
 		 406 aa  496  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  59.21 
 
 		 407 aa  498  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0171  general secretion pathway protein F  59.11 
 
 		 407 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0168  general secretion pathway protein F  60.2 
 
 		 407 aa  491  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2922  general secretion pathway protein F  57.25 
 
 		 405 aa  476  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00603  general secretion pathway protein F  56.62 
 
 		 406 aa  477  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1301  general secretion pathway protein F  59.17 
 
 		 408 aa  472  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1472  general secretion pathway protein F  59.17 
 
 		 408 aa  464  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.655662  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001890  general secretion pathway protein F  56.27 
 
 		 405 aa  462  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0099  general secretion pathway protein F  55.39 
 
 		 396 aa  453  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2858  general secretion pathway protein F  57.11 
 
 		 408 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0005  general secretion pathway protein F  54.52 
 
 		 407 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.138499 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1414  general secretion pathway protein F  57.35 
 
 		 408 aa  432  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2392  general secretion pathway protein F  53.07 
 
 		 404 aa  422  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000517266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3136  general secretion pathway protein F  53.92 
 
 		 407 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3425  general secretion pathway protein F  53.68 
 
 		 407 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3245  general secretion pathway protein GspF  53.66 
 
 		 407 aa  412  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.750263 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3410  general secretion pathway protein GspF  53.41 
 
 		 407 aa  413  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02836  hypothetical type II secretion protein GspF  53.66 
 
 		 407 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000156909  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  51.6 
 
 		 404 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02786  hypothetical protein  53.66 
 
 		 407 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000209561  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1350  general secretion pathway protein F  50.86 
 
 		 403 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2031  general secretion pathway protein F  50.37 
 
 		 405 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24010  general secretion pathway protein F  49.63 
 
 		 405 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2371  general secretion pathway protein F  50 
 
 		 410 aa  377  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2924  general secretion pathway protein F  50.61 
 
 		 405 aa  375  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646431  normal  0.200315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1414  general secretion pathway protein F  48.04 
 
 		 405 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0648646  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03178  general secretory pathway component, cryptic  45.05 
 
 		 398 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0386  general secretion pathway protein F  45.05 
 
 		 398 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0386  general secretion pathway protein F  45.05 
 
 		 398 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3521  general secretion pathway protein F  45.05 
 
 		 398 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03129  hypothetical protein  45.05 
 
 		 398 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0143  general secretion pathway protein F  47.06 
 
 		 407 aa  353  4e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  44.09 
 
 		 405 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  44.09 
 
 		 405 aa  351  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4249  general secretion pathway protein F  46.15 
 
 		 403 aa  346  4e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0204352 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1317  type II secretory pathway protein LspF  43.6 
 
 		 399 aa  345  6e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1314  type II secretory pathway protein LspF  43.6 
 
 		 399 aa  345  6e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  42.86 
 
 		 405 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3578  TonB-dependent siderophore receptor  44.01 
 
 		 411 aa  339  5e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.477901 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  42.61 
 
 		 405 aa  338  8e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  42.61 
 
 		 405 aa  338  9e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  42.61 
 
 		 405 aa  338  9e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  42.61 
 
 		 405 aa  338  9e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  42.61 
 
 		 405 aa  338  9e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  42.61 
 
 		 405 aa  338  9e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  42.61 
 
 		 405 aa  338  9e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3072  general secretion pathway protein F  43.1 
 
 		 405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000734436 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0079  general secretion pathway protein F  41.67 
 
 		 405 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0010  general secretion pathway protein F  41.67 
 
 		 405 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0060  general secretion pathway protein F  41.67 
 
 		 405 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211909  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0061  general secretion pathway protein F  41.52 
 
 		 405 aa  331  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0060  general secretion pathway protein F  41.42 
 
 		 405 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0050  general secretion pathway protein F  41.42 
 
 		 405 aa  329  6e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899692  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3242  general secretion pathway protein F  41.42 
 
 		 405 aa  329  7e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1071  general secretion pathway protein F  42.01 
 
 		 405 aa  323  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3116  general secretory pathway F transmembrane protein  41.77 
 
 		 403 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0256  general secretion pathway protein F  46.91 
 
 		 400 aa  313  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3054  general secretion pathway protein F  42.26 
 
 		 403 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3401  general secretion pathway protein F  42.82 
 
 		 403 aa  312  7.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.54461 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3231  general secretion pathway protein F  42.61 
 
 		 405 aa  310  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0101612  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3394  general secretion pathway protein F  41.71 
 
 		 405 aa  309  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2209  general secretion pathway protein F  40.29 
 
 		 399 aa  301  9e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0252  general secretion pathway protein F  39.71 
 
 		 404 aa  300  2e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55430  putative type II secretion system protein  42.51 
 
 		 404 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000716105  normal  0.0429131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4823  putative type II secretion system protein  42.51 
 
 		 404 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0274243  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3173  general secretion pathway protein F  42.01 
 
 		 403 aa  299  7e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131882  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3138  general secretory pathway protein F  39.12 
 
 		 404 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000899303 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3267  general secretion pathway protein F  37.65 
 
 		 400 aa  286  5e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000471586  hitchhiker  0.0000000000000079941 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0955  general secretion pathway protein F  37.41 
 
 		 400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.110988  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1006  type II secretion system protein  37.41 
 
 		 400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5703  general secretion pathway protein F  37.75 
 
 		 408 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0555477  normal  0.0587373 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3429  general secretion pathway protein F  38.24 
 
 		 405 aa  276  5e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239637 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  38.42 
 
 		 409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3366  general secretion pathway protein F  38.48 
 
 		 403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0261754 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1071  general secretion pathway protein F  36.74 
 
 		 411 aa  273  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1904  general secretion pathway protein F  39.07 
 
 		 401 aa  269  7e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4178  general secretion pathway protein F  37.9 
 
 		 400 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1279  general secretion pathway protein F  37.99 
 
 		 403 aa  266  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1045  general secretion pathway protein F  38.77 
 
 		 400 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1631  general secretion pathway protein F  37.71 
 
 		 412 aa  264  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0607  general secretion pathway protein F  37.35 
 
 		 400 aa  263  4e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000348524 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0754  general secretion pathway protein F  35.85 
 
 		 412 aa  262  8e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0663  general secretion pathway protein F  38.14 
 
 		 409 aa  260  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>