More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1414 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1414  general secretion pathway protein F  100 
 
 
405 aa  786    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0648646  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2031  general secretion pathway protein F  63.7 
 
 
405 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24010  general secretion pathway protein F  63.7 
 
 
405 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2924  general secretion pathway protein F  63.64 
 
 
405 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646431  normal  0.200315 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1350  general secretion pathway protein F  54.68 
 
 
403 aa  411  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  52.71 
 
 
404 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  47.54 
 
 
407 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0233  general secretion pathway protein F  46.91 
 
 
406 aa  368  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3617  general secretion pathway protein F  47.41 
 
 
406 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  47.54 
 
 
407 aa  365  1e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2392  general secretion pathway protein F  49.39 
 
 
404 aa  362  6e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000517266 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1301  general secretion pathway protein F  49.51 
 
 
408 aa  360  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4356  general secretion pathway protein F  47.67 
 
 
407 aa  359  4e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0158  general secretion pathway protein F  47.04 
 
 
407 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0153  general secretion pathway protein F  47.04 
 
 
407 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03958  general secretion pathway protein F  48.04 
 
 
408 aa  357  2.9999999999999997e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  45.57 
 
 
407 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  45.43 
 
 
406 aa  355  5.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2858  general secretion pathway protein F  50.12 
 
 
408 aa  355  6.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  45.32 
 
 
407 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  45.32 
 
 
407 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  45.32 
 
 
407 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  45.32 
 
 
407 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0171  general secretion pathway protein F  46.91 
 
 
407 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2371  general secretion pathway protein F  50.85 
 
 
410 aa  351  1e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0153  general secretion pathway protein F  46.31 
 
 
407 aa  351  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2922  general secretion pathway protein F  44.31 
 
 
405 aa  351  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4589  general secretion pathway protein F  45.5 
 
 
413 aa  349  6e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0123  general secretion pathway protein F  46.32 
 
 
407 aa  347  2e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0168  general secretion pathway protein F  47.04 
 
 
407 aa  344  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0107  general secretion pathway protein F  45.12 
 
 
410 aa  343  4e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00603  general secretion pathway protein F  41.73 
 
 
406 aa  340  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1414  general secretion pathway protein F  50.61 
 
 
408 aa  341  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1472  general secretion pathway protein F  49.27 
 
 
408 aa  339  5e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.655662  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0143  general secretion pathway protein F  48.52 
 
 
407 aa  334  2e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0005  general secretion pathway protein F  46.99 
 
 
407 aa  333  4e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.138499 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001890  general secretion pathway protein F  43.35 
 
 
405 aa  332  5e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3116  general secretory pathway F transmembrane protein  47.03 
 
 
403 aa  327  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205783  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3401  general secretion pathway protein F  46.29 
 
 
403 aa  325  6e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.54461 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0099  general secretion pathway protein F  44.08 
 
 
396 aa  324  2e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3072  general secretion pathway protein F  44.36 
 
 
405 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000734436 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3054  general secretion pathway protein F  46.29 
 
 
403 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3242  general secretion pathway protein F  44.61 
 
 
405 aa  322  7e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0060  general secretion pathway protein F  44.61 
 
 
405 aa  322  7e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1317  type II secretory pathway protein LspF  42.72 
 
 
399 aa  322  8e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  44.85 
 
 
405 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3394  general secretion pathway protein F  44.31 
 
 
405 aa  322  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955056  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0050  general secretion pathway protein F  44.36 
 
 
405 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899692  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02836  hypothetical type II secretion protein GspF  46.7 
 
 
407 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000156909  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0010  general secretion pathway protein F  44.36 
 
 
405 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02786  hypothetical protein  46.7 
 
 
407 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000209561  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0060  general secretion pathway protein F  44.36 
 
 
405 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211909  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0079  general secretion pathway protein F  44.36 
 
 
405 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1314  type II secretory pathway protein LspF  42.47 
 
 
399 aa  320  3e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3425  general secretion pathway protein F  45.97 
 
 
407 aa  320  3e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3245  general secretion pathway protein GspF  46.7 
 
 
407 aa  319  5e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.750263 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  44.12 
 
 
405 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  44.12 
 
 
405 aa  319  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  44.12 
 
 
405 aa  319  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  44.12 
 
 
405 aa  319  6e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  44.12 
 
 
405 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  44.12 
 
 
405 aa  319  6e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  44.12 
 
 
405 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  44.36 
 
 
405 aa  319  6e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3410  general secretion pathway protein GspF  45.72 
 
 
407 aa  317  3e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  43.63 
 
 
405 aa  316  5e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3136  general secretion pathway protein F  45.97 
 
 
407 aa  315  7e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3231  general secretion pathway protein F  44.8 
 
 
405 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0101612  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0061  general secretion pathway protein F  43.63 
 
 
405 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1071  general secretion pathway protein F  43.38 
 
 
405 aa  308  9e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4249  general secretion pathway protein F  44.72 
 
 
403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0204352 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0256  general secretion pathway protein F  45.81 
 
 
400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2209  general secretion pathway protein F  44.06 
 
 
399 aa  302  8.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616736  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03178  general secretory pathway component, cryptic  41.44 
 
 
398 aa  297  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0386  general secretion pathway protein F  41.44 
 
 
398 aa  297  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0386  general secretion pathway protein F  41.44 
 
 
398 aa  297  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3521  general secretion pathway protein F  41.44 
 
 
398 aa  297  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03129  hypothetical protein  41.44 
 
 
398 aa  297  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3578  TonB-dependent siderophore receptor  41.26 
 
 
411 aa  296  5e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.477901 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3173  general secretion pathway protein F  42.57 
 
 
403 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131882  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55430  putative type II secretion system protein  45.54 
 
 
404 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000716105  normal  0.0429131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4823  putative type II secretion system protein  45.68 
 
 
404 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0274243  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1904  general secretion pathway protein F  44.33 
 
 
401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1331  general secretion pathway protein F  41.4 
 
 
410 aa  275  8e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.466659  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3267  general secretion pathway protein F  36.63 
 
 
400 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000471586  hitchhiker  0.0000000000000079941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0754  general secretion pathway protein F  40.24 
 
 
412 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0955  general secretion pathway protein F  36.14 
 
 
400 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.110988  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1006  type II secretion system protein  36.39 
 
 
400 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3429  general secretion pathway protein F  41.98 
 
 
405 aa  267  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239637 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1071  general secretion pathway protein F  39.71 
 
 
411 aa  266  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3138  general secretory pathway protein F  41.09 
 
 
404 aa  259  4e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000899303 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0252  general secretion pathway protein F  36.21 
 
 
404 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0544  general secretion pathway protein F  40.15 
 
 
411 aa  259  8e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5703  general secretion pathway protein F  39.27 
 
 
408 aa  258  9e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0555477  normal  0.0587373 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0663  general secretion pathway protein F  41.26 
 
 
409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0642  general secretion pathway protein F  41.26 
 
 
409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1279  general secretion pathway protein F  38.86 
 
 
403 aa  249  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2531  general secretion pathway protein F  44.99 
 
 
410 aa  247  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356657  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1631  general secretion pathway protein F  38.05 
 
 
412 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4178  general secretion pathway protein F  41.19 
 
 
400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363514  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>