More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0252 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0252  general secretion pathway protein F  100 
 
 		 404 aa  823    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2371  general secretion pathway protein F  42.68 
 
 		 410 aa  311  1e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2392  general secretion pathway protein F  39.95 
 
 		 404 aa  308  9e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000517266 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4589  general secretion pathway protein F  39.32 
 
 		 413 aa  306  5.0000000000000004e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0143  general secretion pathway protein F  42.61 
 
 		 407 aa  302  6.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  39.45 
 
 		 404 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  37.84 
 
 		 407 aa  295  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  38.02 
 
 		 406 aa  293  5e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4356  general secretion pathway protein F  38.18 
 
 		 407 aa  291  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3617  general secretion pathway protein F  37.78 
 
 		 406 aa  290  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  36.7 
 
 		 407 aa  287  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0107  general secretion pathway protein F  37.16 
 
 		 410 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  39.51 
 
 		 405 aa  286  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0123  general secretion pathway protein F  37.68 
 
 		 407 aa  286  5e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0233  general secretion pathway protein F  37.44 
 
 		 406 aa  286  5e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  39.51 
 
 		 405 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  39.51 
 
 		 405 aa  286  7e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  39.51 
 
 		 405 aa  286  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  39.51 
 
 		 405 aa  286  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  39.51 
 
 		 405 aa  286  7e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  39.51 
 
 		 405 aa  286  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  39.51 
 
 		 405 aa  286  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24010  general secretion pathway protein F  38.92 
 
 		 405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2031  general secretion pathway protein F  38.92 
 
 		 405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2922  general secretion pathway protein F  36.45 
 
 		 405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  34.81 
 
 		 407 aa  280  4e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1350  general secretion pathway protein F  37.59 
 
 		 403 aa  279  8e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  37.87 
 
 		 405 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03958  general secretion pathway protein F  39.07 
 
 		 408 aa  277  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  34.32 
 
 		 407 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  34.32 
 
 		 407 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  34.32 
 
 		 407 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  34.32 
 
 		 407 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3242  general secretion pathway protein F  38.77 
 
 		 405 aa  276  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1301  general secretion pathway protein F  36.03 
 
 		 408 aa  276  6e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0061  general secretion pathway protein F  38.52 
 
 		 405 aa  276  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0060  general secretion pathway protein F  38.27 
 
 		 405 aa  274  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00603  general secretion pathway protein F  35.78 
 
 		 406 aa  273  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  37.38 
 
 		 405 aa  274  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0050  general secretion pathway protein F  38.27 
 
 		 405 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899692  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3366  general secretion pathway protein F  37.62 
 
 		 403 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0261754 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0079  general secretion pathway protein F  38.27 
 
 		 405 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0010  general secretion pathway protein F  38.27 
 
 		 405 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0060  general secretion pathway protein F  38.27 
 
 		 405 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211909  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1314  type II secretory pathway protein LspF  37.13 
 
 		 399 aa  272  6e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2858  general secretion pathway protein F  37.59 
 
 		 408 aa  272  8.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1317  type II secretory pathway protein LspF  37.13 
 
 		 399 aa  272  9e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3072  general secretion pathway protein F  37.62 
 
 		 405 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000734436 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0153  general secretion pathway protein F  36.12 
 
 		 407 aa  271  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0171  general secretion pathway protein F  35.87 
 
 		 407 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0158  general secretion pathway protein F  35.96 
 
 		 407 aa  270  5e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0153  general secretion pathway protein F  35.96 
 
 		 407 aa  270  5e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55430  putative type II secretion system protein  36.39 
 
 		 404 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000716105  normal  0.0429131 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2209  general secretion pathway protein F  36.88 
 
 		 399 aa  263  3e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001890  general secretion pathway protein F  36.14 
 
 		 405 aa  262  6.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1414  general secretion pathway protein F  37.1 
 
 		 408 aa  262  8.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0168  general secretion pathway protein F  35.31 
 
 		 407 aa  260  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0256  general secretion pathway protein F  40.25 
 
 		 400 aa  260  4e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0099  general secretion pathway protein F  35.29 
 
 		 396 aa  259  5.0000000000000005e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1472  general secretion pathway protein F  36.61 
 
 		 408 aa  258  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.655662  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4823  putative type II secretion system protein  35.4 
 
 		 404 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0274243  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1071  general secretion pathway protein F  37.07 
 
 		 405 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3116  general secretory pathway F transmembrane protein  38.63 
 
 		 403 aa  251  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  35.7 
 
 		 409 aa  251  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1414  general secretion pathway protein F  36.21 
 
 		 405 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0648646  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2924  general secretion pathway protein F  38.92 
 
 		 405 aa  247  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646431  normal  0.200315 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3173  general secretion pathway protein F  33.98 
 
 		 403 aa  246  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131882  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3394  general secretion pathway protein F  37.04 
 
 		 405 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0005  general secretion pathway protein F  35.71 
 
 		 407 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.138499 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5703  general secretion pathway protein F  34.95 
 
 		 408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0555477  normal  0.0587373 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  34.22 
 
 		 409 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3401  general secretion pathway protein F  37.68 
 
 		 403 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.54461 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3054  general secretion pathway protein F  37.65 
 
 		 403 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3231  general secretion pathway protein F  37.38 
 
 		 405 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0101612  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3578  TonB-dependent siderophore receptor  35.12 
 
 		 411 aa  240  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.477901 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3138  general secretory pathway protein F  35.05 
 
 		 404 aa  240  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000899303 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1279  general secretion pathway protein F  33.75 
 
 		 403 aa  239  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0327  general secretion pathway protein F  35.89 
 
 		 403 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1331  general secretion pathway protein F  33.41 
 
 		 410 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.466659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4178  general secretion pathway protein F  36.05 
 
 		 400 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3429  general secretion pathway protein F  34.32 
 
 		 405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239637 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1071  general secretion pathway protein F  33.41 
 
 		 411 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  34.5 
 
 		 401 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3136  general secretion pathway protein F  33 
 
 		 407 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0544  general secretion pathway protein F  33.49 
 
 		 411 aa  232  9e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  34.16 
 
 		 406 aa  232  9e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4249  general secretion pathway protein F  33.09 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0204352 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0681  general secretion pathway protein F  34.24 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0754  general secretion pathway protein F  34.06 
 
 		 412 aa  230  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0769832 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03178  general secretory pathway component, cryptic  32.11 
 
 		 398 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0386  general secretion pathway protein F  32.11 
 
 		 398 aa  229  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03129  hypothetical protein  32.11 
 
 		 398 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0386  general secretion pathway protein F  32.11 
 
 		 398 aa  229  5e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3521  general secretion pathway protein F  32.11 
 
 		 398 aa  229  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0593  general secretion pathway protein F  33.58 
 
 		 400 aa  229  8e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1631  general secretion pathway protein F  35.21 
 
 		 412 aa  229  9e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0425  type II secretion system protein  32.67 
 
 		 406 aa  229  9e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126236  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0607  general secretion pathway protein F  34.07 
 
 		 400 aa  229  9e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000348524 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  32 
 
 		 406 aa  227  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  32.94 
 
 		 422 aa  226  7e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>