More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0425 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0425  type II secretion system protein  100 
 
 		 406 aa  818    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126236  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  38 
 
 		 405 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  37.31 
 
 		 417 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  36.63 
 
 		 405 aa  271  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  34.61 
 
 		 401 aa  272  1e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  36.8 
 
 		 417 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  37.28 
 
 		 406 aa  269  5e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  36.75 
 
 		 405 aa  268  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  36.55 
 
 		 417 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  35.59 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  37.53 
 
 		 407 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  37.5 
 
 		 406 aa  258  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  35.25 
 
 		 405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  34.66 
 
 		 408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  36.87 
 
 		 419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  33.33 
 
 		 403 aa  251  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  34.9 
 
 		 405 aa  251  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  35.38 
 
 		 409 aa  250  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  33.67 
 
 		 401 aa  249  8e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  37.84 
 
 		 409 aa  248  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  34.75 
 
 		 409 aa  245  9e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  33.5 
 
 		 405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  30.65 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  34.5 
 
 		 403 aa  243  6e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  34 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  35.07 
 
 		 422 aa  240  4e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  33.67 
 
 		 405 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  34.5 
 
 		 403 aa  239  5e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  34.07 
 
 		 405 aa  239  5e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  35.31 
 
 		 402 aa  238  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  33.58 
 
 		 406 aa  237  3e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  33.33 
 
 		 406 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  35.5 
 
 		 417 aa  236  5.0000000000000005e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  33.75 
 
 		 401 aa  235  8e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  32.83 
 
 		 404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  34.5 
 
 		 402 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  33.67 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  32.41 
 
 		 405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  33.83 
 
 		 424 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  33.74 
 
 		 410 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  32.84 
 
 		 420 aa  233  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  31.91 
 
 		 405 aa  232  9e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  32.23 
 
 		 419 aa  231  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  34.4 
 
 		 416 aa  232  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  34.92 
 
 		 408 aa  232  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  33.58 
 
 		 407 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  34.57 
 
 		 406 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  31.83 
 
 		 402 aa  230  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  32.75 
 
 		 421 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  31.66 
 
 		 405 aa  230  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  31.59 
 
 		 408 aa  229  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  33.58 
 
 		 407 aa  229  8e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0252  general secretion pathway protein F  32.67 
 
 		 404 aa  229  9e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  32.92 
 
 		 422 aa  228  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  34.33 
 
 		 406 aa  228  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  32.84 
 
 		 405 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  34.88 
 
 		 409 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  32.34 
 
 		 411 aa  226  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  33.08 
 
 		 405 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  31.41 
 
 		 405 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  34.65 
 
 		 409 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0952  type II secretion system protein  33.92 
 
 		 402 aa  226  6e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  35.25 
 
 		 404 aa  226  6e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  32.66 
 
 		 403 aa  225  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  32.91 
 
 		 408 aa  225  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  32.5 
 
 		 412 aa  225  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  31.91 
 
 		 405 aa  225  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  31.67 
 
 		 408 aa  225  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  33.5 
 
 		 417 aa  224  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  30.69 
 
 		 463 aa  224  3e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  31.33 
 
 		 406 aa  223  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  32.07 
 
 		 403 aa  224  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3343  type II secretion system protein  31.66 
 
 		 405 aa  224  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000142203  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  32.83 
 
 		 422 aa  224  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  30.69 
 
 		 463 aa  223  4e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0681  type II secretion system protein  35.15 
 
 		 407 aa  223  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.524718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  35.5 
 
 		 403 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  31.66 
 
 		 405 aa  223  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  33.5 
 
 		 423 aa  223  7e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  33.75 
 
 		 405 aa  222  7e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  33.75 
 
 		 405 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  33.5 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  33.5 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  33.5 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  33.5 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0753  type II secretory pathway component PulF  33.42 
 
 		 407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  33.5 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  32.77 
 
 		 409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  33.5 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  32.92 
 
 		 401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  32.67 
 
 		 407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  32 
 
 		 406 aa  220  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  31.42 
 
 		 420 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  31.42 
 
 		 424 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  31.31 
 
 		 407 aa  220  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  32.16 
 
 		 405 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  31.91 
 
 		 406 aa  219  6e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  31.68 
 
 		 408 aa  219  6e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  32.43 
 
 		 409 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  32.67 
 
 		 419 aa  219  6e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>