More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0952 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0952  type II secretion system protein  100 
 
 
402 aa  803    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  53.88 
 
 
401 aa  461  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3255  type II secretion system protein  52.87 
 
 
403 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  41.04 
 
 
417 aa  303  3.0000000000000004e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  36.41 
 
 
405 aa  293  4e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  38.94 
 
 
411 aa  286  4e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  39.95 
 
 
409 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  36.2 
 
 
417 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  38.75 
 
 
410 aa  283  4.0000000000000003e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  35.05 
 
 
406 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  38.32 
 
 
402 aa  281  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  35.7 
 
 
417 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  34.66 
 
 
405 aa  281  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  40.45 
 
 
409 aa  280  4e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  35.7 
 
 
417 aa  279  7e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  35.91 
 
 
405 aa  278  9e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  32.49 
 
 
403 aa  278  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  36.55 
 
 
419 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  37.94 
 
 
401 aa  277  3e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  37.13 
 
 
405 aa  276  4e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  39.5 
 
 
417 aa  275  9e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  34.75 
 
 
404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  40.81 
 
 
403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  36.16 
 
 
405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  37.44 
 
 
404 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  37.12 
 
 
401 aa  271  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  35.35 
 
 
407 aa  271  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  36.59 
 
 
401 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  36.66 
 
 
416 aa  267  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  35.07 
 
 
407 aa  267  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  34.77 
 
 
405 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  37.91 
 
 
409 aa  266  7e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  36.04 
 
 
402 aa  265  8e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  36.25 
 
 
403 aa  265  8.999999999999999e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  34.26 
 
 
405 aa  264  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  35.62 
 
 
403 aa  262  6e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  37.06 
 
 
408 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  34.94 
 
 
407 aa  261  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  37.06 
 
 
409 aa  261  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  35.48 
 
 
405 aa  260  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  36.29 
 
 
409 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  35.19 
 
 
409 aa  259  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  33.67 
 
 
406 aa  259  7e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  36.48 
 
 
406 aa  259  8e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  36.8 
 
 
408 aa  258  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3086  type II secretion system protein  41.88 
 
 
439 aa  257  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  33.08 
 
 
406 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  35.28 
 
 
424 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  35.92 
 
 
407 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  33.25 
 
 
407 aa  254  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  34.01 
 
 
408 aa  253  5.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  35.98 
 
 
409 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  36.02 
 
 
406 aa  253  5.000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  35.68 
 
 
433 aa  253  6e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  34.52 
 
 
405 aa  253  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  36.41 
 
 
408 aa  252  7e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  33.92 
 
 
405 aa  251  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1409  type II secretion system protein  34.41 
 
 
405 aa  251  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205741  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  36.2 
 
 
403 aa  251  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  36.52 
 
 
417 aa  251  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  34.94 
 
 
405 aa  250  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  33.25 
 
 
421 aa  249  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  34.66 
 
 
422 aa  249  5e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  34.17 
 
 
405 aa  249  6e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  33.17 
 
 
404 aa  248  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  34.18 
 
 
405 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  31.55 
 
 
419 aa  248  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  36.39 
 
 
404 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  34.01 
 
 
405 aa  248  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  33.5 
 
 
406 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  36.69 
 
 
404 aa  245  9e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  36.69 
 
 
404 aa  245  9e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  34.18 
 
 
463 aa  245  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  34.01 
 
 
421 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  34.18 
 
 
463 aa  245  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  34.74 
 
 
410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  36.52 
 
 
404 aa  243  5e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  33.67 
 
 
405 aa  243  5e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0533  type II secretion system protein  33.08 
 
 
402 aa  243  5e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  33.67 
 
 
405 aa  242  7e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2185  Type II secretion system F domain protein  36.36 
 
 
403 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.170941  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  32.75 
 
 
406 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  35.66 
 
 
409 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  33.59 
 
 
412 aa  241  2e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  32.74 
 
 
424 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  32.74 
 
 
420 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  34.01 
 
 
405 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0425  type II secretion system protein  33.92 
 
 
406 aa  239  5e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126236  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  32.24 
 
 
406 aa  239  5e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  35.43 
 
 
405 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0150  type II secretion system protein  33.08 
 
 
410 aa  238  1e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2894  general secretion pathway protein F  33.42 
 
 
410 aa  238  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196755  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  33.67 
 
 
406 aa  236  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  33.42 
 
 
406 aa  236  7e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1169  type II secretion system protein  35.95 
 
 
400 aa  236  7e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  31.16 
 
 
405 aa  235  9e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0719  general secretion pathway protein F  35.66 
 
 
409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.975907  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0718  general secretion pathway protein F  35.66 
 
 
409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0681  type II secretion system protein  35.88 
 
 
407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.524718  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  32.75 
 
 
419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>