More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2412 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  100 
 
 		 405 aa  818    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  42.12 
 
 		 403 aa  350  4e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  39.95 
 
 		 401 aa  319  6e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  39.45 
 
 		 404 aa  311  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  37.87 
 
 		 417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  37.1 
 
 		 401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  38.06 
 
 		 402 aa  306  6e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  38.27 
 
 		 417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  37.96 
 
 		 405 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  37.16 
 
 		 406 aa  298  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  37.96 
 
 		 405 aa  296  3e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  36.56 
 
 		 405 aa  296  5e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  37.32 
 
 		 405 aa  293  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  34.74 
 
 		 401 aa  293  3e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  35.56 
 
 		 411 aa  292  9e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  38.37 
 
 		 409 aa  291  1e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  36.17 
 
 		 404 aa  289  6e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  37.5 
 
 		 405 aa  288  9e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  36.39 
 
 		 409 aa  281  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  36.93 
 
 		 417 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  37.41 
 
 		 407 aa  280  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  36.84 
 
 		 401 aa  280  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  36.68 
 
 		 417 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  36.43 
 
 		 417 aa  275  9e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  37.97 
 
 		 403 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  33.66 
 
 		 403 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  37.1 
 
 		 410 aa  273  6e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  34.07 
 
 		 405 aa  272  7e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  34.98 
 
 		 408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  36.97 
 
 		 401 aa  270  4e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  37.81 
 
 		 403 aa  269  5e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  34.68 
 
 		 401 aa  269  7e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  35.63 
 
 		 416 aa  268  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  33.67 
 
 		 404 aa  265  8e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  35.26 
 
 		 419 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  32.92 
 
 		 406 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  33.58 
 
 		 410 aa  260  3e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  34 
 
 		 406 aa  259  4e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  34.47 
 
 		 403 aa  259  7e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  34.16 
 
 		 404 aa  259  9e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  34.16 
 
 		 404 aa  259  9e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  38.64 
 
 		 403 aa  258  9e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  34.26 
 
 		 405 aa  256  4e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  34.26 
 
 		 405 aa  256  5e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  33.42 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  32.07 
 
 		 407 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  32.1 
 
 		 463 aa  251  2e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  32.1 
 
 		 463 aa  250  3e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  32.67 
 
 		 409 aa  249  9e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  30.73 
 
 		 406 aa  248  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  34.24 
 
 		 406 aa  248  2e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  33.01 
 
 		 407 aa  247  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  33.08 
 
 		 405 aa  246  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  34.16 
 
 		 409 aa  246  6.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  32.75 
 
 		 407 aa  246  6.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  31.83 
 
 		 408 aa  244  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  32.16 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  34.4 
 
 		 401 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  31.54 
 
 		 407 aa  243  6e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  32.58 
 
 		 402 aa  243  6e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 403 aa  242  7e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  32.16 
 
 		 419 aa  242  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  32.83 
 
 		 405 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  33 
 
 		 408 aa  240  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  33 
 
 		 405 aa  240  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  32.51 
 
 		 433 aa  239  5e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  32.32 
 
 		 408 aa  239  5e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  33 
 
 		 412 aa  239  6.999999999999999e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  33.01 
 
 		 406 aa  239  6.999999999999999e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0533  type II secretion system protein  32.59 
 
 		 402 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0952  type II secretion system protein  33.92 
 
 		 402 aa  238  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  32.42 
 
 		 405 aa  238  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  32.61 
 
 		 419 aa  236  8e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2707  type II secretion system protein  32.43 
 
 		 401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  29.47 
 
 		 421 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  30.2 
 
 		 408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1409  type II secretion system protein  32.43 
 
 		 405 aa  234  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205741  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  30.73 
 
 		 403 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  31.66 
 
 		 409 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1997  Type II secretion system F domain protein  31.46 
 
 		 407 aa  233  5e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.76 
 
 		 402 aa  233  5e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  34.91 
 
 		 422 aa  233  5e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3255  type II secretion system protein  34.5 
 
 		 403 aa  233  6e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  30.92 
 
 		 409 aa  233  6e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  30.98 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2903  type II secretion system protein  33 
 
 		 405 aa  230  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  31.51 
 
 		 422 aa  230  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  31.66 
 
 		 405 aa  229  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2894  general secretion pathway protein F  29.34 
 
 		 410 aa  228  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196755  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  32.35 
 
 		 421 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.4 
 
 		 405 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  31.51 
 
 		 421 aa  227  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  33.53 
 
 		 404 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3554  type II secretion system protein  29.64 
 
 		 401 aa  226  7e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  28.86 
 
 		 424 aa  225  8e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  30.98 
 
 		 405 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  31.27 
 
 		 424 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3086  type II secretion system protein  37.46 
 
 		 439 aa  225  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  28.86 
 
 		 420 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  31.33 
 
 		 420 aa  225  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>