More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0681 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0681  type II secretion system protein  100 
 
 		 407 aa  826    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.524718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  47.83 
 
 		 405 aa  345  1e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  43.8 
 
 		 404 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  45.22 
 
 		 406 aa  336  5e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  46.09 
 
 		 405 aa  331  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  46.02 
 
 		 405 aa  321  9.999999999999999e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  46.82 
 
 		 407 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  44.8 
 
 		 405 aa  317  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  45.09 
 
 		 405 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  43.19 
 
 		 405 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  39.84 
 
 		 409 aa  295  7e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  39.79 
 
 		 405 aa  294  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  40.11 
 
 		 401 aa  294  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  39.52 
 
 		 405 aa  293  5e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  39.73 
 
 		 405 aa  288  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  39.23 
 
 		 417 aa  288  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  38.4 
 
 		 404 aa  287  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  42.98 
 
 		 410 aa  287  2.9999999999999996e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  39.64 
 
 		 419 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  40.97 
 
 		 411 aa  286  4e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  40.11 
 
 		 405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  39.68 
 
 		 417 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  41.26 
 
 		 416 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  40.29 
 
 		 403 aa  282  8.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  39.52 
 
 		 417 aa  282  9e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  39.59 
 
 		 406 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  39.04 
 
 		 408 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  42.4 
 
 		 403 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  39.41 
 
 		 417 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  37.92 
 
 		 408 aa  279  6e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  40.52 
 
 		 405 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  42.03 
 
 		 408 aa  278  1e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  39.78 
 
 		 407 aa  277  2e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  42.3 
 
 		 404 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  36.64 
 
 		 408 aa  276  4e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  38.76 
 
 		 424 aa  276  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  42.48 
 
 		 417 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  39.66 
 
 		 405 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  35.96 
 
 		 402 aa  273  6e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  41.54 
 
 		 406 aa  273  6e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  38.74 
 
 		 407 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  39.48 
 
 		 409 aa  271  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  40.24 
 
 		 405 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  42.98 
 
 		 409 aa  271  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  40.3 
 
 		 401 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  38.17 
 
 		 421 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  39 
 
 		 405 aa  269  5e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  41.76 
 
 		 406 aa  269  7e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  35.83 
 
 		 421 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  36.11 
 
 		 424 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  39 
 
 		 410 aa  267  2.9999999999999995e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  36.11 
 
 		 420 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  42.73 
 
 		 403 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  39.66 
 
 		 405 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  38.48 
 
 		 417 aa  265  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  40.24 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  38.53 
 
 		 407 aa  264  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  40.24 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  37.37 
 
 		 405 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58760  type 4 fimbrial biogenesis protein pilC  39.64 
 
 		 373 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.95906  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  41.1 
 
 		 401 aa  263  4e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  38.24 
 
 		 419 aa  263  4e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  37.43 
 
 		 405 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  38.42 
 
 		 419 aa  262  8.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  37.57 
 
 		 406 aa  260  3e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  38.44 
 
 		 404 aa  259  6e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  35.29 
 
 		 407 aa  259  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  39.02 
 
 		 409 aa  259  8e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2903  type II secretion system protein  37.97 
 
 		 405 aa  258  9e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2682  type II secretion system protein  38.08 
 
 		 406 aa  257  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0414992  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  35.14 
 
 		 419 aa  256  7e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  35.99 
 
 		 463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  38.23 
 
 		 422 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  35.36 
 
 		 419 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  35.36 
 
 		 409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  35.71 
 
 		 463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  35.31 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  41 
 
 		 422 aa  253  4.0000000000000004e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  35.55 
 
 		 422 aa  250  3e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  35.9 
 
 		 401 aa  249  5e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  34.79 
 
 		 423 aa  249  6e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  35.73 
 
 		 403 aa  249  7e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  35.46 
 
 		 423 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  39.52 
 
 		 402 aa  249  9e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  35.33 
 
 		 408 aa  248  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  36.99 
 
 		 409 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  37.09 
 
 		 406 aa  248  2e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  34.92 
 
 		 401 aa  247  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0972  type IV pilus biogenesis protein PilC  37.95 
 
 		 419 aa  247  3e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.910627  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1087  type II secretion system protein  37.95 
 
 		 419 aa  247  3e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0774  type II secretion system protein  39.94 
 
 		 405 aa  246  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  35.66 
 
 		 406 aa  246  6e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  35.14 
 
 		 422 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  35.66 
 
 		 406 aa  245  9e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0424  type II secretion system protein  34.72 
 
 		 421 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440885 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  33.93 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  34.55 
 
 		 420 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  38.69 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2185  Type II secretion system F domain protein  39.34 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.170941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  36.15 
 
 		 421 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>