More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1723 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 
409 aa  805    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  38.13 
 
 
403 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  44.78 
 
 
417 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  39.15 
 
 
402 aa  305  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  39.26 
 
 
406 aa  288  9e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  40.15 
 
 
433 aa  288  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  35.32 
 
 
404 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  35.98 
 
 
404 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  35.98 
 
 
404 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  37.13 
 
 
409 aa  279  8e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  37.34 
 
 
408 aa  277  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  36.97 
 
 
407 aa  274  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  37.41 
 
 
408 aa  273  3e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  36.32 
 
 
401 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  36.46 
 
 
405 aa  271  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2707  type II secretion system protein  35.16 
 
 
401 aa  270  5e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  36.91 
 
 
401 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  35.95 
 
 
405 aa  268  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  37.38 
 
 
407 aa  268  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  37.22 
 
 
405 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  34.74 
 
 
401 aa  268  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  35.57 
 
 
407 aa  266  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  36.57 
 
 
407 aa  266  4e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  35.7 
 
 
407 aa  266  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  33.58 
 
 
406 aa  266  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  37.71 
 
 
406 aa  266  7e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  35.31 
 
 
405 aa  265  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  33 
 
 
405 aa  264  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  34.94 
 
 
405 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  33.99 
 
 
404 aa  262  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  36.62 
 
 
403 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  34.01 
 
 
405 aa  262  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  37.06 
 
 
403 aa  261  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  34.75 
 
 
409 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  33.83 
 
 
408 aa  260  3e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  36.29 
 
 
401 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  31.59 
 
 
405 aa  260  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  34.23 
 
 
405 aa  259  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  33.09 
 
 
405 aa  259  6e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  36.11 
 
 
405 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  32.01 
 
 
417 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  35.91 
 
 
408 aa  258  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  35.25 
 
 
404 aa  257  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  36.46 
 
 
405 aa  256  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3270  general secretory pathway protein F  36.5 
 
 
406 aa  256  4e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  34.16 
 
 
405 aa  256  5e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  35.22 
 
 
406 aa  256  6e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  36.5 
 
 
417 aa  256  6e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  35.64 
 
 
406 aa  255  9e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  31.76 
 
 
417 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1409  type II secretion system protein  34.17 
 
 
405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205741  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  35.7 
 
 
408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  34.5 
 
 
405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0952  type II secretion system protein  36.29 
 
 
402 aa  254  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  31.76 
 
 
417 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  36.11 
 
 
411 aa  254  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  31.9 
 
 
406 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  35.43 
 
 
403 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  37.31 
 
 
401 aa  253  6e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  33 
 
 
409 aa  252  7e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  34.94 
 
 
409 aa  252  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2101  type II secretion system protein  35.25 
 
 
404 aa  252  9.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  36.05 
 
 
409 aa  251  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  32.75 
 
 
406 aa  252  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  33.16 
 
 
408 aa  251  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  34.49 
 
 
408 aa  250  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  34.38 
 
 
416 aa  251  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  33.33 
 
 
407 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  34.91 
 
 
410 aa  250  3e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3343  type II secretion system protein  31.16 
 
 
405 aa  250  4e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000142203  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  34.18 
 
 
421 aa  250  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  34.6 
 
 
417 aa  249  5e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3255  type II secretion system protein  34.86 
 
 
403 aa  249  5e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  33.42 
 
 
421 aa  249  6e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  35.26 
 
 
419 aa  249  7e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  31.9 
 
 
406 aa  249  9e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  33.42 
 
 
405 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  33.92 
 
 
407 aa  248  1e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  37.94 
 
 
403 aa  248  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  32.19 
 
 
404 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  31.65 
 
 
406 aa  247  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  33.75 
 
 
406 aa  247  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1745  type II secretion system protein  37.35 
 
 
377 aa  247  3e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41063  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  31.22 
 
 
404 aa  247  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  33.67 
 
 
419 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2824  MSHA biogenesis protein MshG  34.33 
 
 
407 aa  246  6.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  33.33 
 
 
406 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1139  MSHA biogenesis protein MshG  33.5 
 
 
406 aa  245  9e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  34.68 
 
 
423 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  34.4 
 
 
405 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  32 
 
 
401 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  34.67 
 
 
422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  34.92 
 
 
403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1997  Type II secretion system F domain protein  34.72 
 
 
407 aa  243  6e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00255  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshG (pilus type IV)  32.44 
 
 
411 aa  242  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  33 
 
 
402 aa  241  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  34.85 
 
 
422 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0302  Type II secretion system F domain protein  36.3 
 
 
412 aa  241  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0548  type II secretion system protein  32.66 
 
 
406 aa  241  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00110848  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  34.24 
 
 
423 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>