More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1169 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1169  type II secretion system protein  100 
 
 		 400 aa  801    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  38.37 
 
 		 408 aa  276  4e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  36.16 
 
 		 406 aa  266  4e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  37.84 
 
 		 405 aa  265  7e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  36.84 
 
 		 405 aa  265  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  35.25 
 
 		 405 aa  263  4e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  36.41 
 
 		 406 aa  262  8.999999999999999e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  36.09 
 
 		 401 aa  261  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  35.47 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  33.5 
 
 		 403 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  33.75 
 
 		 409 aa  252  8.000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  34.6 
 
 		 417 aa  251  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  32.42 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  33.25 
 
 		 406 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  34.58 
 
 		 405 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  33.5 
 
 		 406 aa  249  4e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  32.25 
 
 		 406 aa  249  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  35.96 
 
 		 410 aa  249  9e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  37.5 
 
 		 409 aa  247  3e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  33.75 
 
 		 405 aa  247  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  35.93 
 
 		 401 aa  246  6e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  37.19 
 
 		 409 aa  246  6e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1042  type II secretion system protein  37.44 
 
 		 399 aa  245  9.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  33.58 
 
 		 416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  34.6 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  35.43 
 
 		 403 aa  243  5e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  32.01 
 
 		 405 aa  243  5e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  31.27 
 
 		 406 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  33.17 
 
 		 401 aa  242  7.999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  34.74 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0952  type II secretion system protein  35.95 
 
 		 402 aa  240  4e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  32.07 
 
 		 401 aa  240  4e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  31.44 
 
 		 406 aa  239  5e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  31.68 
 
 		 405 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  35.16 
 
 		 405 aa  239  6.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  33.92 
 
 		 403 aa  238  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  31.82 
 
 		 417 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  32.67 
 
 		 407 aa  238  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  33.25 
 
 		 409 aa  237  3e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0470  type II secretion system protein  33 
 
 		 406 aa  237  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00255  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshG (pilus type IV)  33.83 
 
 		 411 aa  236  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  33.99 
 
 		 406 aa  236  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3831  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 406 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00398408  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  32.5 
 
 		 405 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  34.25 
 
 		 403 aa  236  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  31.57 
 
 		 417 aa  236  7e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  32.66 
 
 		 404 aa  236  7e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  31.57 
 
 		 417 aa  235  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0512  type II secretion system protein  33.09 
 
 		 406 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331644  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4108  MSHA biogenesis protein MshG  33 
 
 		 406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1997  Type II secretion system F domain protein  34.41 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0488  type II secretion system protein  32.67 
 
 		 406 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00834812  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0509  type II secretion system protein  32.67 
 
 		 406 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.013646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  35.41 
 
 		 403 aa  234  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  31.09 
 
 		 404 aa  233  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0564  type II secretion system protein  32.51 
 
 		 406 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  32.49 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0548  type II secretion system protein  31.6 
 
 		 406 aa  229  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00110848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  34.26 
 
 		 401 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  29.24 
 
 		 408 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  31.16 
 
 		 402 aa  227  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3054  general secretion pathway protein F  35.4 
 
 		 403 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3401  general secretion pathway protein F  35.15 
 
 		 403 aa  225  9e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.54461 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  32.66 
 
 		 403 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  32.16 
 
 		 404 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  33.42 
 
 		 401 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3343  type II secretion system protein  30.75 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000142203  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3255  type II secretion system protein  32.41 
 
 		 403 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  31.08 
 
 		 405 aa  223  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  32.75 
 
 		 433 aa  223  4e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1350  general secretion pathway protein F  31.67 
 
 		 403 aa  223  4.9999999999999996e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1139  MSHA biogenesis protein MshG  32.17 
 
 		 406 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2101  type II secretion system protein  32.26 
 
 		 404 aa  221  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  31.14 
 
 		 419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0302  Type II secretion system F domain protein  33.83 
 
 		 412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  30.3 
 
 		 408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  30.6 
 
 		 412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24010  general secretion pathway protein F  31.02 
 
 		 405 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1317  type II secretory pathway protein LspF  31.41 
 
 		 399 aa  219  5e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  30.12 
 
 		 407 aa  219  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  30.27 
 
 		 409 aa  219  6e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  30.52 
 
 		 406 aa  219  6e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3116  general secretory pathway F transmembrane protein  33.67 
 
 		 403 aa  219  7e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  30.47 
 
 		 408 aa  219  8.999999999999998e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  33 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  32.06 
 
 		 421 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2031  general secretion pathway protein F  30.77 
 
 		 405 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1314  type II secretory pathway protein LspF  30.9 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3394  general secretion pathway protein F  33.58 
 
 		 405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  31.66 
 
 		 404 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  31.3 
 
 		 424 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1865  type II secretion system protein  31.09 
 
 		 402 aa  216  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.334713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  31.3 
 
 		 420 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3231  general secretion pathway protein F  33.33 
 
 		 405 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0101612  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  30.53 
 
 		 421 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2922  general secretion pathway protein F  29.28 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  33.59 
 
 		 401 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  32.67 
 
 		 407 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  29.66 
 
 		 409 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  30.94 
 
 		 409 aa  212  9e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>