More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1036 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  100 
 
 		 401 aa  799    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3255  type II secretion system protein  60.15 
 
 		 403 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0952  type II secretion system protein  53.88 
 
 		 402 aa  444  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  38.67 
 
 		 405 aa  306  5.0000000000000004e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  37.13 
 
 		 405 aa  298  9e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  41.25 
 
 		 417 aa  296  5e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  36.92 
 
 		 406 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  35.59 
 
 		 419 aa  289  8e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  36.43 
 
 		 417 aa  288  8e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  37.75 
 
 		 405 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  38.75 
 
 		 409 aa  286  4e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  35.93 
 
 		 417 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  38.9 
 
 		 410 aa  284  2.0000000000000002e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  37.87 
 
 		 416 aa  282  6.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  41.25 
 
 		 403 aa  283  6.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  36.18 
 
 		 417 aa  282  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  35.96 
 
 		 403 aa  281  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  37.44 
 
 		 405 aa  281  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  37.04 
 
 		 405 aa  280  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  36.16 
 
 		 401 aa  281  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  35.73 
 
 		 404 aa  281  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  36.92 
 
 		 407 aa  277  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  37.75 
 
 		 417 aa  276  6e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  38.12 
 
 		 411 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  35.77 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  37.16 
 
 		 409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  39.05 
 
 		 409 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  38.25 
 
 		 401 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  36.34 
 
 		 407 aa  273  5.000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  37.75 
 
 		 403 aa  272  7e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  36.63 
 
 		 405 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  38.4 
 
 		 406 aa  271  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  35.91 
 
 		 406 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  35.9 
 
 		 407 aa  265  8e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  36.11 
 
 		 401 aa  261  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  35.12 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  35.12 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  36.57 
 
 		 408 aa  261  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  36.34 
 
 		 402 aa  259  5.0000000000000005e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  34.61 
 
 		 402 aa  259  6e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  36.91 
 
 		 433 aa  259  6e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  35.37 
 
 		 421 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  34.18 
 
 		 407 aa  256  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  35.5 
 
 		 424 aa  256  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  34.52 
 
 		 403 aa  256  6e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  34.35 
 
 		 409 aa  255  8e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  33.97 
 
 		 419 aa  255  9e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  36 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  33.58 
 
 		 412 aa  253  3e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0533  type II secretion system protein  34.85 
 
 		 402 aa  253  3e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  36.29 
 
 		 409 aa  252  7e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1409  type II secretion system protein  33.82 
 
 		 405 aa  249  5e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205741  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1997  Type II secretion system F domain protein  33.33 
 
 		 407 aa  249  6e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  34.24 
 
 		 406 aa  249  6e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  34.75 
 
 		 409 aa  249  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  33.5 
 
 		 408 aa  249  8e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  34.34 
 
 		 407 aa  248  1e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  33.17 
 
 		 417 aa  248  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3086  type II secretion system protein  35.01 
 
 		 439 aa  248  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  33.09 
 
 		 410 aa  248  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2894  general secretion pathway protein F  35.56 
 
 		 410 aa  246  4e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196755  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  35.41 
 
 		 403 aa  246  4e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  34.66 
 
 		 422 aa  245  9.999999999999999e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  32.41 
 
 		 419 aa  244  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  34.34 
 
 		 408 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  32.09 
 
 		 405 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  33 
 
 		 406 aa  245  9.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  34.09 
 
 		 405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  33.08 
 
 		 406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  32.83 
 
 		 422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  34.4 
 
 		 405 aa  243  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  32.74 
 
 		 420 aa  244  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  33.92 
 
 		 402 aa  243  3.9999999999999997e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 406 aa  243  6e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  32.16 
 
 		 404 aa  242  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  31.25 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  33.67 
 
 		 421 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  32.49 
 
 		 408 aa  241  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  32.84 
 
 		 406 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  32.58 
 
 		 422 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  33.74 
 
 		 409 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 420 aa  239  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  33.08 
 
 		 406 aa  240  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 424 aa  239  5e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  34.18 
 
 		 401 aa  239  5e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  31.25 
 
 		 405 aa  239  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  32.43 
 
 		 404 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  33.59 
 
 		 404 aa  239  9e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  31.75 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  31.25 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0681  type II secretion system protein  36.66 
 
 		 407 aa  237  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.524718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  34.16 
 
 		 401 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 405 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  33.66 
 
 		 407 aa  236  5.0000000000000005e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  31.76 
 
 		 408 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  33.17 
 
 		 405 aa  236  6e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  33.17 
 
 		 403 aa  235  8e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  33.17 
 
 		 406 aa  235  9e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  32.92 
 
 		 412 aa  235  9e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  32.17 
 
 		 404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>