More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0389 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  100 
 
 		 408 aa  819    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  48.65 
 
 		 405 aa  411  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  47.8 
 
 		 407 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  46.83 
 
 		 407 aa  392  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  45.83 
 
 		 408 aa  389  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00255  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshG (pilus type IV)  46.23 
 
 		 411 aa  391  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  44.53 
 
 		 405 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  44.12 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3270  general secretory pathway protein F  49.51 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  45.37 
 
 		 406 aa  381  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0880  type II secretion system protein  47.52 
 
 		 406 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0548  type II secretion system protein  45.34 
 
 		 406 aa  373  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00110848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0564  type II secretion system protein  44.61 
 
 		 406 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  43.63 
 
 		 406 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  43.38 
 
 		 404 aa  372  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  43.63 
 
 		 406 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2824  MSHA biogenesis protein MshG  45.34 
 
 		 407 aa  372  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3831  type II secretion system protein  44.12 
 
 		 406 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00398408  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  44.85 
 
 		 406 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4108  MSHA biogenesis protein MshG  43.87 
 
 		 406 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  42.61 
 
 		 409 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0509  type II secretion system protein  43.87 
 
 		 406 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.013646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0470  type II secretion system protein  43.63 
 
 		 406 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0512  type II secretion system protein  43.87 
 
 		 406 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0488  type II secretion system protein  43.87 
 
 		 406 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00834812  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3343  type II secretion system protein  43.87 
 
 		 405 aa  364  1e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000142203  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1139  MSHA biogenesis protein MshG  43.81 
 
 		 406 aa  361  1e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0753  type II secretory pathway component PulF  44.96 
 
 		 407 aa  358  9.999999999999999e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347223  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4572  MSHA biogenesis protein MshG  46.32 
 
 		 408 aa  355  5.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  46.04 
 
 		 406 aa  354  2e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3098  type II secretion system protein  46.73 
 
 		 412 aa  337  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3361  type II secretion system protein  43.69 
 
 		 412 aa  333  3e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  35.98 
 
 		 408 aa  266  5.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  35.18 
 
 		 408 aa  263  4e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  35.66 
 
 		 417 aa  263  4e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  34.49 
 
 		 408 aa  262  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  37.31 
 
 		 411 aa  262  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  35.85 
 
 		 401 aa  262  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  32.68 
 
 		 405 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  34.99 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  34.24 
 
 		 405 aa  260  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  34.74 
 
 		 407 aa  260  4e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  34 
 
 		 405 aa  260  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  35.19 
 
 		 408 aa  259  9e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  32.52 
 
 		 405 aa  258  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  34.49 
 
 		 405 aa  256  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  31.94 
 
 		 404 aa  256  5e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  32.35 
 
 		 406 aa  256  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  33 
 
 		 421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  32.18 
 
 		 403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  33.42 
 
 		 410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  33.75 
 
 		 409 aa  254  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  33.25 
 
 		 407 aa  252  7e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  33.25 
 
 		 406 aa  251  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  34 
 
 		 408 aa  251  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  33.25 
 
 		 424 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  34.31 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  32.67 
 
 		 409 aa  251  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  33.25 
 
 		 420 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  33.5 
 
 		 403 aa  250  4e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  32.19 
 
 		 405 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  35.89 
 
 		 409 aa  248  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  32.77 
 
 		 407 aa  248  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  32.92 
 
 		 405 aa  248  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  33.17 
 
 		 401 aa  247  3e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  33.25 
 
 		 417 aa  247  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  32.52 
 
 		 405 aa  246  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  34.48 
 
 		 402 aa  246  4.9999999999999997e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  33.5 
 
 		 405 aa  246  6e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  34.89 
 
 		 406 aa  246  6.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  31.92 
 
 		 401 aa  246  6.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  34.57 
 
 		 406 aa  242  7e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  33.09 
 
 		 401 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  33 
 
 		 419 aa  242  9e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  32.51 
 
 		 419 aa  241  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  32.75 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  33.58 
 
 		 405 aa  240  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  30.92 
 
 		 401 aa  240  4e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.77 
 
 		 405 aa  239  8e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  31.76 
 
 		 401 aa  239  8e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  35.12 
 
 		 410 aa  239  9e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  31.54 
 
 		 463 aa  238  2e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  32.59 
 
 		 421 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  31.3 
 
 		 463 aa  237  3e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  33.66 
 
 		 423 aa  237  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  32.26 
 
 		 424 aa  237  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  33.01 
 
 		 417 aa  237  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2903  type II secretion system protein  32.51 
 
 		 405 aa  236  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  31.57 
 
 		 405 aa  236  6e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0774  type II secretion system protein  32.26 
 
 		 405 aa  234  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  33.42 
 
 		 419 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  32.59 
 
 		 422 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  30.52 
 
 		 405 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  31.85 
 
 		 422 aa  231  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2175  type II secretion system protein  33.74 
 
 		 410 aa  231  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357882  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  33.5 
 
 		 406 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  31.17 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  32.68 
 
 		 423 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  31.31 
 
 		 406 aa  230  3e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>