More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0174 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  100 
 
 		 405 aa  825    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  54.68 
 
 		 404 aa  480  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  54.81 
 
 		 406 aa  475  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  54.57 
 
 		 406 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  55.42 
 
 		 405 aa  473  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  54.68 
 
 		 406 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  54.68 
 
 		 406 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0470  type II secretion system protein  55.06 
 
 		 406 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0564  type II secretion system protein  55.28 
 
 		 406 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4108  MSHA biogenesis protein MshG  54.57 
 
 		 406 aa  464  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3343  type II secretion system protein  54.32 
 
 		 405 aa  464  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000142203  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0548  type II secretion system protein  54.93 
 
 		 406 aa  462  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00110848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00255  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshG (pilus type IV)  55.85 
 
 		 411 aa  459  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3831  type II secretion system protein  54.07 
 
 		 406 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00398408  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0488  type II secretion system protein  53.83 
 
 		 406 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00834812  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0512  type II secretion system protein  53.83 
 
 		 406 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0509  type II secretion system protein  53.83 
 
 		 406 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.013646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  54.63 
 
 		 406 aa  449  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  51.6 
 
 		 407 aa  437  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4572  MSHA biogenesis protein MshG  53.3 
 
 		 408 aa  426  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2824  MSHA biogenesis protein MshG  51.6 
 
 		 407 aa  426  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  50.37 
 
 		 407 aa  427  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  49.26 
 
 		 408 aa  415  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1139  MSHA biogenesis protein MshG  49.38 
 
 		 406 aa  414  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  46.8 
 
 		 409 aa  408  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  48.65 
 
 		 408 aa  404  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0880  type II secretion system protein  47.12 
 
 		 406 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0753  type II secretory pathway component PulF  45.5 
 
 		 407 aa  377  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3361  type II secretion system protein  46.81 
 
 		 412 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3270  general secretory pathway protein F  46.63 
 
 		 406 aa  363  3e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  43.41 
 
 		 406 aa  361  1e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3098  type II secretion system protein  44.09 
 
 		 412 aa  340  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  36.27 
 
 		 406 aa  278  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  33.74 
 
 		 408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  34.4 
 
 		 405 aa  264  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  34.58 
 
 		 403 aa  262  8e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  34.4 
 
 		 405 aa  260  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  34.4 
 
 		 407 aa  257  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  33.74 
 
 		 405 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  33.99 
 
 		 405 aa  253  6e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  33 
 
 		 401 aa  252  9.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  32.67 
 
 		 417 aa  251  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  32.59 
 
 		 408 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  35.29 
 
 		 403 aa  251  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  32.1 
 
 		 406 aa  251  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  34.07 
 
 		 409 aa  251  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  31.59 
 
 		 409 aa  250  3e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  35.14 
 
 		 403 aa  249  8e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  31.77 
 
 		 406 aa  248  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  31.28 
 
 		 405 aa  246  6.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  33.17 
 
 		 404 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  33.25 
 
 		 404 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  32.68 
 
 		 410 aa  245  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  32.35 
 
 		 401 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  33.25 
 
 		 404 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  32 
 
 		 417 aa  243  3e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  30.85 
 
 		 404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  33.83 
 
 		 403 aa  243  6e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  32.08 
 
 		 405 aa  243  6e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  32.84 
 
 		 433 aa  241  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  33.83 
 
 		 406 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  32.76 
 
 		 416 aa  241  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  32.19 
 
 		 404 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 409 aa  240  4e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  30.86 
 
 		 401 aa  239  5e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2101  type II secretion system protein  33.08 
 
 		 404 aa  238  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  34.32 
 
 		 409 aa  238  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1997  Type II secretion system F domain protein  30.05 
 
 		 407 aa  237  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  31.7 
 
 		 402 aa  237  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  30.48 
 
 		 408 aa  236  5.0000000000000005e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  32.69 
 
 		 410 aa  236  7e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  33.91 
 
 		 411 aa  235  9e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  30.98 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1053  type II secretion system protein  33.25 
 
 		 401 aa  233  3e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000304141  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  30.48 
 
 		 405 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  31.93 
 
 		 407 aa  233  5e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  31.27 
 
 		 417 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  31.6 
 
 		 404 aa  232  9e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  32.2 
 
 		 401 aa  231  1e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 417 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  30.73 
 
 		 409 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  34.4 
 
 		 405 aa  230  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 417 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  31.86 
 
 		 401 aa  230  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  31.49 
 
 		 405 aa  230  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  29.5 
 
 		 401 aa  230  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  30.96 
 
 		 407 aa  229  7e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  29.6 
 
 		 419 aa  229  7e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1352  pilin biogenesis protein, putative  29.53 
 
 		 401 aa  227  2e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.291747  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  31.27 
 
 		 412 aa  228  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  30.73 
 
 		 424 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  34.72 
 
 		 402 aa  227  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1164  type II secretion system protein  28.78 
 
 		 401 aa  226  7e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  30.98 
 
 		 408 aa  226  7e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1134  type II secretion system protein  29.28 
 
 		 401 aa  226  8e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0952  type II secretion system protein  33.5 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  31.27 
 
 		 409 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  29.72 
 
 		 405 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  30.98 
 
 		 407 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  32.1 
 
 		 403 aa  223  7e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>