More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00255 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00255  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshG (pilus type IV)  100 
 
 		 411 aa  829    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  57.42 
 
 		 405 aa  500  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  56.69 
 
 		 406 aa  495  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  57.66 
 
 		 406 aa  497  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  57.66 
 
 		 406 aa  497  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  57.66 
 
 		 406 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0509  type II secretion system protein  58.39 
 
 		 406 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.013646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0564  type II secretion system protein  58.39 
 
 		 406 aa  485  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3831  type II secretion system protein  58.64 
 
 		 406 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00398408  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0488  type II secretion system protein  58.39 
 
 		 406 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00834812  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4108  MSHA biogenesis protein MshG  58.15 
 
 		 406 aa  482  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0548  type II secretion system protein  58.15 
 
 		 406 aa  483  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00110848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0512  type II secretion system protein  58.39 
 
 		 406 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  57.42 
 
 		 406 aa  479  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0470  type II secretion system protein  57.91 
 
 		 406 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3343  type II secretion system protein  56.69 
 
 		 405 aa  478  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000142203  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  55.85 
 
 		 405 aa  475  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  55.47 
 
 		 404 aa  473  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  48.42 
 
 		 407 aa  430  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  47.45 
 
 		 407 aa  421  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  48.05 
 
 		 408 aa  421  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4572  MSHA biogenesis protein MshG  52.55 
 
 		 408 aa  416  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2824  MSHA biogenesis protein MshG  48.79 
 
 		 407 aa  415  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1139  MSHA biogenesis protein MshG  49.75 
 
 		 406 aa  414  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  46.23 
 
 		 408 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  45.34 
 
 		 409 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  44.85 
 
 		 406 aa  382  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0753  type II secretory pathway component PulF  43.07 
 
 		 407 aa  375  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0880  type II secretion system protein  41.83 
 
 		 406 aa  354  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3270  general secretory pathway protein F  43.07 
 
 		 406 aa  350  3e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3361  type II secretion system protein  44.15 
 
 		 412 aa  349  6e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3098  type II secretion system protein  40.59 
 
 		 412 aa  330  3e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  32.12 
 
 		 408 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  34.31 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  32.69 
 
 		 408 aa  248  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  33.09 
 
 		 405 aa  247  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  33 
 
 		 406 aa  245  8e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  31.64 
 
 		 404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  31.88 
 
 		 404 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  32.44 
 
 		 409 aa  241  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  33.01 
 
 		 405 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  31.77 
 
 		 405 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  32.62 
 
 		 403 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  28.54 
 
 		 406 aa  236  7e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  30.41 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  29.44 
 
 		 407 aa  234  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  31.68 
 
 		 401 aa  233  5e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  29.8 
 
 		 417 aa  232  7.000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  29.02 
 
 		 405 aa  232  9e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  31.09 
 
 		 405 aa  232  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  31.86 
 
 		 403 aa  232  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  31.09 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1997  Type II secretion system F domain protein  30.05 
 
 		 407 aa  231  3e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  31.37 
 
 		 401 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1169  type II secretion system protein  33.83 
 
 		 400 aa  229  8e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  30.15 
 
 		 401 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  29.88 
 
 		 403 aa  228  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  34.24 
 
 		 410 aa  227  3e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  32.2 
 
 		 403 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  33.1 
 
 		 410 aa  224  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  31.71 
 
 		 404 aa  225  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  31.96 
 
 		 412 aa  223  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  29.66 
 
 		 401 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  30.85 
 
 		 405 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  31.02 
 
 		 416 aa  222  9e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  31.2 
 
 		 417 aa  222  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1040  Type II secretion system F domain protein  32.43 
 
 		 413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  30.1 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  30.6 
 
 		 409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  31.36 
 
 		 433 aa  220  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  31.33 
 
 		 405 aa  220  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  31.95 
 
 		 403 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  32.77 
 
 		 401 aa  220  5e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  31.05 
 
 		 403 aa  219  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  30.79 
 
 		 405 aa  219  6e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  30.66 
 
 		 406 aa  219  7e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  30.1 
 
 		 407 aa  219  7.999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_002936  DET1352  pilin biogenesis protein, putative  32.17 
 
 		 401 aa  219  1e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.291747  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  28.29 
 
 		 409 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  32.93 
 
 		 404 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  32.93 
 
 		 404 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  29.71 
 
 		 406 aa  217  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1388  type II secretion system protein  33.43 
 
 		 414 aa  218  2e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.268491  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  29.61 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  32.35 
 
 		 407 aa  217  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  30.66 
 
 		 407 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  30.66 
 
 		 407 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  30.66 
 
 		 407 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  30.66 
 
 		 407 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  30.37 
 
 		 407 aa  216  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  30.88 
 
 		 419 aa  216  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  30.46 
 
 		 419 aa  216  5.9999999999999996e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  31.54 
 
 		 404 aa  216  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  29.2 
 
 		 406 aa  216  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  29.85 
 
 		 408 aa  215  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  29.8 
 
 		 417 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  29.06 
 
 		 405 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  31.87 
 
 		 409 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1053  type II secretion system protein  32.5 
 
 		 401 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000304141  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  30.47 
 
 		 419 aa  213  4.9999999999999996e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>