More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1997 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1997  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 		 407 aa  828    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  54.21 
 
 		 405 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  53.96 
 
 		 408 aa  450  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1409  type II secretion system protein  51.36 
 
 		 405 aa  429  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205741  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  36.79 
 
 		 401 aa  279  7e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  33.09 
 
 		 401 aa  252  7e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  37.03 
 
 		 404 aa  252  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  37.03 
 
 		 404 aa  252  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 401 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  34.07 
 
 		 407 aa  252  9.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  32.84 
 
 		 408 aa  251  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  34.74 
 
 		 402 aa  250  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0753  type II secretory pathway component PulF  34.07 
 
 		 407 aa  249  4e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  33 
 
 		 417 aa  249  6e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0880  type II secretion system protein  32.67 
 
 		 406 aa  249  8e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  34.07 
 
 		 403 aa  247  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  33.58 
 
 		 407 aa  246  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  32.01 
 
 		 406 aa  246  4e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  36.18 
 
 		 404 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  31.02 
 
 		 409 aa  245  8e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  35.96 
 
 		 401 aa  245  9e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3270  general secretory pathway protein F  33.42 
 
 		 406 aa  245  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3343  type II secretion system protein  32.42 
 
 		 405 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000142203  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  35.92 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  31.53 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3098  type II secretion system protein  35.43 
 
 		 412 aa  243  3.9999999999999997e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  31.85 
 
 		 401 aa  243  5e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  31.11 
 
 		 406 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  30.12 
 
 		 406 aa  241  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  31.6 
 
 		 405 aa  241  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  35.66 
 
 		 406 aa  241  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4108  MSHA biogenesis protein MshG  32.35 
 
 		 406 aa  241  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  30.86 
 
 		 406 aa  241  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  30.05 
 
 		 405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  35.02 
 
 		 406 aa  240  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1134  type II secretion system protein  35.22 
 
 		 401 aa  239  5.999999999999999e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  37.92 
 
 		 407 aa  239  5.999999999999999e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  31.28 
 
 		 401 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0470  type II secretion system protein  31.36 
 
 		 406 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1352  pilin biogenesis protein, putative  35.4 
 
 		 401 aa  238  1e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.291747  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  32.84 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0564  type II secretion system protein  32.02 
 
 		 406 aa  237  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  31.97 
 
 		 419 aa  236  4e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  31.95 
 
 		 405 aa  236  4e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1745  type II secretion system protein  36.16 
 
 		 377 aa  236  5.0000000000000005e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  36.03 
 
 		 403 aa  236  8e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0548  type II secretion system protein  30.62 
 
 		 406 aa  235  9e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00110848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  33.82 
 
 		 403 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  32.75 
 
 		 406 aa  234  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  33 
 
 		 409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  31.11 
 
 		 406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  34.98 
 
 		 409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3831  type II secretion system protein  31.6 
 
 		 406 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00398408  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  32.1 
 
 		 406 aa  234  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2824  MSHA biogenesis protein MshG  32.26 
 
 		 407 aa  234  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  34.83 
 
 		 422 aa  233  5e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0512  type II secretion system protein  31.36 
 
 		 406 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1164  type II secretion system protein  34.65 
 
 		 401 aa  232  7.000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  33.58 
 
 		 408 aa  233  7.000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.94 
 
 		 405 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0509  type II secretion system protein  31.37 
 
 		 406 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.013646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3361  type II secretion system protein  35.48 
 
 		 412 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0488  type II secretion system protein  31.37 
 
 		 406 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00834812  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  35.75 
 
 		 407 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  34.26 
 
 		 410 aa  231  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  34.07 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  31.42 
 
 		 404 aa  230  4e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0533  type II secretion system protein  31.2 
 
 		 402 aa  228  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  31.66 
 
 		 409 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  30.39 
 
 		 408 aa  226  6e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0952  type II secretion system protein  31.41 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  32.27 
 
 		 405 aa  225  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1139  MSHA biogenesis protein MshG  30.2 
 
 		 406 aa  225  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  32.52 
 
 		 412 aa  225  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3255  type II secretion system protein  32 
 
 		 403 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  31.3 
 
 		 405 aa  225  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  31.69 
 
 		 404 aa  224  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  30.64 
 
 		 403 aa  222  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  33.08 
 
 		 409 aa  221  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  29.17 
 
 		 405 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  29.88 
 
 		 417 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1169  type II secretion system protein  33.91 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4572  MSHA biogenesis protein MshG  31.85 
 
 		 408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  31.28 
 
 		 408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  32.94 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  31.67 
 
 		 401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  29.3 
 
 		 406 aa  220  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  29.63 
 
 		 417 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00255  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshG (pilus type IV)  30.05 
 
 		 411 aa  220  3.9999999999999997e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  31.13 
 
 		 410 aa  219  6e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  29.38 
 
 		 417 aa  219  7e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  29.56 
 
 		 406 aa  219  7.999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  28.99 
 
 		 405 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  30.81 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  31.19 
 
 		 416 aa  218  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  28.99 
 
 		 405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2894  general secretion pathway protein F  32.08 
 
 		 410 aa  217  4e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196755  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  30.32 
 
 		 406 aa  216  5e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  30.32 
 
 		 406 aa  216  5.9999999999999996e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  30.05 
 
 		 407 aa  216  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>