More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1053 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1053  type II secretion system protein  100 
 
 
401 aa  794    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000304141  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  37.06 
 
 
406 aa  260  3e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  36.68 
 
 
406 aa  258  1e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  35.91 
 
 
406 aa  247  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  36.25 
 
 
409 aa  246  4e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  33.25 
 
 
405 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  34.43 
 
 
403 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  34.72 
 
 
408 aa  240  2.9999999999999997e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  34.34 
 
 
405 aa  239  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  36.84 
 
 
411 aa  238  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  35.11 
 
 
406 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  34.92 
 
 
406 aa  237  2e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  36.79 
 
 
407 aa  236  4e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  35.96 
 
 
407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  32.57 
 
 
406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  33.16 
 
 
406 aa  233  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  33.83 
 
 
407 aa  231  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  35.18 
 
 
410 aa  231  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  38.17 
 
 
409 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  31.65 
 
 
404 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  33.25 
 
 
405 aa  230  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  34.01 
 
 
405 aa  230  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  34.29 
 
 
422 aa  229  8e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  35.1 
 
 
416 aa  227  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  36.13 
 
 
405 aa  227  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3343  type II secretion system protein  32.83 
 
 
405 aa  227  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000142203  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  31.14 
 
 
408 aa  226  4e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  36.27 
 
 
433 aa  224  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  35.38 
 
 
409 aa  225  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  38.38 
 
 
409 aa  224  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  35.97 
 
 
410 aa  224  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  30.03 
 
 
406 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  32.66 
 
 
404 aa  223  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  34.94 
 
 
402 aa  223  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  34.66 
 
 
404 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  34.66 
 
 
404 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  33.76 
 
 
403 aa  222  9e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  33.67 
 
 
417 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0753  type II secretory pathway component PulF  33.92 
 
 
407 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347223  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2894  general secretion pathway protein F  34.91 
 
 
410 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196755  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  33.76 
 
 
405 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  33.25 
 
 
407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  30.03 
 
 
405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  30.28 
 
 
406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  31.11 
 
 
409 aa  220  3.9999999999999997e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  33.5 
 
 
417 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  30.28 
 
 
406 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  31.84 
 
 
405 aa  219  8.999999999999998e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3617  general secretion pathway protein F  35.24 
 
 
406 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  35.79 
 
 
401 aa  217  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  33 
 
 
417 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  33.75 
 
 
407 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  33.67 
 
 
417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  34.03 
 
 
403 aa  216  4e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3255  type II secretion system protein  33.08 
 
 
403 aa  217  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3270  general secretory pathway protein F  33.5 
 
 
406 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  34.26 
 
 
419 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  32.75 
 
 
417 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  31.9 
 
 
419 aa  216  7e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  34 
 
 
403 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  31.82 
 
 
406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3831  type II secretion system protein  30.89 
 
 
406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00398408  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  32.73 
 
 
404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0512  type II secretion system protein  30.89 
 
 
406 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331644  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0509  type II secretion system protein  30.89 
 
 
406 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.013646  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0488  type II secretion system protein  30.89 
 
 
406 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00834812  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0123  general secretion pathway protein F  33.83 
 
 
407 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0470  type II secretion system protein  30.03 
 
 
406 aa  212  7e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0548  type II secretion system protein  30.56 
 
 
406 aa  212  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00110848  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0233  general secretion pathway protein F  33.51 
 
 
406 aa  211  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  34.09 
 
 
409 aa  211  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00255  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshG (pilus type IV)  32.5 
 
 
411 aa  211  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  34.09 
 
 
408 aa  210  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0880  type II secretion system protein  34.34 
 
 
406 aa  210  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  32.9 
 
 
403 aa  209  5e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  32.01 
 
 
404 aa  209  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2824  MSHA biogenesis protein MshG  30.86 
 
 
407 aa  209  6e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  34.28 
 
 
423 aa  209  7e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  37.43 
 
 
412 aa  209  7e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  33.25 
 
 
402 aa  209  8e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3098  type II secretion system protein  33 
 
 
412 aa  209  8e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  34.26 
 
 
401 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4823  putative type II secretion system protein  33.92 
 
 
404 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0274243  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  34.44 
 
 
404 aa  208  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4108  MSHA biogenesis protein MshG  30.38 
 
 
406 aa  207  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55430  putative type II secretion system protein  33.67 
 
 
404 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000716105  normal  0.0429131 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  32.22 
 
 
423 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  32.73 
 
 
422 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  34.93 
 
 
405 aa  207  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  34.96 
 
 
405 aa  206  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  29.75 
 
 
401 aa  206  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  32.38 
 
 
403 aa  206  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  32.41 
 
 
407 aa  206  8e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0952  type II secretion system protein  33.42 
 
 
402 aa  205  9e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0099  general secretion pathway protein F  34.37 
 
 
396 aa  205  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58760  type 4 fimbrial biogenesis protein pilC  33.15 
 
 
373 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.95906  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4356  general secretion pathway protein F  33.75 
 
 
407 aa  205  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  34.32 
 
 
405 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  33.25 
 
 
407 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  32.92 
 
 
407 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>