More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1388 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1388  type II secretion system protein  100 
 
 
414 aa  834    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.268491  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1040  Type II secretion system F domain protein  48.42 
 
 
413 aa  392  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1963  type II secretion system protein  45.76 
 
 
415 aa  375  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1051  type II secretion system protein  45.63 
 
 
413 aa  374  1e-102  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1232  transcription regulator AsnC  45.87 
 
 
411 aa  370  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1011  type II secretion system protein  44.42 
 
 
413 aa  365  1e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00255  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshG (pilus type IV)  33.43 
 
 
411 aa  218  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  32.97 
 
 
406 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0548  type II secretion system protein  32.97 
 
 
406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00110848  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  32.97 
 
 
406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  32.51 
 
 
404 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  32.43 
 
 
406 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3831  type II secretion system protein  32.43 
 
 
406 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00398408  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0488  type II secretion system protein  32.15 
 
 
406 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00834812  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0509  type II secretion system protein  32.15 
 
 
406 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.013646  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  32.43 
 
 
405 aa  208  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0512  type II secretion system protein  32.15 
 
 
406 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331644  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  31.3 
 
 
408 aa  208  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4108  MSHA biogenesis protein MshG  31.88 
 
 
406 aa  208  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  32.97 
 
 
406 aa  206  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0564  type II secretion system protein  31.61 
 
 
406 aa  205  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0470  type II secretion system protein  32.43 
 
 
406 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  29.77 
 
 
405 aa  200  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  30.1 
 
 
407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  30.08 
 
 
406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  30.09 
 
 
409 aa  197  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0753  type II secretory pathway component PulF  30.54 
 
 
407 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347223  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  31.07 
 
 
407 aa  196  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3343  type II secretion system protein  30.27 
 
 
405 aa  194  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000142203  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2824  MSHA biogenesis protein MshG  30.88 
 
 
407 aa  193  6e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  27.12 
 
 
406 aa  191  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3270  general secretory pathway protein F  29.46 
 
 
406 aa  189  7e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  29.97 
 
 
408 aa  188  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  28.15 
 
 
402 aa  182  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3098  type II secretion system protein  29.41 
 
 
412 aa  181  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1139  MSHA biogenesis protein MshG  29.8 
 
 
406 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  29.48 
 
 
417 aa  176  7e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  30.03 
 
 
419 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0880  type II secretion system protein  29.83 
 
 
406 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  31.2 
 
 
403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  26.67 
 
 
402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  29.74 
 
 
403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  29.35 
 
 
422 aa  173  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3361  type II secretion system protein  32.2 
 
 
412 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  28.82 
 
 
405 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  30.98 
 
 
409 aa  170  5e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  26.72 
 
 
409 aa  170  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  26.59 
 
 
403 aa  169  6e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4572  MSHA biogenesis protein MshG  30.95 
 
 
408 aa  169  7e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  27.75 
 
 
406 aa  169  7e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  27.75 
 
 
406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  28.83 
 
 
421 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  29.22 
 
 
404 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  25.42 
 
 
407 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.01 
 
 
419 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  26.37 
 
 
420 aa  166  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  29.39 
 
 
411 aa  166  9e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  29.14 
 
 
404 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  29.18 
 
 
403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  29.14 
 
 
404 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  26.37 
 
 
424 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  30.03 
 
 
410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  28.66 
 
 
422 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  27.23 
 
 
421 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  27.33 
 
 
419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0424  type II secretion system protein  29.77 
 
 
421 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440885 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  27.75 
 
 
407 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  27.82 
 
 
406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  29.48 
 
 
409 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  27.25 
 
 
408 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  26.76 
 
 
409 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  26.68 
 
 
412 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  26.18 
 
 
406 aa  163  6e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  29.14 
 
 
406 aa  162  8.000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  27.95 
 
 
405 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1816  general secretory pathway protein F  26.67 
 
 
392 aa  162  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  24.92 
 
 
401 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1745  type II secretion system protein  29.13 
 
 
377 aa  162  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41063  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  27.58 
 
 
423 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  28.12 
 
 
405 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  29.88 
 
 
410 aa  161  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  26.01 
 
 
404 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1643  general secretory pathway protein F  26.38 
 
 
393 aa  160  3e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.209912  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2903  type II secretion system protein  26.58 
 
 
405 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1463  general secretory pathway protein F  26.38 
 
 
392 aa  160  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  27.78 
 
 
423 aa  160  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  28.23 
 
 
420 aa  160  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  26.58 
 
 
405 aa  159  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  27.93 
 
 
422 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  26.77 
 
 
405 aa  159  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2001  type IV pilin biogenesis protein PilC  27.44 
 
 
408 aa  159  8e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148255  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  25.13 
 
 
417 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  26.88 
 
 
405 aa  159  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3606  type II secretion system protein  28.83 
 
 
421 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  25.13 
 
 
417 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  24.78 
 
 
408 aa  158  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  25.99 
 
 
406 aa  158  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3372  type IV pilin biogenesis protein  25.55 
 
 
399 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  26.36 
 
 
409 aa  157  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  25.38 
 
 
417 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>