More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2271 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  95.25 
 
 		 401 aa  756    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  100 
 
 		 401 aa  791    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  39.8 
 
 		 403 aa  324  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  38.31 
 
 		 404 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  39.85 
 
 		 401 aa  317  3e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  37.1 
 
 		 405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  37.81 
 
 		 403 aa  290  3e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  37.68 
 
 		 401 aa  281  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  34.98 
 
 		 406 aa  278  8e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  34.34 
 
 		 417 aa  278  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  35.89 
 
 		 405 aa  276  5e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  35.89 
 
 		 405 aa  275  9e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  34.31 
 
 		 405 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  35.57 
 
 		 411 aa  271  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  35.64 
 
 		 405 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  36.72 
 
 		 417 aa  271  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  35.45 
 
 		 404 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  38.18 
 
 		 410 aa  270  4e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  34.75 
 
 		 409 aa  270  4e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  33 
 
 		 402 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  35.93 
 
 		 404 aa  265  7e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  34.32 
 
 		 406 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  35.22 
 
 		 407 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  38.02 
 
 		 406 aa  258  1e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  35.47 
 
 		 408 aa  257  3e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  32.15 
 
 		 403 aa  256  6e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  37.22 
 
 		 409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  32.42 
 
 		 403 aa  252  7e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0099  general secretion pathway protein F  32.23 
 
 		 396 aa  252  9.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  35.8 
 
 		 403 aa  251  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  33.09 
 
 		 404 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  33.5 
 
 		 405 aa  250  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  32.08 
 
 		 404 aa  249  6e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  32.76 
 
 		 404 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  32.76 
 
 		 404 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  32.09 
 
 		 406 aa  248  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  33.42 
 
 		 419 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  34 
 
 		 406 aa  248  1e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  31.99 
 
 		 417 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  32.41 
 
 		 401 aa  246  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  35.94 
 
 		 407 aa  245  9e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  31.54 
 
 		 409 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  32.35 
 
 		 405 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  31.99 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1301  general secretion pathway protein F  31.84 
 
 		 408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3617  general secretion pathway protein F  30.69 
 
 		 406 aa  243  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  34.41 
 
 		 406 aa  242  7.999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  31.74 
 
 		 417 aa  242  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2101  type II secretion system protein  34.59 
 
 		 404 aa  242  9e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  33.74 
 
 		 405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  36.32 
 
 		 401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  32.42 
 
 		 403 aa  239  5e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2922  general secretion pathway protein F  32.43 
 
 		 405 aa  239  8e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4356  general secretion pathway protein F  30.86 
 
 		 407 aa  238  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  31.92 
 
 		 408 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2894  general secretion pathway protein F  31.36 
 
 		 410 aa  238  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196755  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  31.51 
 
 		 405 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1350  general secretion pathway protein F  32.51 
 
 		 403 aa  238  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24010  general secretion pathway protein F  29.88 
 
 		 405 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  31.3 
 
 		 407 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1414  general secretion pathway protein F  30.6 
 
 		 408 aa  237  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  30.85 
 
 		 406 aa  237  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1997  Type II secretion system F domain protein  31.28 
 
 		 407 aa  237  3e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2031  general secretion pathway protein F  29.88 
 
 		 405 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  35.47 
 
 		 410 aa  236  5.0000000000000005e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  31.11 
 
 		 407 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1352  pilin biogenesis protein, putative  31.25 
 
 		 401 aa  236  6e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.291747  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  31.78 
 
 		 407 aa  236  6e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0107  general secretion pathway protein F  30.64 
 
 		 410 aa  236  6e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4589  general secretion pathway protein F  31.31 
 
 		 413 aa  236  7e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  32.15 
 
 		 402 aa  236  8e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  31.09 
 
 		 406 aa  235  9e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  30.86 
 
 		 407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  30.86 
 
 		 407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  30.86 
 
 		 407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0171  general secretion pathway protein F  31.28 
 
 		 407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  30.86 
 
 		 407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  31.6 
 
 		 408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  29.78 
 
 		 408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0233  general secretion pathway protein F  31.6 
 
 		 406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3554  type II secretion system protein  31.74 
 
 		 401 aa  233  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  34.24 
 
 		 416 aa  233  5e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1923  type II secretion system protein  31.6 
 
 		 402 aa  233  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.919085  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  32.84 
 
 		 417 aa  233  6e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3425  general secretion pathway protein F  29.8 
 
 		 407 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  30.86 
 
 		 407 aa  232  9e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  34.26 
 
 		 404 aa  231  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.41 
 
 		 405 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2858  general secretion pathway protein F  30.6 
 
 		 408 aa  232  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0123  general secretion pathway protein F  31.11 
 
 		 407 aa  232  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  34.68 
 
 		 412 aa  231  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3245  general secretion pathway protein GspF  30.05 
 
 		 407 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.750263 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00603  general secretion pathway protein F  30.69 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  30.71 
 
 		 433 aa  231  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  30.2 
 
 		 407 aa  230  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3136  general secretion pathway protein F  29.56 
 
 		 407 aa  230  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  34.07 
 
 		 409 aa  230  3e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  33 
 
 		 421 aa  230  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3410  general secretion pathway protein GspF  29.31 
 
 		 407 aa  230  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1164  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 401 aa  230  4e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>