More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1882 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  100 
 
 
403 aa  810    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  40.35 
 
 
403 aa  317  3e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  39.35 
 
 
404 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  40.89 
 
 
406 aa  303  5.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  37.81 
 
 
401 aa  301  1e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  38.24 
 
 
408 aa  301  1e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  38.61 
 
 
401 aa  297  3e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  38.37 
 
 
401 aa  294  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  37.5 
 
 
405 aa  290  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  37.04 
 
 
405 aa  287  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  37.01 
 
 
405 aa  285  8e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  36.48 
 
 
403 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  35.59 
 
 
402 aa  282  7.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  36.67 
 
 
406 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  36.54 
 
 
401 aa  280  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  35.43 
 
 
401 aa  280  4e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  36.39 
 
 
406 aa  279  6e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  33.91 
 
 
405 aa  279  7e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  35.73 
 
 
403 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  36.27 
 
 
405 aa  278  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  35.8 
 
 
405 aa  276  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  37.41 
 
 
407 aa  275  7e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  35.77 
 
 
409 aa  271  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  35.63 
 
 
404 aa  268  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  36.95 
 
 
417 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  36.45 
 
 
417 aa  265  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  35.98 
 
 
416 aa  263  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  36.88 
 
 
409 aa  263  6e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  36.57 
 
 
406 aa  262  8e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  34.59 
 
 
417 aa  261  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  36.45 
 
 
417 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  35.14 
 
 
407 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  37.28 
 
 
404 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  35.16 
 
 
410 aa  258  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  35.09 
 
 
404 aa  258  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  35.41 
 
 
411 aa  258  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2101  type II secretion system protein  34.65 
 
 
404 aa  256  6e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  38.46 
 
 
401 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  33 
 
 
417 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  34.31 
 
 
409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  32.92 
 
 
403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  35.43 
 
 
409 aa  253  5.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  35.7 
 
 
422 aa  252  1e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  34.16 
 
 
407 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  34.16 
 
 
407 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  34.16 
 
 
407 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  34.16 
 
 
407 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  33.09 
 
 
407 aa  249  8e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  34.56 
 
 
405 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  35.66 
 
 
419 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  33.75 
 
 
407 aa  248  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1730  type II secretion system protein  32.59 
 
 
403 aa  246  6.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.659448  normal  0.0266314 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  33.67 
 
 
407 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  34.92 
 
 
405 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3617  general secretion pathway protein F  34.25 
 
 
406 aa  244  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  34.94 
 
 
405 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2001  type IV pilin biogenesis protein PilC  34.48 
 
 
408 aa  244  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148255  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  34.68 
 
 
405 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  33.83 
 
 
406 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  35.7 
 
 
408 aa  243  5e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0123  general secretion pathway protein F  33.92 
 
 
407 aa  242  9e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  34.68 
 
 
408 aa  242  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  32.84 
 
 
409 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  33.57 
 
 
419 aa  241  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  36.16 
 
 
409 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  34.74 
 
 
407 aa  239  5e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4589  general secretion pathway protein F  32.93 
 
 
413 aa  239  5e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  35 
 
 
404 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  35.47 
 
 
403 aa  239  5e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  35 
 
 
404 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  33.92 
 
 
424 aa  239  9e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  33.92 
 
 
420 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  35.07 
 
 
417 aa  238  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  34.49 
 
 
409 aa  238  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  33.67 
 
 
405 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  34.43 
 
 
405 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  33.16 
 
 
421 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  34.94 
 
 
403 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  34.33 
 
 
405 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  32.66 
 
 
402 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  35.73 
 
 
405 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  32.91 
 
 
407 aa  236  7e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2175  type II secretion system protein  35.91 
 
 
410 aa  236  8e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357882  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1745  type II secretion system protein  38.44 
 
 
377 aa  236  8e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41063  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2664  type II secretion system protein  30.92 
 
 
414 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  34.43 
 
 
405 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0107  general secretion pathway protein F  32.76 
 
 
410 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  31.2 
 
 
412 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  34.1 
 
 
408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  33.76 
 
 
433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  36.27 
 
 
403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  35.84 
 
 
404 aa  233  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  33.42 
 
 
407 aa  234  3e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  32.09 
 
 
405 aa  233  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  35.01 
 
 
405 aa  232  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3086  type II secretion system protein  33.41 
 
 
439 aa  231  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  32.91 
 
 
405 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  32.66 
 
 
424 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0252  general secretion pathway protein F  31.63 
 
 
404 aa  231  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0153  general secretion pathway protein F  33.42 
 
 
407 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>