More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1745 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1745  type II secretion system protein  100 
 
 
377 aa  757    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41063  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  58.4 
 
 
404 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  58.4 
 
 
404 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  55.77 
 
 
407 aa  411  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  57.1 
 
 
404 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  53.31 
 
 
406 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  55.71 
 
 
407 aa  397  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  51.71 
 
 
410 aa  366  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00171  pili biogenesis protein  45.05 
 
 
426 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  41.69 
 
 
405 aa  294  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  38.69 
 
 
417 aa  285  7e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  39.89 
 
 
401 aa  285  8e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  41.47 
 
 
405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  38.78 
 
 
417 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  40.7 
 
 
409 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  40.29 
 
 
408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  41.18 
 
 
405 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  41.16 
 
 
404 aa  282  9e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  38.15 
 
 
417 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  40.29 
 
 
406 aa  279  5e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  42.65 
 
 
406 aa  278  9e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  40.06 
 
 
405 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  41.69 
 
 
417 aa  277  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  40.12 
 
 
405 aa  277  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  39.62 
 
 
409 aa  276  3e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  40 
 
 
406 aa  276  6e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  39.66 
 
 
405 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  39.36 
 
 
419 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  41.58 
 
 
403 aa  265  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  38.66 
 
 
417 aa  264  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  38.19 
 
 
422 aa  264  2e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  40 
 
 
407 aa  263  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  36.6 
 
 
403 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  37.86 
 
 
410 aa  261  1e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  39.74 
 
 
406 aa  259  4e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  40.23 
 
 
401 aa  258  9e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  36.84 
 
 
404 aa  257  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  38.6 
 
 
408 aa  256  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  39.48 
 
 
403 aa  256  6e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  38.89 
 
 
408 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  38.76 
 
 
405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  37.4 
 
 
416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  35.75 
 
 
433 aa  253  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  38.46 
 
 
405 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  37.5 
 
 
403 aa  253  5.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  36.76 
 
 
407 aa  251  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  37.35 
 
 
402 aa  251  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  36.66 
 
 
402 aa  251  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  39.13 
 
 
409 aa  251  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  36.92 
 
 
409 aa  251  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06891  Type II secretory pathway component PulF-like protein  35.41 
 
 
453 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.807158  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  36.07 
 
 
411 aa  249  5e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  39.6 
 
 
403 aa  248  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  35.52 
 
 
401 aa  248  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  38.17 
 
 
405 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  35.34 
 
 
406 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  37.87 
 
 
405 aa  246  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  35.19 
 
 
424 aa  246  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  35.19 
 
 
420 aa  245  8e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  36.9 
 
 
402 aa  244  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  38.11 
 
 
403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  35.04 
 
 
407 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  36.07 
 
 
421 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  36.07 
 
 
408 aa  242  6e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  38.89 
 
 
422 aa  242  7e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  38.15 
 
 
403 aa  242  7e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  37.06 
 
 
419 aa  241  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  36.2 
 
 
405 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  36.98 
 
 
405 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  34.93 
 
 
419 aa  240  2.9999999999999997e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  37.72 
 
 
409 aa  240  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  35.17 
 
 
419 aa  239  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  36.36 
 
 
424 aa  240  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  36.87 
 
 
405 aa  240  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1997  Type II secretion system F domain protein  36.52 
 
 
407 aa  240  4e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3943  type II secretion system protein  38.95 
 
 
423 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  36.18 
 
 
463 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  35.88 
 
 
404 aa  238  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  37.24 
 
 
420 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  36.18 
 
 
463 aa  238  2e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  37.32 
 
 
412 aa  238  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  38.12 
 
 
423 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2707  type II secretion system protein  36.5 
 
 
401 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  34.12 
 
 
421 aa  236  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1087  type II secretion system protein  39.53 
 
 
419 aa  236  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0972  type IV pilus biogenesis protein PilC  39.53 
 
 
419 aa  236  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.910627  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  35.28 
 
 
407 aa  236  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  36.63 
 
 
406 aa  236  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  38.01 
 
 
423 aa  236  6e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  35.42 
 
 
405 aa  236  6e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  35.28 
 
 
407 aa  236  6e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0150  type II secretion system protein  33.24 
 
 
410 aa  236  7e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  34.59 
 
 
419 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  36.8 
 
 
401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  37.61 
 
 
422 aa  233  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  36.34 
 
 
406 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  35 
 
 
419 aa  233  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  35.31 
 
 
401 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  34.72 
 
 
405 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3606  type II secretion system protein  37.69 
 
 
421 aa  233  5e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>