More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3554 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3554  type II secretion system protein  100 
 
 		 401 aa  805    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  32.23 
 
 		 403 aa  246  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  33.42 
 
 		 401 aa  239  5e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  32.23 
 
 		 401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  31.74 
 
 		 401 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1164  type II secretion system protein  31.58 
 
 		 401 aa  230  3e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  31.49 
 
 		 406 aa  229  9e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1352  pilin biogenesis protein, putative  31.06 
 
 		 401 aa  228  1e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.291747  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  29.78 
 
 		 406 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  29.64 
 
 		 405 aa  226  7e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1134  type II secretion system protein  29.8 
 
 		 401 aa  224  2e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  32.58 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  30.35 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  32.26 
 
 		 402 aa  219  8.999999999999998e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  29.4 
 
 		 403 aa  217  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  29.62 
 
 		 401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  29.28 
 
 		 407 aa  215  9e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  29.35 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.83 
 
 		 405 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  30.55 
 
 		 405 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  28.1 
 
 		 404 aa  213  7e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  32.17 
 
 		 410 aa  212  1e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  34.26 
 
 		 407 aa  210  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  32.51 
 
 		 409 aa  209  5e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  33.67 
 
 		 407 aa  209  7e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  27.71 
 
 		 404 aa  209  9e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  30.73 
 
 		 406 aa  207  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  30.58 
 
 		 405 aa  206  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  29.57 
 
 		 408 aa  205  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  30.96 
 
 		 403 aa  205  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  35.07 
 
 		 409 aa  205  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  29.55 
 
 		 405 aa  203  5e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  31.07 
 
 		 404 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  29.43 
 
 		 406 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0425  type II secretion system protein  28.79 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126236  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  29.87 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  30.58 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  28.82 
 
 		 419 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  29.75 
 
 		 403 aa  199  7.999999999999999e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2707  type II secretion system protein  30.92 
 
 		 401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  28.14 
 
 		 405 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  31.6 
 
 		 433 aa  197  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  30.92 
 
 		 416 aa  196  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  31.27 
 
 		 421 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  30.62 
 
 		 417 aa  194  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  31.92 
 
 		 417 aa  195  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  30.35 
 
 		 406 aa  193  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  29.85 
 
 		 406 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  31.71 
 
 		 408 aa  192  7e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  30.62 
 
 		 424 aa  192  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  31.42 
 
 		 409 aa  191  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  26.77 
 
 		 417 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  33.14 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  27.46 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1053  type II secretion system protein  31.08 
 
 		 401 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000304141  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2824  MSHA biogenesis protein MshG  32.05 
 
 		 407 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  28.68 
 
 		 405 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0533  type II secretion system protein  28.97 
 
 		 402 aa  190  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0302  Type II secretion system F domain protein  29.68 
 
 		 412 aa  189  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  30 
 
 		 405 aa  190  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  27.95 
 
 		 422 aa  189  5e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  30.4 
 
 		 406 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  28.32 
 
 		 403 aa  189  7e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  26.52 
 
 		 417 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  26.68 
 
 		 417 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  29.75 
 
 		 405 aa  189  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4159  type II secretion system protein  31.09 
 
 		 427 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287604 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.55 
 
 		 402 aa  187  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00255  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshG (pilus type IV)  32.54 
 
 		 411 aa  187  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2392  general secretion pathway protein F  29.5 
 
 		 404 aa  186  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000517266 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  27.59 
 
 		 421 aa  186  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.61 
 
 		 419 aa  186  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  28.96 
 
 		 403 aa  186  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  27.97 
 
 		 407 aa  186  9e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  29.15 
 
 		 404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  27.71 
 
 		 420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  30.81 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2101  type II secretion system protein  29.71 
 
 		 404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  27.71 
 
 		 424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  30.35 
 
 		 420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  28.9 
 
 		 409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  28.67 
 
 		 419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  29.92 
 
 		 409 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2664  type II secretion system protein  29.46 
 
 		 414 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  30.61 
 
 		 419 aa  184  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  30.4 
 
 		 401 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  29.94 
 
 		 407 aa  184  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1317  type II secretory pathway protein LspF  29.22 
 
 		 399 aa  183  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0252  general secretion pathway protein F  27.61 
 
 		 404 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  27.64 
 
 		 412 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  29.94 
 
 		 412 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  27.43 
 
 		 408 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  31.28 
 
 		 405 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  30.48 
 
 		 407 aa  182  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  30.52 
 
 		 407 aa  182  8.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  31.22 
 
 		 409 aa  182  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0862  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.15 
 
 		 405 aa  182  9.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  26.58 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1314  type II secretory pathway protein LspF  28.97 
 
 		 399 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  28.5 
 
 		 411 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>