More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0302 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0302  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 
412 aa  821    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  37.19 
 
 
403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  39.41 
 
 
403 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  36.27 
 
 
403 aa  289  6e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  35.73 
 
 
401 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  39.03 
 
 
402 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  38.86 
 
 
417 aa  262  8.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  36.14 
 
 
401 aa  256  4e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1164  type II secretion system protein  33.66 
 
 
401 aa  246  4e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  34.73 
 
 
410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  33.66 
 
 
405 aa  244  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  32.76 
 
 
409 aa  241  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_002936  DET1352  pilin biogenesis protein, putative  33.58 
 
 
401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.291747  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  37.1 
 
 
409 aa  239  6.999999999999999e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  32.76 
 
 
401 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  31.8 
 
 
406 aa  238  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  35.01 
 
 
409 aa  237  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  34.67 
 
 
407 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1134  type II secretion system protein  33.33 
 
 
401 aa  238  2e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  31.83 
 
 
419 aa  238  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  31.77 
 
 
404 aa  237  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  33.09 
 
 
408 aa  236  4e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  32.52 
 
 
406 aa  236  6e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  32.11 
 
 
405 aa  236  7e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  32.27 
 
 
405 aa  236  8e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  33.41 
 
 
405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  32.11 
 
 
405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1409  type II secretion system protein  32.92 
 
 
405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205741  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  35.22 
 
 
401 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  34.53 
 
 
409 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  33.83 
 
 
409 aa  233  5e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  33.42 
 
 
407 aa  233  6e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  35.38 
 
 
404 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  35.38 
 
 
404 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  35.1 
 
 
408 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  33.5 
 
 
405 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  31.46 
 
 
405 aa  231  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  33.33 
 
 
401 aa  229  7e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  32.85 
 
 
405 aa  228  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0079  type II secretion system protein  33.17 
 
 
401 aa  228  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  33.25 
 
 
406 aa  227  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  30.64 
 
 
403 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  34.37 
 
 
411 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  31.44 
 
 
406 aa  226  7e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  34.09 
 
 
404 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  33.09 
 
 
406 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  32.51 
 
 
402 aa  223  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  34.26 
 
 
404 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  33.08 
 
 
403 aa  223  7e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  32.75 
 
 
463 aa  222  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  32.75 
 
 
463 aa  222  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1139  MSHA biogenesis protein MshG  30.94 
 
 
406 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  32.19 
 
 
408 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  31.81 
 
 
412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  30.79 
 
 
417 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  33.53 
 
 
419 aa  220  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  32.59 
 
 
403 aa  219  5e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  33 
 
 
405 aa  219  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  30.54 
 
 
417 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  30.86 
 
 
417 aa  219  6e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0533  type II secretion system protein  31.49 
 
 
402 aa  219  7e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  33.72 
 
 
405 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2101  type II secretion system protein  34.56 
 
 
404 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1301  general secretion pathway protein F  34.15 
 
 
408 aa  218  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  31.05 
 
 
404 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0546  type IV pilus assembly protein PilC  32.19 
 
 
401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  30.41 
 
 
407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  28.54 
 
 
401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  28.47 
 
 
401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  31.11 
 
 
405 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  30.3 
 
 
417 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  31.3 
 
 
407 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  31.85 
 
 
405 aa  215  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  31.36 
 
 
419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  30.83 
 
 
407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  33.67 
 
 
412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1997  Type II secretion system F domain protein  31.53 
 
 
407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  32.75 
 
 
409 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  31.77 
 
 
406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  35.59 
 
 
433 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  30.64 
 
 
407 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  30.85 
 
 
422 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2185  Type II secretion system F domain protein  34.41 
 
 
403 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.170941  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  36.74 
 
 
403 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  32.85 
 
 
419 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1730  type II secretion system protein  30.27 
 
 
403 aa  213  4.9999999999999996e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.659448  normal  0.0266314 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  29.56 
 
 
404 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  31.51 
 
 
405 aa  213  7e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  31.09 
 
 
423 aa  213  7e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1169  type II secretion system protein  33.83 
 
 
400 aa  212  7.999999999999999e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  31.67 
 
 
407 aa  212  9e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2707  type II secretion system protein  30.77 
 
 
401 aa  212  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.13 
 
 
423 aa  211  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  29.95 
 
 
408 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  34.49 
 
 
410 aa  211  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  31.02 
 
 
405 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  32.18 
 
 
405 aa  211  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  34.96 
 
 
409 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  32.43 
 
 
408 aa  210  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  32.51 
 
 
405 aa  209  5e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>