More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0546 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0546  type IV pilus assembly protein PilC  100 
 
 		 401 aa  791    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0079  type II secretion system protein  49.88 
 
 		 401 aa  382  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3408  type II secretion system protein  47.22 
 
 		 399 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1346  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, type I  38.75 
 
 		 400 aa  300  3e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0642  type II secretion system protein  37.81 
 
 		 401 aa  278  1e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  35.35 
 
 		 401 aa  265  7e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  31.02 
 
 		 406 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  36.25 
 
 		 417 aa  250  3e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  31.86 
 
 		 405 aa  249  6e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  32.02 
 
 		 405 aa  246  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  32.18 
 
 		 405 aa  243  5e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 407 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  32.5 
 
 		 403 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  34.5 
 
 		 402 aa  239  8e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  30.92 
 
 		 404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  31.6 
 
 		 405 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  33.5 
 
 		 401 aa  227  3e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  34.95 
 
 		 405 aa  224  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  31.51 
 
 		 417 aa  222  8e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  31.54 
 
 		 417 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  31.77 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  34.73 
 
 		 401 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  31.33 
 
 		 417 aa  218  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  31.34 
 
 		 401 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0302  Type II secretion system F domain protein  32.19 
 
 		 412 aa  218  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.9 
 
 		 405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  30.15 
 
 		 403 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  31.07 
 
 		 404 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  31.33 
 
 		 419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  29.8 
 
 		 403 aa  216  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  31.17 
 
 		 404 aa  216  5e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  29.87 
 
 		 421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  31.75 
 
 		 409 aa  214  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0885  type II secretion system protein  38.33 
 
 		 400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16871  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  30.35 
 
 		 405 aa  213  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0862  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.21 
 
 		 405 aa  213  7e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  33.01 
 
 		 409 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  29.12 
 
 		 419 aa  211  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  28.21 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  28.86 
 
 		 421 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3255  type II secretion system protein  30.85 
 
 		 403 aa  209  8e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  30.83 
 
 		 406 aa  209  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  29.59 
 
 		 409 aa  208  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  30.3 
 
 		 401 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  31.51 
 
 		 409 aa  207  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  29.35 
 
 		 424 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  29.95 
 
 		 405 aa  206  7e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  30.02 
 
 		 403 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  29.55 
 
 		 405 aa  206  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  28.75 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  30.46 
 
 		 405 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  28.75 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  31.53 
 
 		 408 aa  204  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  30.65 
 
 		 408 aa  204  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1997  Type II secretion system F domain protein  31.6 
 
 		 407 aa  204  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  29.37 
 
 		 404 aa  203  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  29.11 
 
 		 420 aa  203  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  30.54 
 
 		 405 aa  203  5e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  29.11 
 
 		 424 aa  203  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  31.49 
 
 		 408 aa  202  7e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0533  type II secretion system protein  27.46 
 
 		 402 aa  202  7e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  31.53 
 
 		 406 aa  202  9e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0425  type II secretion system protein  32.24 
 
 		 406 aa  202  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126236  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1865  type II secretion system protein  30.1 
 
 		 402 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.334713 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  29.37 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  29 
 
 		 419 aa  200  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  30.2 
 
 		 405 aa  200  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0952  type II secretion system protein  30.5 
 
 		 402 aa  200  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  29.9 
 
 		 408 aa  199  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  29.7 
 
 		 407 aa  199  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  29.22 
 
 		 405 aa  199  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  28.72 
 
 		 406 aa  199  7e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  28.46 
 
 		 406 aa  199  7.999999999999999e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  29.03 
 
 		 405 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0150  type II secretion system protein  29.55 
 
 		 410 aa  199  7.999999999999999e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  28.24 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  29.48 
 
 		 408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  29.32 
 
 		 412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  27.99 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  31.84 
 
 		 408 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  31.19 
 
 		 416 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  30.6 
 
 		 409 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  29.11 
 
 		 409 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  29.21 
 
 		 410 aa  197  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  34.89 
 
 		 433 aa  197  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  31.76 
 
 		 404 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1409  type II secretion system protein  30.32 
 
 		 405 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205741  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.86 
 
 		 423 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0880  type II secretion system protein  30.27 
 
 		 406 aa  196  7e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  34.72 
 
 		 409 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  30.15 
 
 		 417 aa  195  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  28.5 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  33.84 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  29.26 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1784  type IV pilus biogenesis protein PilC, putative  30.94 
 
 		 402 aa  195  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  27.85 
 
 		 420 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  29.28 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02677  general secretion pathway protein F  32.67 
 
 		 405 aa  194  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  31.58 
 
 		 403 aa  194  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  27.99 
 
 		 463 aa  193  5e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>