More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1139 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1139  MSHA biogenesis protein MshG  100 
 
 		 406 aa  831    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  52.72 
 
 		 406 aa  436  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  52.23 
 
 		 406 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4108  MSHA biogenesis protein MshG  52.97 
 
 		 406 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  50.85 
 
 		 406 aa  427  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  49.38 
 
 		 405 aa  425  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  51.24 
 
 		 406 aa  422  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0564  type II secretion system protein  51.73 
 
 		 406 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  50.5 
 
 		 405 aa  424  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3831  type II secretion system protein  52.23 
 
 		 406 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00398408  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0488  type II secretion system protein  51.98 
 
 		 406 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00834812  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0512  type II secretion system protein  51.98 
 
 		 406 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0509  type II secretion system protein  51.98 
 
 		 406 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.013646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0470  type II secretion system protein  52.35 
 
 		 406 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  48.27 
 
 		 404 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0548  type II secretion system protein  50.5 
 
 		 406 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00110848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00255  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshG (pilus type IV)  49.75 
 
 		 411 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3343  type II secretion system protein  49.5 
 
 		 405 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000142203  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  49.51 
 
 		 406 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  47.5 
 
 		 409 aa  388  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  46.31 
 
 		 407 aa  385  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  45.57 
 
 		 408 aa  380  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2824  MSHA biogenesis protein MshG  47.15 
 
 		 407 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  44.8 
 
 		 407 aa  372  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4572  MSHA biogenesis protein MshG  47.65 
 
 		 408 aa  361  1e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0753  type II secretory pathway component PulF  44.85 
 
 		 407 aa  360  3e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  43.81 
 
 		 408 aa  354  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0880  type II secretion system protein  45.54 
 
 		 406 aa  352  5e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  43.32 
 
 		 406 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3270  general secretory pathway protein F  42.33 
 
 		 406 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3361  type II secretion system protein  42.61 
 
 		 412 aa  323  3e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3098  type II secretion system protein  42.01 
 
 		 412 aa  318  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  34.08 
 
 		 405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  34.65 
 
 		 405 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  32.34 
 
 		 406 aa  250  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  33.5 
 
 		 408 aa  249  5e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  32.66 
 
 		 419 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  33.5 
 
 		 409 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  31.92 
 
 		 404 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  33.17 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  34.83 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  33.42 
 
 		 408 aa  241  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  34.07 
 
 		 405 aa  240  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  31.92 
 
 		 407 aa  240  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  32.59 
 
 		 405 aa  239  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  33.17 
 
 		 405 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  32.91 
 
 		 417 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  33.25 
 
 		 402 aa  239  9e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  30.67 
 
 		 406 aa  239  9e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  32.1 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  32.91 
 
 		 417 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  32.25 
 
 		 417 aa  238  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  32.35 
 
 		 405 aa  238  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  32.67 
 
 		 417 aa  238  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  30.79 
 
 		 404 aa  237  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  30.79 
 
 		 405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  32.67 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  35.47 
 
 		 403 aa  234  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  31.85 
 
 		 408 aa  233  6e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  32.1 
 
 		 405 aa  232  9e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  32.36 
 
 		 405 aa  232  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  32.19 
 
 		 403 aa  230  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  31.39 
 
 		 409 aa  229  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  31.96 
 
 		 410 aa  229  6e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  32.84 
 
 		 405 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  32.01 
 
 		 407 aa  228  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  32.1 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  30.71 
 
 		 408 aa  227  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  31.34 
 
 		 403 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  30.64 
 
 		 406 aa  226  8e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  31.84 
 
 		 404 aa  225  9e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0302  Type II secretion system F domain protein  30.94 
 
 		 412 aa  224  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  32.37 
 
 		 409 aa  224  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  30.67 
 
 		 401 aa  223  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  31.28 
 
 		 423 aa  223  7e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  31.28 
 
 		 416 aa  221  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  31.02 
 
 		 403 aa  221  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  30.45 
 
 		 421 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1409  type II secretion system protein  29.48 
 
 		 405 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205741  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  30.3 
 
 		 417 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1997  Type II secretion system F domain protein  30.45 
 
 		 407 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.77 
 
 		 423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  30.92 
 
 		 424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  30.92 
 
 		 420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0952  type II secretion system protein  32.51 
 
 		 402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  29.98 
 
 		 419 aa  220  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  28.78 
 
 		 403 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  32.56 
 
 		 404 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  29.02 
 
 		 419 aa  220  3.9999999999999997e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  32.56 
 
 		 404 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  31.36 
 
 		 424 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  30.54 
 
 		 422 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  33.04 
 
 		 407 aa  219  7e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  27.61 
 
 		 401 aa  219  7e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  31.44 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.22 
 
 		 419 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  31.76 
 
 		 406 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  29.46 
 
 		 402 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0079  type II secretion system protein  30.54 
 
 		 401 aa  217  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  32.92 
 
 		 409 aa  218  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>