More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0880 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0880  type II secretion system protein  100 
 
 		 406 aa  812    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3098  type II secretion system protein  58.64 
 
 		 412 aa  466  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0753  type II secretory pathway component PulF  54.19 
 
 		 407 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3361  type II secretion system protein  54.99 
 
 		 412 aa  443  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  47.12 
 
 		 405 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  47.52 
 
 		 408 aa  381  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  44.42 
 
 		 406 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  44.23 
 
 		 409 aa  378  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  44.67 
 
 		 406 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0548  type II secretion system protein  44.28 
 
 		 406 aa  371  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00110848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  42.79 
 
 		 406 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3270  general secretory pathway protein F  46.53 
 
 		 406 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3343  type II secretion system protein  43.18 
 
 		 405 aa  366  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000142203  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  42.04 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0470  type II secretion system protein  44.17 
 
 		 406 aa  365  1e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1139  MSHA biogenesis protein MshG  45.54 
 
 		 406 aa  364  2e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  44.09 
 
 		 406 aa  360  2e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  43.81 
 
 		 406 aa  360  3e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3831  type II secretion system protein  44.03 
 
 		 406 aa  359  5e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00398408  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4108  MSHA biogenesis protein MshG  43.53 
 
 		 406 aa  359  6e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0564  type II secretion system protein  43.28 
 
 		 406 aa  358  9e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0488  type II secretion system protein  43.78 
 
 		 406 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00834812  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0509  type II secretion system protein  43.78 
 
 		 406 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.013646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0512  type II secretion system protein  43.78 
 
 		 406 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  42.43 
 
 		 405 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00255  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshG (pilus type IV)  41.83 
 
 		 411 aa  356  5e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  42.79 
 
 		 408 aa  353  2e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  42.47 
 
 		 406 aa  347  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  41.71 
 
 		 407 aa  345  7e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4572  MSHA biogenesis protein MshG  44.55 
 
 		 408 aa  342  5e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2824  MSHA biogenesis protein MshG  41.75 
 
 		 407 aa  336  5e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  40.45 
 
 		 407 aa  333  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  37.25 
 
 		 408 aa  282  9e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  35.78 
 
 		 405 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  35.56 
 
 		 408 aa  258  9e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  34.99 
 
 		 405 aa  257  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  36.79 
 
 		 406 aa  256  6e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  32.68 
 
 		 406 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  33.83 
 
 		 405 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  33.17 
 
 		 405 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  34.42 
 
 		 409 aa  252  7e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  37.94 
 
 		 402 aa  252  7e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1997  Type II secretion system F domain protein  31.68 
 
 		 407 aa  252  7e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  32.1 
 
 		 404 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  33.5 
 
 		 410 aa  251  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1409  type II secretion system protein  33.91 
 
 		 405 aa  251  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205741  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  36.91 
 
 		 403 aa  250  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  34.99 
 
 		 406 aa  249  9e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  33.67 
 
 		 405 aa  244  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  34.8 
 
 		 401 aa  241  2e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  32.75 
 
 		 417 aa  239  5.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  35.25 
 
 		 433 aa  239  6.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  32.32 
 
 		 401 aa  239  8e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  31.27 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  32.75 
 
 		 408 aa  237  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  32 
 
 		 403 aa  238  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  32.08 
 
 		 404 aa  236  4e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  32.92 
 
 		 424 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  32.92 
 
 		 405 aa  236  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  31.86 
 
 		 409 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  32.92 
 
 		 420 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  32.67 
 
 		 405 aa  236  8e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  31.68 
 
 		 407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  31.6 
 
 		 406 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  32.5 
 
 		 404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  33.5 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  32.01 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  33.17 
 
 		 417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  32.5 
 
 		 404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  32.67 
 
 		 421 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  35.59 
 
 		 411 aa  233  6e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  32.75 
 
 		 422 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  32.59 
 
 		 408 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  37.27 
 
 		 410 aa  231  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  31.44 
 
 		 407 aa  231  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  32.59 
 
 		 402 aa  229  6e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  34.58 
 
 		 403 aa  229  7e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  32.67 
 
 		 463 aa  229  8e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  32.67 
 
 		 463 aa  229  9e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  31.92 
 
 		 405 aa  229  9e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  32.84 
 
 		 401 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  31.42 
 
 		 408 aa  227  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  32.19 
 
 		 409 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  31.27 
 
 		 404 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  32.92 
 
 		 407 aa  227  4e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  31.42 
 
 		 424 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  31.19 
 
 		 420 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  31 
 
 		 407 aa  225  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  32.25 
 
 		 405 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  30.52 
 
 		 403 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  32.75 
 
 		 409 aa  224  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  33.99 
 
 		 409 aa  224  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0718  general secretion pathway protein F  32.43 
 
 		 409 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  31.91 
 
 		 405 aa  224  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0533  type II secretion system protein  31.33 
 
 		 402 aa  223  3e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0719  general secretion pathway protein F  32.43 
 
 		 409 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.975907  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  31.3 
 
 		 405 aa  223  6e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  32.17 
 
 		 421 aa  223  7e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3606  type II secretion system protein  32.92 
 
 		 421 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  32.59 
 
 		 403 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>