More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3361 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3361  type II secretion system protein  100 
 
 		 412 aa  826    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0880  type II secretion system protein  54.99 
 
 		 406 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0753  type II secretory pathway component PulF  53.47 
 
 		 407 aa  411  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  47.76 
 
 		 406 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  47.26 
 
 		 406 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  47.26 
 
 		 405 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  46.81 
 
 		 405 aa  390  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  46.02 
 
 		 406 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  47.06 
 
 		 409 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3343  type II secretion system protein  45.83 
 
 		 405 aa  379  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000142203  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0470  type II secretion system protein  47.01 
 
 		 406 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  46.15 
 
 		 404 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  44.91 
 
 		 408 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0548  type II secretion system protein  47.26 
 
 		 406 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00110848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  46.6 
 
 		 406 aa  372  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4108  MSHA biogenesis protein MshG  46.77 
 
 		 406 aa  375  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3098  type II secretion system protein  50.12 
 
 		 412 aa  375  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0564  type II secretion system protein  46.52 
 
 		 406 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  46.27 
 
 		 406 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0488  type II secretion system protein  45.52 
 
 		 406 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00834812  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3831  type II secretion system protein  45.52 
 
 		 406 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00398408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0509  type II secretion system protein  45.52 
 
 		 406 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.013646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0512  type II secretion system protein  45.27 
 
 		 406 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  44.77 
 
 		 407 aa  363  3e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00255  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshG (pilus type IV)  44.15 
 
 		 411 aa  362  6e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  44.28 
 
 		 407 aa  361  1e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3270  general secretory pathway protein F  47.54 
 
 		 406 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  43.69 
 
 		 408 aa  342  5e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4572  MSHA biogenesis protein MshG  45.59 
 
 		 408 aa  341  1e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1139  MSHA biogenesis protein MshG  42.61 
 
 		 406 aa  337  2.9999999999999997e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2824  MSHA biogenesis protein MshG  44.12 
 
 		 407 aa  334  1e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  41.77 
 
 		 406 aa  334  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1997  Type II secretion system F domain protein  35.48 
 
 		 407 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  33.74 
 
 		 406 aa  243  3.9999999999999997e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  35.19 
 
 		 409 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1409  type II secretion system protein  33.82 
 
 		 405 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205741  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  32.59 
 
 		 403 aa  237  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  34.23 
 
 		 405 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  34.24 
 
 		 408 aa  236  5.0000000000000005e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2175  type II secretion system protein  33.99 
 
 		 410 aa  236  8e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357882  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  35.98 
 
 		 406 aa  235  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  38.05 
 
 		 404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  38.05 
 
 		 404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  34.99 
 
 		 408 aa  229  5e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  32.35 
 
 		 422 aa  227  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  33.25 
 
 		 422 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  31.48 
 
 		 410 aa  227  3e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  32.76 
 
 		 405 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  33.92 
 
 		 404 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  32.92 
 
 		 423 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  32.84 
 
 		 408 aa  224  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  30.85 
 
 		 403 aa  225  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  32.84 
 
 		 403 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  34.24 
 
 		 420 aa  225  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  32.34 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  32.59 
 
 		 419 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  29.41 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  33.33 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  32.75 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  32.27 
 
 		 408 aa  223  6e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  32.42 
 
 		 424 aa  222  9e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  32.27 
 
 		 463 aa  222  9e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.27 
 
 		 405 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  36.28 
 
 		 407 aa  222  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  32.42 
 
 		 420 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  35.88 
 
 		 407 aa  221  9.999999999999999e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  32.27 
 
 		 463 aa  222  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  32.26 
 
 		 405 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  33.42 
 
 		 403 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  31.76 
 
 		 404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  32.19 
 
 		 423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  30.15 
 
 		 406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  31 
 
 		 419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  32.35 
 
 		 402 aa  220  3e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0063  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilC  31.92 
 
 		 407 aa  219  5e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000657868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  32.43 
 
 		 405 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3424  type II secretion system protein  33.17 
 
 		 421 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.760778  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  33.5 
 
 		 402 aa  219  8.999999999999998e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  32.01 
 
 		 419 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  32.51 
 
 		 419 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  30.35 
 
 		 401 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  31.51 
 
 		 401 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  32.93 
 
 		 406 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4061  type II secretion system protein  32.92 
 
 		 423 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.505472 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  32.19 
 
 		 422 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  31.68 
 
 		 419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  32.01 
 
 		 421 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  31.93 
 
 		 405 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  31.59 
 
 		 424 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0424  type II secretion system protein  32.01 
 
 		 421 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440885 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3943  type II secretion system protein  33 
 
 		 423 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2185  Type II secretion system F domain protein  33.75 
 
 		 403 aa  215  9e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.170941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  31.27 
 
 		 407 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  31.58 
 
 		 417 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.85 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  35.1 
 
 		 433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  31.33 
 
 		 409 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  31.09 
 
 		 405 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0068  type II secretion system protein  31.84 
 
 		 407 aa  214  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000163403  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.85 
 
 		 405 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>