More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0753 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0753  type II secretory pathway component PulF  100 
 
 		 407 aa  806    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0880  type II secretion system protein  54.19 
 
 		 406 aa  434  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3098  type II secretion system protein  54.77 
 
 		 412 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  48.4 
 
 		 409 aa  396  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3361  type II secretion system protein  53.47 
 
 		 412 aa  393  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  46.52 
 
 		 406 aa  391  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  45.5 
 
 		 405 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  43.28 
 
 		 406 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3343  type II secretion system protein  43.92 
 
 		 405 aa  373  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000142203  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  43.78 
 
 		 404 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  46.29 
 
 		 407 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  43.92 
 
 		 405 aa  366  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  45.37 
 
 		 408 aa  365  1e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00255  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshG (pilus type IV)  43.07 
 
 		 411 aa  363  4e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  44.31 
 
 		 406 aa  363  4e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0548  type II secretion system protein  43.28 
 
 		 406 aa  362  6e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00110848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  44.17 
 
 		 406 aa  360  2e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  42.93 
 
 		 406 aa  360  3e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  45.19 
 
 		 407 aa  359  4e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0564  type II secretion system protein  43.53 
 
 		 406 aa  358  7e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0470  type II secretion system protein  43.53 
 
 		 406 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4108  MSHA biogenesis protein MshG  43.81 
 
 		 406 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3270  general secretory pathway protein F  47.04 
 
 		 406 aa  354  1e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3831  type II secretion system protein  42.79 
 
 		 406 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00398408  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1139  MSHA biogenesis protein MshG  44.2 
 
 		 406 aa  353  4e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0512  type II secretion system protein  42.54 
 
 		 406 aa  352  5e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  45.83 
 
 		 406 aa  352  5.9999999999999994e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0488  type II secretion system protein  42.54 
 
 		 406 aa  352  7e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00834812  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0509  type II secretion system protein  42.54 
 
 		 406 aa  352  7e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.013646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  44.96 
 
 		 408 aa  347  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2824  MSHA biogenesis protein MshG  44.47 
 
 		 407 aa  347  2e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4572  MSHA biogenesis protein MshG  42.89 
 
 		 408 aa  328  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  36.86 
 
 		 408 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  32.11 
 
 		 406 aa  249  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  32.67 
 
 		 405 aa  249  9e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  33.99 
 
 		 405 aa  247  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1997  Type II secretion system F domain protein  33.91 
 
 		 407 aa  246  4e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  34.81 
 
 		 408 aa  246  4e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  34.16 
 
 		 408 aa  246  4e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  34.65 
 
 		 409 aa  246  4e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  33.83 
 
 		 405 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  34.49 
 
 		 417 aa  245  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  35.73 
 
 		 411 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  31.67 
 
 		 404 aa  243  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  35.24 
 
 		 403 aa  243  6e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  32.19 
 
 		 405 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  32.51 
 
 		 405 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  32.84 
 
 		 405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  34.16 
 
 		 405 aa  239  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  32.27 
 
 		 405 aa  239  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  32.08 
 
 		 401 aa  239  8e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  34.32 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  31.28 
 
 		 409 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1409  type II secretion system protein  32.26 
 
 		 405 aa  236  7e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205741  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  32.92 
 
 		 409 aa  235  9e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  32.1 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  33.42 
 
 		 407 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  32.92 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  31.76 
 
 		 419 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  33.33 
 
 		 401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.86 
 
 		 423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  31.68 
 
 		 410 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  36.05 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  32.59 
 
 		 419 aa  233  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  33.42 
 
 		 406 aa  233  4.0000000000000004e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  32.35 
 
 		 405 aa  233  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  32.35 
 
 		 405 aa  232  8.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  33.17 
 
 		 417 aa  232  8.000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  31.14 
 
 		 405 aa  232  9e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  31.6 
 
 		 406 aa  232  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  32.18 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  32.01 
 
 		 407 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  33.99 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  33.75 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  32.67 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  32.51 
 
 		 403 aa  230  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  32.1 
 
 		 402 aa  230  4e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  32.01 
 
 		 463 aa  229  6e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.7 
 
 		 402 aa  229  8e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  32.01 
 
 		 463 aa  229  8e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  31.13 
 
 		 422 aa  229  9e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  30.86 
 
 		 408 aa  228  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  30.6 
 
 		 403 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  32.34 
 
 		 405 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  29.75 
 
 		 417 aa  227  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  32.01 
 
 		 404 aa  227  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  33.17 
 
 		 419 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  31.13 
 
 		 423 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  30.27 
 
 		 406 aa  226  6e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  33 
 
 		 424 aa  226  6e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  32.51 
 
 		 420 aa  226  7e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  31.93 
 
 		 405 aa  226  8e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  31.36 
 
 		 403 aa  225  9e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0063  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilC  31.05 
 
 		 407 aa  225  1e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000657868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  33.06 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  33.06 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  37.16 
 
 		 403 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  35.17 
 
 		 404 aa  222  8e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.05 
 
 		 419 aa  221  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>