More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3270 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3270  general secretory pathway protein F  100 
 
 		 406 aa  808    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  49.51 
 
 		 408 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  46.63 
 
 		 405 aa  391  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  45.16 
 
 		 406 aa  384  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0880  type II secretion system protein  46.53 
 
 		 406 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0753  type II secretory pathway component PulF  47.04 
 
 		 407 aa  380  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  43.92 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  43.92 
 
 		 405 aa  381  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  44.17 
 
 		 406 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  44.31 
 
 		 404 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4108  MSHA biogenesis protein MshG  45.3 
 
 		 406 aa  378  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  43.92 
 
 		 406 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  44.94 
 
 		 408 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3831  type II secretion system protein  43.81 
 
 		 406 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00398408  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0470  type II secretion system protein  43.92 
 
 		 406 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0488  type II secretion system protein  43.42 
 
 		 406 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00834812  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  45.79 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0564  type II secretion system protein  43.42 
 
 		 406 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  45.54 
 
 		 407 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0509  type II secretion system protein  43.42 
 
 		 406 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.013646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  44.42 
 
 		 406 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0512  type II secretion system protein  43.56 
 
 		 406 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3361  type II secretion system protein  47.54 
 
 		 412 aa  366  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  47.76 
 
 		 406 aa  366  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3343  type II secretion system protein  42.82 
 
 		 405 aa  365  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000142203  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  45 
 
 		 409 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00255  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshG (pilus type IV)  43.07 
 
 		 411 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0548  type II secretion system protein  44.31 
 
 		 406 aa  364  1e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00110848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2824  MSHA biogenesis protein MshG  45.02 
 
 		 407 aa  350  3e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3098  type II secretion system protein  46.1 
 
 		 412 aa  348  7e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1139  MSHA biogenesis protein MshG  42.33 
 
 		 406 aa  345  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4572  MSHA biogenesis protein MshG  43.03 
 
 		 408 aa  324  2e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  37.92 
 
 		 408 aa  300  3e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  36.5 
 
 		 409 aa  276  4e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  35.14 
 
 		 405 aa  273  3e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1409  type II secretion system protein  35.87 
 
 		 405 aa  272  7e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205741  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1997  Type II secretion system F domain protein  32.76 
 
 		 407 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  34.9 
 
 		 406 aa  265  1e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  34.84 
 
 		 417 aa  259  5.0000000000000005e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  32.84 
 
 		 405 aa  259  7e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  34.65 
 
 		 408 aa  258  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  34.8 
 
 		 407 aa  257  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  33.42 
 
 		 405 aa  256  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  32.84 
 
 		 407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  32.92 
 
 		 405 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  37.78 
 
 		 433 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  33.42 
 
 		 405 aa  253  6e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  34.16 
 
 		 406 aa  251  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  35.73 
 
 		 402 aa  251  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  32.84 
 
 		 410 aa  250  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  34.56 
 
 		 405 aa  248  9e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  33.82 
 
 		 409 aa  249  9e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  32.04 
 
 		 406 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  29.98 
 
 		 403 aa  246  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  32.59 
 
 		 408 aa  245  8e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  33.89 
 
 		 406 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  35.54 
 
 		 409 aa  242  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  35.21 
 
 		 401 aa  242  9e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  31.59 
 
 		 408 aa  241  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  33.25 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  32.01 
 
 		 405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  33.5 
 
 		 404 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  32.67 
 
 		 403 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  34.33 
 
 		 403 aa  239  5.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  30.54 
 
 		 401 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  32.5 
 
 		 404 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  33.75 
 
 		 401 aa  239  8e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  30.67 
 
 		 405 aa  238  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  34.07 
 
 		 403 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  30.92 
 
 		 405 aa  238  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  32.04 
 
 		 407 aa  236  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 402 aa  235  9e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  33.66 
 
 		 411 aa  235  9e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  31.42 
 
 		 406 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1745  type II secretion system protein  35.31 
 
 		 377 aa  234  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  29.85 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  30.79 
 
 		 404 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  30.79 
 
 		 404 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  31.5 
 
 		 404 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0719  general secretion pathway protein F  35.54 
 
 		 409 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.975907  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0952  type II secretion system protein  33.92 
 
 		 402 aa  232  8.000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0718  general secretion pathway protein F  35.54 
 
 		 409 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  31.13 
 
 		 404 aa  231  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  30.67 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  31.59 
 
 		 409 aa  230  3e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  32.84 
 
 		 403 aa  229  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  32.06 
 
 		 463 aa  229  6e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  31.58 
 
 		 417 aa  229  6e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  31.51 
 
 		 405 aa  229  9e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2894  general secretion pathway protein F  31.54 
 
 		 410 aa  229  9e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196755  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  31.82 
 
 		 463 aa  228  1e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  30.96 
 
 		 416 aa  228  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  31.51 
 
 		 405 aa  228  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  33.99 
 
 		 412 aa  228  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  31.42 
 
 		 406 aa  227  3e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  31.27 
 
 		 409 aa  227  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  32.77 
 
 		 410 aa  226  6e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1053  type II secretion system protein  33.5 
 
 		 401 aa  226  7e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000304141  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  31 
 
 		 417 aa  225  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  32.09 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>