More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2707 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2707  type II secretion system protein  100 
 
 
401 aa  806    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  37.31 
 
 
417 aa  288  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  37.59 
 
 
402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  34.52 
 
 
403 aa  281  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  35.61 
 
 
401 aa  279  8e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  33.91 
 
 
406 aa  270  5e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  36.04 
 
 
405 aa  268  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  35.93 
 
 
410 aa  266  4e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  36.36 
 
 
401 aa  265  8e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  36.79 
 
 
409 aa  265  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  33.08 
 
 
405 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  35.16 
 
 
409 aa  262  8.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  32.59 
 
 
405 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  36.39 
 
 
433 aa  261  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  32.84 
 
 
405 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  34.42 
 
 
406 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  32.68 
 
 
405 aa  256  5e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  33.09 
 
 
407 aa  256  6e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  34.81 
 
 
411 aa  255  8e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  34.28 
 
 
403 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  34.15 
 
 
408 aa  253  4.0000000000000004e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  32.6 
 
 
404 aa  251  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  34.41 
 
 
401 aa  252  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  33.58 
 
 
405 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  33.83 
 
 
409 aa  248  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  32.11 
 
 
417 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  34.91 
 
 
417 aa  247  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  36.98 
 
 
409 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  31.62 
 
 
417 aa  245  8e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  34.94 
 
 
404 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  34.94 
 
 
404 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  33.75 
 
 
410 aa  244  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  31.62 
 
 
417 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  33.66 
 
 
406 aa  243  5e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  32.32 
 
 
404 aa  242  7e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  32.82 
 
 
403 aa  242  9e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  32.41 
 
 
419 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  33.25 
 
 
403 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  32.91 
 
 
407 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  33.33 
 
 
406 aa  240  2.9999999999999997e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  37.2 
 
 
419 aa  239  4e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  35.29 
 
 
401 aa  239  5e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  33.5 
 
 
403 aa  238  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  37.17 
 
 
404 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  32.75 
 
 
407 aa  236  8e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  35.38 
 
 
409 aa  235  8e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  32.43 
 
 
405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  35.81 
 
 
401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  34.34 
 
 
409 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  32.3 
 
 
422 aa  233  4.0000000000000004e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  30.57 
 
 
407 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  34.51 
 
 
404 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  31.44 
 
 
405 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1745  type II secretion system protein  36.5 
 
 
377 aa  231  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41063  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  33.42 
 
 
406 aa  231  2e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0719  general secretion pathway protein F  34.09 
 
 
409 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.975907  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0718  general secretion pathway protein F  34.09 
 
 
409 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3255  type II secretion system protein  32.08 
 
 
403 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  30.15 
 
 
405 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2101  type II secretion system protein  32.89 
 
 
404 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  30.15 
 
 
405 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  30.63 
 
 
409 aa  226  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  29.75 
 
 
408 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  30.03 
 
 
402 aa  226  8e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  32.16 
 
 
403 aa  224  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  33.33 
 
 
412 aa  223  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  30.17 
 
 
409 aa  222  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  30.89 
 
 
405 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  30 
 
 
407 aa  220  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  33.08 
 
 
416 aa  220  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  30.63 
 
 
405 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0681  type II secretion system protein  34.91 
 
 
407 aa  219  5e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.524718  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  29.82 
 
 
405 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  30.77 
 
 
424 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0753  type II secretory pathway component PulF  31.58 
 
 
407 aa  218  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347223  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  33.53 
 
 
463 aa  218  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  33.53 
 
 
463 aa  218  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1164  type II secretion system protein  31.99 
 
 
401 aa  218  2e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  29.57 
 
 
405 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_002936  DET1352  pilin biogenesis protein, putative  31.06 
 
 
401 aa  216  4e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.291747  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  28.57 
 
 
421 aa  216  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  29.29 
 
 
408 aa  216  5e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  30.52 
 
 
412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2894  general secretion pathway protein F  31.58 
 
 
410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196755  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  30.92 
 
 
406 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3173  general secretion pathway protein F  31.23 
 
 
403 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131882  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  31.68 
 
 
409 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0952  type II secretion system protein  31.49 
 
 
402 aa  213  5.999999999999999e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  34.15 
 
 
419 aa  213  5.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  28.76 
 
 
408 aa  212  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2175  type II secretion system protein  32.45 
 
 
410 aa  211  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357882  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  31.04 
 
 
421 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  29.24 
 
 
405 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  29.53 
 
 
408 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2209  general secretion pathway protein F  29.77 
 
 
399 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616736  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2903  type II secretion system protein  30.73 
 
 
405 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  31.42 
 
 
419 aa  211  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  30.03 
 
 
403 aa  210  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1134  type II secretion system protein  30.81 
 
 
401 aa  210  3e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  31.94 
 
 
417 aa  211  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>