More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4159 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4159  type II secretion system protein  100 
 
 
427 aa  838    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287604 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0687  type II secretion system protein  74.24 
 
 
416 aa  537  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1300  type II secretion system protein  61.31 
 
 
405 aa  500  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0254672 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2894  general secretion pathway protein F  41.31 
 
 
410 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196755  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2090  type II secretion system protein  35.6 
 
 
402 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0804302  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1115  general secretion pathway protein F  40.29 
 
 
364 aa  236  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  32.55 
 
 
401 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  31.75 
 
 
405 aa  232  9e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  27.96 
 
 
404 aa  228  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  28.67 
 
 
405 aa  228  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02677  general secretion pathway protein F  33.49 
 
 
405 aa  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  29.62 
 
 
405 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  27.73 
 
 
406 aa  222  9e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  31.52 
 
 
419 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1923  type II secretion system protein  30.54 
 
 
402 aa  216  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.919085  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0857  general secretory pathway protein F  34.35 
 
 
405 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  31.97 
 
 
402 aa  215  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.01 
 
 
405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  32.68 
 
 
401 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0770  type II secretion system protein  33.88 
 
 
405 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  31.6 
 
 
401 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18690  type II secretion system protein  28.87 
 
 
410 aa  211  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3665  type II secretion system protein  30.35 
 
 
395 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  27.96 
 
 
407 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  28.2 
 
 
405 aa  210  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  31.86 
 
 
404 aa  209  5e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  32.15 
 
 
409 aa  209  7e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  30.88 
 
 
417 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  28.7 
 
 
419 aa  208  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2182  general secretion pathway protein F  31.38 
 
 
399 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  32.01 
 
 
406 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  30.88 
 
 
417 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  29.23 
 
 
422 aa  206  4e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  30.57 
 
 
404 aa  207  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3255  type II secretion system protein  30.97 
 
 
403 aa  207  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  29.91 
 
 
409 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  30.88 
 
 
417 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  32.64 
 
 
404 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1784  type IV pilus biogenesis protein PilC, putative  30.9 
 
 
402 aa  205  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3116  general secretory pathway F transmembrane protein  35.76 
 
 
403 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205783  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0880  type II secretion system protein  30.63 
 
 
406 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1865  type II secretion system protein  30.23 
 
 
402 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.334713 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3361  type II secretion system protein  30.65 
 
 
412 aa  204  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  31.34 
 
 
409 aa  204  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3098  type II secretion system protein  31.62 
 
 
412 aa  204  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0547  type II secretion system protein  32.08 
 
 
406 aa  203  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0476697 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  31.44 
 
 
417 aa  203  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3086  type II secretion system protein  33.33 
 
 
439 aa  203  5e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  29.15 
 
 
406 aa  202  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  29.5 
 
 
408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3054  general secretion pathway protein F  34.81 
 
 
403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  29.47 
 
 
401 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  27.16 
 
 
401 aa  199  6e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  30.55 
 
 
403 aa  199  6e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3401  general secretion pathway protein F  34.12 
 
 
403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.54461 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  32.18 
 
 
405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  26.59 
 
 
403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  34.22 
 
 
409 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  29.79 
 
 
420 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  30.26 
 
 
406 aa  198  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  26.92 
 
 
401 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2707  type II secretion system protein  33.43 
 
 
401 aa  196  6e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  31.95 
 
 
405 aa  196  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  33.18 
 
 
405 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2371  general secretion pathway protein F  32.39 
 
 
410 aa  195  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  29.88 
 
 
407 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.81 
 
 
423 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  32.94 
 
 
405 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  28 
 
 
404 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  32.94 
 
 
405 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  32.94 
 
 
405 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  32.94 
 
 
405 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  31.69 
 
 
409 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  29.88 
 
 
407 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  29.88 
 
 
407 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  32.94 
 
 
405 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  32.94 
 
 
405 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  32.94 
 
 
405 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  28 
 
 
404 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1450  type II secretion system protein  33.62 
 
 
405 aa  195  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  29.29 
 
 
405 aa  195  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  28.71 
 
 
407 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  29.88 
 
 
407 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0719  general secretion pathway protein F  31.46 
 
 
409 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.975907  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3072  general secretion pathway protein F  31.71 
 
 
405 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000734436 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0718  general secretion pathway protein F  31.46 
 
 
409 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1278  type II secretion system protein  30.75 
 
 
401 aa  195  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  29.29 
 
 
405 aa  194  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  27.01 
 
 
405 aa  194  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  28.13 
 
 
422 aa  194  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  27.86 
 
 
421 aa  193  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  32.57 
 
 
402 aa  193  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  30.7 
 
 
412 aa  193  6e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  29.45 
 
 
408 aa  193  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  29.41 
 
 
407 aa  192  7e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3231  general secretion pathway protein F  33.41 
 
 
405 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0101612  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  27.62 
 
 
421 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  29.65 
 
 
407 aa  192  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  28.74 
 
 
423 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  27.62 
 
 
424 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>