More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0687 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0687  type II secretion system protein  100 
 
 		 416 aa  809    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4159  type II secretion system protein  74.24 
 
 		 427 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287604 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1300  type II secretion system protein  60.34 
 
 		 405 aa  481  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254672 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2894  general secretion pathway protein F  40.24 
 
 		 410 aa  298  8e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196755  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2090  type II secretion system protein  38.94 
 
 		 402 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0804302  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1115  general secretion pathway protein F  39.83 
 
 		 364 aa  238  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  30.75 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18690  type II secretion system protein  31.33 
 
 		 410 aa  228  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  31.9 
 
 		 401 aa  227  3e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  34.98 
 
 		 402 aa  225  9e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  29.2 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  28.71 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3665  type II secretion system protein  31.81 
 
 		 395 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  29.2 
 
 		 405 aa  224  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  27.73 
 
 		 406 aa  224  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  31.89 
 
 		 422 aa  223  4e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  30.75 
 
 		 405 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  33.17 
 
 		 409 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  31.63 
 
 		 419 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  30.54 
 
 		 408 aa  219  7.999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  30.57 
 
 		 419 aa  218  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  34.06 
 
 		 404 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  31.87 
 
 		 401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2182  general secretion pathway protein F  33.9 
 
 		 399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02677  general secretion pathway protein F  34.87 
 
 		 405 aa  216  8e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.23 
 
 		 402 aa  215  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  28.78 
 
 		 417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  27.73 
 
 		 407 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  29.02 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5703  general secretion pathway protein F  35.32 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0555477  normal  0.0587373 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  31.57 
 
 		 409 aa  210  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  30 
 
 		 403 aa  210  5e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  30.9 
 
 		 404 aa  209  5e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  28.29 
 
 		 417 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.06 
 
 		 405 aa  209  9e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3072  general secretion pathway protein F  34.7 
 
 		 405 aa  209  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000734436 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  30.94 
 
 		 401 aa  208  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55430  putative type II secretion system protein  34.78 
 
 		 404 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000716105  normal  0.0429131 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3361  type II secretion system protein  32.73 
 
 		 412 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  27.56 
 
 		 405 aa  207  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3086  type II secretion system protein  34.32 
 
 		 439 aa  206  5e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3116  general secretory pathway F transmembrane protein  35.99 
 
 		 403 aa  206  7e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2707  type II secretion system protein  31.62 
 
 		 401 aa  206  7e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4823  putative type II secretion system protein  34.54 
 
 		 404 aa  205  9e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0274243  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.99 
 
 		 423 aa  205  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  28.85 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0425  type II secretion system protein  30.22 
 
 		 406 aa  205  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126236  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1450  type II secretion system protein  32.29 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  33.73 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  29.16 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  28.95 
 
 		 405 aa  204  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3401  general secretion pathway protein F  36.14 
 
 		 403 aa  203  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.54461 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3098  type II secretion system protein  30.86 
 
 		 412 aa  203  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3054  general secretion pathway protein F  36.39 
 
 		 403 aa  203  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  30.27 
 
 		 423 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  33.73 
 
 		 405 aa  203  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  28.64 
 
 		 405 aa  202  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0547  type II secretion system protein  34.14 
 
 		 406 aa  202  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0476697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0880  type II secretion system protein  31.01 
 
 		 406 aa  202  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  31.07 
 
 		 406 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0770  type II secretion system protein  33.57 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0857  general secretory pathway protein F  33.57 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3255  type II secretion system protein  29.37 
 
 		 403 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  30.58 
 
 		 420 aa  199  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  32.21 
 
 		 409 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  29.3 
 
 		 408 aa  199  5e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  30.9 
 
 		 409 aa  200  5e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  29.1 
 
 		 409 aa  199  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  34.42 
 
 		 409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  28.47 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  29.1 
 
 		 407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  29.33 
 
 		 406 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  29.64 
 
 		 408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  29.47 
 
 		 407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1923  type II secretion system protein  29.48 
 
 		 402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.919085  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  33.33 
 
 		 405 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.43 
 
 		 419 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  26.99 
 
 		 405 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  29.23 
 
 		 405 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0061  general secretion pathway protein F  33.33 
 
 		 405 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  29.61 
 
 		 417 aa  196  5.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  29.27 
 
 		 422 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  29.78 
 
 		 422 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  32.85 
 
 		 405 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2209  general secretion pathway protein F  32.61 
 
 		 399 aa  196  6e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  28.61 
 
 		 408 aa  196  7e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  28.16 
 
 		 405 aa  196  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0753  type II secretory pathway component PulF  30.05 
 
 		 407 aa  196  7e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  31.01 
 
 		 411 aa  196  8.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.16 
 
 		 405 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  30.27 
 
 		 408 aa  196  8.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3173  general secretion pathway protein F  31.88 
 
 		 403 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131882  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00603  general secretion pathway protein F  26.57 
 
 		 406 aa  196  8.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  32.85 
 
 		 405 aa  196  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  32.85 
 
 		 405 aa  196  9e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  33.82 
 
 		 412 aa  196  9e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  32.85 
 
 		 405 aa  196  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2371  general secretion pathway protein F  34.22 
 
 		 410 aa  196  9e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  32.85 
 
 		 405 aa  196  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  32.85 
 
 		 405 aa  196  9e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>