More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2182 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2182  general secretion pathway protein F  100 
 
 		 399 aa  784    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3150  type II secretion system protein  61.85 
 
 		 400 aa  421  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3316  general secretion pathway protein F  61.1 
 
 		 400 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.233572  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02677  general secretion pathway protein F  45.21 
 
 		 405 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0547  type II secretion system protein  46.55 
 
 		 406 aa  298  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0476697 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0857  general secretory pathway protein F  44.2 
 
 		 405 aa  291  1e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0770  type II secretion system protein  43.95 
 
 		 405 aa  288  2e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2894  general secretion pathway protein F  38.39 
 
 		 410 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196755  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  33.25 
 
 		 401 aa  232  7.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1115  general secretion pathway protein F  46.65 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  28.71 
 
 		 406 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00603  general secretion pathway protein F  32.01 
 
 		 406 aa  220  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  33.92 
 
 		 402 aa  219  7e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  33.58 
 
 		 407 aa  217  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0107  general secretion pathway protein F  34.31 
 
 		 410 aa  218  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2090  type II secretion system protein  36.8 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0804302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  30.82 
 
 		 422 aa  216  5e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4356  general secretion pathway protein F  35.04 
 
 		 407 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  35.04 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  33.9 
 
 		 409 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0719  general secretion pathway protein F  33.9 
 
 		 409 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.975907  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0718  general secretion pathway protein F  33.9 
 
 		 409 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55430  putative type II secretion system protein  35.5 
 
 		 404 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000716105  normal  0.0429131 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  29.06 
 
 		 405 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  33.91 
 
 		 407 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  33.91 
 
 		 407 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  33.91 
 
 		 407 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  33.91 
 
 		 407 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  32.35 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0123  general secretion pathway protein F  34.89 
 
 		 407 aa  211  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.63 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  30.75 
 
 		 405 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  29.34 
 
 		 405 aa  211  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  30.64 
 
 		 406 aa  211  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  33.17 
 
 		 407 aa  210  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  30.42 
 
 		 417 aa  210  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  30 
 
 		 401 aa  209  5e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  28.47 
 
 		 407 aa  209  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001890  general secretion pathway protein F  32.68 
 
 		 405 aa  209  6e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  32.18 
 
 		 406 aa  209  7e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3617  general secretion pathway protein F  34.23 
 
 		 406 aa  209  9e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1300  type II secretion system protein  31.62 
 
 		 405 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254672 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  29.29 
 
 		 419 aa  207  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  29.3 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  28.15 
 
 		 404 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4159  type II secretion system protein  30.91 
 
 		 427 aa  207  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287604 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  34.32 
 
 		 404 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  32.07 
 
 		 405 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  31.27 
 
 		 405 aa  206  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4823  putative type II secretion system protein  35.25 
 
 		 404 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0274243  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0050  general secretion pathway protein F  34.07 
 
 		 405 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899692  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  29.95 
 
 		 403 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0060  general secretion pathway protein F  34.07 
 
 		 405 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  32.41 
 
 		 403 aa  206  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2185  Type II secretion system F domain protein  31.04 
 
 		 403 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.170941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  34 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0061  general secretion pathway protein F  34.07 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  31.09 
 
 		 404 aa  204  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.44 
 
 		 405 aa  203  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  29.95 
 
 		 407 aa  203  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3242  general secretion pathway protein F  33.58 
 
 		 405 aa  203  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0010  general secretion pathway protein F  33.58 
 
 		 405 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0079  general secretion pathway protein F  33.58 
 
 		 405 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0060  general secretion pathway protein F  33.58 
 
 		 405 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211909  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  32.43 
 
 		 409 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  33.75 
 
 		 405 aa  202  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  29.44 
 
 		 407 aa  202  7e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4589  general secretion pathway protein F  32.27 
 
 		 413 aa  202  8e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  29.37 
 
 		 406 aa  202  9e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  31.9 
 
 		 412 aa  202  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  30.5 
 
 		 406 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  29.19 
 
 		 419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  33.33 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1301  general secretion pathway protein F  34.8 
 
 		 408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0233  general secretion pathway protein F  31.68 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1525  type II secretion system protein  35.79 
 
 		 409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0171  general secretion pathway protein F  34.64 
 
 		 407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  30.81 
 
 		 403 aa  200  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  31 
 
 		 408 aa  201  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  31.68 
 
 		 410 aa  200  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  33.09 
 
 		 405 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  30.15 
 
 		 412 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3086  type II secretion system protein  33.1 
 
 		 439 aa  199  6e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.52 
 
 		 405 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0158  general secretion pathway protein F  34.15 
 
 		 407 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0153  general secretion pathway protein F  34.15 
 
 		 407 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  32.84 
 
 		 405 aa  199  9e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  32.84 
 
 		 405 aa  199  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  32.84 
 
 		 405 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  32.84 
 
 		 405 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  32.84 
 
 		 405 aa  199  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  27.92 
 
 		 402 aa  199  9e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  30.28 
 
 		 409 aa  199  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  32.84 
 
 		 405 aa  199  9e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0386  general secretion pathway protein F  33.17 
 
 		 398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03129  hypothetical protein  33.17 
 
 		 398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0386  general secretion pathway protein F  33.17 
 
 		 398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3521  general secretion pathway protein F  33.17 
 
 		 398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  32.75 
 
 		 407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0005  general secretion pathway protein F  34.65 
 
 		 407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.138499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>