More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3150 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3316  general secretion pathway protein F  97.25 
 
 		 400 aa  693    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.233572  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3150  type II secretion system protein  100 
 
 		 400 aa  771    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2182  general secretion pathway protein F  61.85 
 
 		 399 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02677  general secretion pathway protein F  47.42 
 
 		 405 aa  329  5.0000000000000004e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0547  type II secretion system protein  48.64 
 
 		 406 aa  320  3e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0476697 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0770  type II secretion system protein  46.06 
 
 		 405 aa  317  2e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0857  general secretory pathway protein F  45.68 
 
 		 405 aa  317  2e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2894  general secretion pathway protein F  37.84 
 
 		 410 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196755  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1115  general secretion pathway protein F  43.87 
 
 		 364 aa  233  6e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  34.83 
 
 		 406 aa  231  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00603  general secretion pathway protein F  32.34 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  33.75 
 
 		 401 aa  230  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  34.65 
 
 		 403 aa  230  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  32.78 
 
 		 422 aa  227  2e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  34.88 
 
 		 407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  34.24 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  30.81 
 
 		 405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  30.92 
 
 		 403 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  30.58 
 
 		 405 aa  216  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5703  general secretion pathway protein F  34.64 
 
 		 408 aa  216  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0555477  normal  0.0587373 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  30.05 
 
 		 406 aa  216  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3617  general secretion pathway protein F  34.89 
 
 		 406 aa  216  7e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  32.01 
 
 		 406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2090  type II secretion system protein  34.91 
 
 		 402 aa  213  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0804302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  29.9 
 
 		 404 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1300  type II secretion system protein  34.17 
 
 		 405 aa  213  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254672 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4589  general secretion pathway protein F  33.74 
 
 		 413 aa  213  7e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1525  type II secretion system protein  37.88 
 
 		 409 aa  213  7e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  34.89 
 
 		 407 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1301  general secretion pathway protein F  34.9 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001890  general secretion pathway protein F  31.53 
 
 		 405 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  31.75 
 
 		 406 aa  211  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  31.36 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0892  type II secretion system protein  37.22 
 
 		 406 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00527688  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  31.85 
 
 		 408 aa  210  4e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1472  general secretion pathway protein F  35.38 
 
 		 408 aa  209  8e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.655662  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  29.75 
 
 		 401 aa  208  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  31.74 
 
 		 401 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  29.17 
 
 		 417 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  31.91 
 
 		 419 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0425  type II secretion system protein  32.33 
 
 		 406 aa  207  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126236  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  32 
 
 		 406 aa  207  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  30.17 
 
 		 407 aa  207  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  33.17 
 
 		 407 aa  207  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0593  general secretion pathway protein F  33.5 
 
 		 400 aa  206  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2209  general secretion pathway protein F  33.92 
 
 		 399 aa  206  6e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  31.5 
 
 		 408 aa  206  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  36.01 
 
 		 409 aa  206  9e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  28.92 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  32.68 
 
 		 407 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  32.68 
 
 		 407 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  32.68 
 
 		 407 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  32.68 
 
 		 407 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4823  putative type II secretion system protein  35.5 
 
 		 404 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0274243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55430  putative type II secretion system protein  35 
 
 		 404 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000716105  normal  0.0429131 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4159  type II secretion system protein  35.14 
 
 		 427 aa  203  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287604 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3554  type II secretion system protein  30.3 
 
 		 401 aa  203  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0607  general secretion pathway protein F  34.01 
 
 		 400 aa  203  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000348524 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0123  general secretion pathway protein F  33.83 
 
 		 407 aa  203  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  31.5 
 
 		 405 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  30.94 
 
 		 405 aa  202  7e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.27 
 
 		 405 aa  202  8e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0107  general secretion pathway protein F  33.25 
 
 		 410 aa  202  9e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4356  general secretion pathway protein F  34.48 
 
 		 407 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  28.75 
 
 		 403 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  31.59 
 
 		 410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2922  general secretion pathway protein F  30.96 
 
 		 405 aa  201  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  29.93 
 
 		 407 aa  200  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  31.42 
 
 		 404 aa  199  5e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3173  general secretion pathway protein F  32.75 
 
 		 403 aa  200  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131882  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3429  general secretion pathway protein F  34.16 
 
 		 405 aa  200  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239637 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0005  general secretion pathway protein F  35.71 
 
 		 407 aa  199  6e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.138499 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  31.43 
 
 		 419 aa  199  6e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  30.9 
 
 		 405 aa  199  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1350  general secretion pathway protein F  34 
 
 		 403 aa  199  7e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0061  general secretion pathway protein F  33.58 
 
 		 405 aa  199  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18690  type II secretion system protein  30.32 
 
 		 410 aa  199  9e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  31.92 
 
 		 417 aa  199  9e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  31.03 
 
 		 409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  32.38 
 
 		 404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  32.38 
 
 		 404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  31.42 
 
 		 404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0233  general secretion pathway protein F  30.94 
 
 		 406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03178  general secretory pathway component, cryptic  30.98 
 
 		 398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0386  general secretion pathway protein F  30.98 
 
 		 398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1279  general secretion pathway protein F  33.42 
 
 		 403 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  33 
 
 		 405 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0386  general secretion pathway protein F  30.98 
 
 		 398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  32.59 
 
 		 403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3521  general secretion pathway protein F  30.98 
 
 		 398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03129  hypothetical protein  30.98 
 
 		 398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3665  type II secretion system protein  31.84 
 
 		 395 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2858  general secretion pathway protein F  34.57 
 
 		 408 aa  197  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  31.33 
 
 		 405 aa  197  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2031  general secretion pathway protein F  34.74 
 
 		 405 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  33.63 
 
 		 407 aa  197  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  32.2 
 
 		 412 aa  197  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1006  type II secretion system protein  32.08 
 
 		 400 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3086  type II secretion system protein  32.26 
 
 		 439 aa  196  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>