More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2090 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2090  type II secretion system protein  100 
 
 		 402 aa  775    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0804302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2894  general secretion pathway protein F  38.54 
 
 		 410 aa  256  7e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196755  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4159  type II secretion system protein  35.6 
 
 		 427 aa  239  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287604 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1300  type II secretion system protein  36.21 
 
 		 405 aa  219  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2182  general secretion pathway protein F  36.8 
 
 		 399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  34.24 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0687  type II secretion system protein  37.74 
 
 		 416 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02677  general secretion pathway protein F  35.44 
 
 		 405 aa  212  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  33.75 
 
 		 405 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  33.5 
 
 		 407 aa  209  8e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  34.49 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  34.24 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3665  type II secretion system protein  31.75 
 
 		 395 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  33.33 
 
 		 407 aa  207  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  32.27 
 
 		 407 aa  207  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  34 
 
 		 405 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  34 
 
 		 405 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  34 
 
 		 405 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  34 
 
 		 405 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  34 
 
 		 405 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  34 
 
 		 405 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3617  general secretion pathway protein F  33.17 
 
 		 406 aa  204  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0061  general secretion pathway protein F  33.66 
 
 		 405 aa  203  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  33.33 
 
 		 409 aa  202  7e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1115  general secretion pathway protein F  38.69 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0547  type II secretion system protein  35.59 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0476697 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1525  type II secretion system protein  38.97 
 
 		 409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3072  general secretion pathway protein F  32.51 
 
 		 405 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000734436 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4356  general secretion pathway protein F  33.17 
 
 		 407 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0005  general secretion pathway protein F  33.58 
 
 		 407 aa  199  5e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.138499 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0079  general secretion pathway protein F  32.69 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0010  general secretion pathway protein F  32.69 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0060  general secretion pathway protein F  32.69 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211909  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0233  general secretion pathway protein F  28.29 
 
 		 406 aa  197  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0158  general secretion pathway protein F  31.77 
 
 		 407 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0153  general secretion pathway protein F  31.77 
 
 		 407 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  31.28 
 
 		 407 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  31.28 
 
 		 407 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  31.28 
 
 		 407 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  31.28 
 
 		 407 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  31.37 
 
 		 409 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  31.74 
 
 		 401 aa  196  6e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0107  general secretion pathway protein F  31.45 
 
 		 410 aa  196  9e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  29.9 
 
 		 401 aa  195  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3242  general secretion pathway protein F  32.45 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0050  general secretion pathway protein F  32.69 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899692  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0153  general secretion pathway protein F  31.53 
 
 		 407 aa  195  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  31.2 
 
 		 402 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0060  general secretion pathway protein F  32.69 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4589  general secretion pathway protein F  29.76 
 
 		 413 aa  193  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2922  general secretion pathway protein F  27.79 
 
 		 405 aa  192  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  29.52 
 
 		 403 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0123  general secretion pathway protein F  30.69 
 
 		 407 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3255  type II secretion system protein  31.25 
 
 		 403 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0168  general secretion pathway protein F  32.51 
 
 		 407 aa  190  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2209  general secretion pathway protein F  33 
 
 		 399 aa  190  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1301  general secretion pathway protein F  32.6 
 
 		 408 aa  189  5e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3173  general secretion pathway protein F  33.33 
 
 		 403 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131882  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1071  general secretion pathway protein F  32.01 
 
 		 405 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  27.72 
 
 		 406 aa  188  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00603  general secretion pathway protein F  26.8 
 
 		 406 aa  188  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3366  general secretion pathway protein F  35.17 
 
 		 403 aa  188  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0261754 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55430  putative type II secretion system protein  34.63 
 
 		 404 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000716105  normal  0.0429131 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  29.68 
 
 		 403 aa  187  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1279  general secretion pathway protein F  33.83 
 
 		 403 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  30.9 
 
 		 404 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3401  general secretion pathway protein F  34.03 
 
 		 403 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.54461 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3150  type II secretion system protein  34.91 
 
 		 400 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0719  general secretion pathway protein F  33.33 
 
 		 409 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.975907  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0718  general secretion pathway protein F  33.33 
 
 		 409 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  33.33 
 
 		 409 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  30.12 
 
 		 403 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0171  general secretion pathway protein F  31.77 
 
 		 407 aa  186  6e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  29.47 
 
 		 405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  27.46 
 
 		 405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0770  type II secretion system protein  32.75 
 
 		 405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  29.08 
 
 		 407 aa  184  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  28.46 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  30.12 
 
 		 422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0099  general secretion pathway protein F  31.02 
 
 		 396 aa  184  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3116  general secretory pathway F transmembrane protein  32.84 
 
 		 403 aa  184  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4823  putative type II secretion system protein  34.88 
 
 		 404 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0274243  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3231  general secretion pathway protein F  32.26 
 
 		 405 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0101612  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0857  general secretory pathway protein F  32.83 
 
 		 405 aa  184  3e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  28.68 
 
 		 404 aa  184  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18690  type II secretion system protein  29.2 
 
 		 410 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  29.48 
 
 		 404 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  29.48 
 
 		 404 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  27.25 
 
 		 404 aa  182  7e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03178  general secretory pathway component, cryptic  29.35 
 
 		 398 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0386  general secretion pathway protein F  29.35 
 
 		 398 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0386  general secretion pathway protein F  29.35 
 
 		 398 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3578  TonB-dependent siderophore receptor  31.95 
 
 		 411 aa  182  9.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.477901 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  26.93 
 
 		 406 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03129  hypothetical protein  29.35 
 
 		 398 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3521  general secretion pathway protein F  29.35 
 
 		 398 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  32.39 
 
 		 408 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2392  general secretion pathway protein F  31.86 
 
 		 404 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000517266 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3054  general secretion pathway protein F  33.25 
 
 		 403 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1414  general secretion pathway protein F  32.18 
 
 		 405 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0648646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>