More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0892 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0892  type II secretion system protein  100 
 
 		 406 aa  760    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00527688  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1525  type II secretion system protein  47.21 
 
 		 409 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  36.88 
 
 		 402 aa  229  9e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2182  general secretion pathway protein F  35.8 
 
 		 399 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3316  general secretion pathway protein F  38.18 
 
 		 400 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.233572  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2894  general secretion pathway protein F  33.99 
 
 		 410 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196755  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  28.04 
 
 		 401 aa  211  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3150  type II secretion system protein  37.22 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  29.44 
 
 		 419 aa  206  7e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  27.97 
 
 		 403 aa  202  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0857  general secretory pathway protein F  35.16 
 
 		 405 aa  202  7e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0770  type II secretion system protein  35.41 
 
 		 405 aa  202  9e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0547  type II secretion system protein  35.16 
 
 		 406 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0476697 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18690  type II secretion system protein  31.95 
 
 		 410 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02677  general secretion pathway protein F  33.66 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  30.3 
 
 		 406 aa  192  6e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1115  general secretion pathway protein F  35.94 
 
 		 364 aa  191  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  28.92 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0060  general secretion pathway protein F  34.24 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0050  general secretion pathway protein F  34.24 
 
 		 405 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899692  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  29.28 
 
 		 403 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2090  type II secretion system protein  34.13 
 
 		 402 aa  189  9e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0804302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0302  Type II secretion system F domain protein  32.43 
 
 		 412 aa  188  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4159  type II secretion system protein  30.86 
 
 		 427 aa  187  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287604 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  34.22 
 
 		 409 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0425  type II secretion system protein  33 
 
 		 406 aa  187  4e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126236  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1301  general secretion pathway protein F  32.59 
 
 		 408 aa  187  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03178  general secretory pathway component, cryptic  30.69 
 
 		 398 aa  186  8e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0386  general secretion pathway protein F  30.69 
 
 		 398 aa  186  8e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3521  general secretion pathway protein F  30.69 
 
 		 398 aa  186  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03129  hypothetical protein  30.69 
 
 		 398 aa  186  8e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0386  general secretion pathway protein F  30.69 
 
 		 398 aa  186  8e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00603  general secretion pathway protein F  28.61 
 
 		 406 aa  186  9e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0060  general secretion pathway protein F  33.99 
 
 		 405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211909  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0079  general secretion pathway protein F  33.99 
 
 		 405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0010  general secretion pathway protein F  33.99 
 
 		 405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  31.47 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3242  general secretion pathway protein F  33.74 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  31.88 
 
 		 409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1317  type II secretory pathway protein LspF  28.22 
 
 		 399 aa  182  6e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  28.85 
 
 		 404 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  28.5 
 
 		 407 aa  182  9.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  32.68 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1314  type II secretory pathway protein LspF  28.22 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  33.53 
 
 		 417 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3425  general secretion pathway protein F  32.18 
 
 		 407 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3245  general secretion pathway protein GspF  32.92 
 
 		 407 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.750263 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  25.93 
 
 		 401 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  29.66 
 
 		 403 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3136  general secretion pathway protein F  32.43 
 
 		 407 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  29.9 
 
 		 404 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  29.9 
 
 		 404 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  29.85 
 
 		 406 aa  179  8e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  28.15 
 
 		 406 aa  179  8e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02836  hypothetical type II secretion protein GspF  32.43 
 
 		 407 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000156909  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02786  hypothetical protein  32.43 
 
 		 407 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000209561  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3072  general secretion pathway protein F  32.44 
 
 		 405 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000734436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  28.5 
 
 		 406 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  29.46 
 
 		 405 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3410  general secretion pathway protein GspF  31.44 
 
 		 407 aa  177  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  36.73 
 
 		 409 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0061  general secretion pathway protein F  32.51 
 
 		 405 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5703  general secretion pathway protein F  32.76 
 
 		 408 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0555477  normal  0.0587373 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  27.38 
 
 		 403 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  29.82 
 
 		 403 aa  177  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  31.95 
 
 		 405 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  31.45 
 
 		 410 aa  177  4e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2922  general secretion pathway protein F  27.38 
 
 		 405 aa  177  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  31.5 
 
 		 433 aa  176  5e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  30.96 
 
 		 408 aa  176  6e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  32.44 
 
 		 405 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  32.44 
 
 		 405 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  32.44 
 
 		 405 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  32.44 
 
 		 405 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  32.44 
 
 		 405 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  32.44 
 
 		 405 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  32.44 
 
 		 405 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  35.26 
 
 		 404 aa  175  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  32.44 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1472  general secretion pathway protein F  32.84 
 
 		 408 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.655662  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  30.75 
 
 		 417 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  28.64 
 
 		 407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3394  general secretion pathway protein F  33.66 
 
 		 405 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1745  type II secretion system protein  29.88 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1997  Type II secretion system F domain protein  26.35 
 
 		 407 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2209  general secretion pathway protein F  33.66 
 
 		 399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2031  general secretion pathway protein F  33.41 
 
 		 405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24010  general secretion pathway protein F  33.58 
 
 		 405 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  29.18 
 
 		 417 aa  173  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001890  general secretion pathway protein F  28.61 
 
 		 405 aa  173  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  29.63 
 
 		 410 aa  172  6.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1350  general secretion pathway protein F  30.79 
 
 		 403 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0233  general secretion pathway protein F  27.98 
 
 		 406 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0718  general secretion pathway protein F  36.44 
 
 		 409 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0719  general secretion pathway protein F  36.44 
 
 		 409 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.975907  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  26.89 
 
 		 405 aa  172  9e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3231  general secretion pathway protein F  35.2 
 
 		 405 aa  172  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0101612  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0005  general secretion pathway protein F  35.84 
 
 		 407 aa  172  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.138499 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1071  general secretion pathway protein F  33.66 
 
 		 411 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  27.65 
 
 		 406 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>