More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1450 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1450  type II secretion system protein  100 
 
 		 405 aa  800    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1784  type IV pilus biogenesis protein PilC, putative  58.58 
 
 		 402 aa  479  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1865  type II secretion system protein  57.6 
 
 		 402 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.334713 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1923  type II secretion system protein  55.15 
 
 		 402 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.919085  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1278  type II secretion system protein  56.86 
 
 		 401 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2421  type II secretion system protein  59.71 
 
 		 402 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.610249  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3005  type II secretion system protein  56.76 
 
 		 401 aa  430  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00232151 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0130  type II secretory pathway, component PulF  43.49 
 
 		 401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1685  type II secretory pathway, component PulF  39.85 
 
 		 402 aa  301  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381238  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1575  type II secretion system protein  35.8 
 
 		 403 aa  263  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377421  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  31.36 
 
 		 404 aa  256  7e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  31.45 
 
 		 406 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  31.7 
 
 		 405 aa  251  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.77 
 
 		 405 aa  250  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  32.02 
 
 		 405 aa  246  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  33 
 
 		 401 aa  243  6e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  30.73 
 
 		 405 aa  243  6e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  31.94 
 
 		 407 aa  239  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  34.56 
 
 		 408 aa  236  5.0000000000000005e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  32.99 
 
 		 405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  35.61 
 
 		 406 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  29.88 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  33.74 
 
 		 406 aa  229  6e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  31.63 
 
 		 417 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  31.63 
 
 		 417 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  31.63 
 
 		 417 aa  226  8e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  30.75 
 
 		 407 aa  223  6e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  30.98 
 
 		 417 aa  222  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  28.82 
 
 		 404 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  32.59 
 
 		 401 aa  217  4e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  32.26 
 
 		 419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  30.27 
 
 		 419 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  28.18 
 
 		 404 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  28.18 
 
 		 404 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  31.47 
 
 		 417 aa  213  7e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  29.64 
 
 		 406 aa  212  7.999999999999999e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  31.94 
 
 		 403 aa  212  9e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  31.62 
 
 		 401 aa  212  9e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  31.3 
 
 		 406 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  29.8 
 
 		 410 aa  210  4e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  30.81 
 
 		 424 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  30.81 
 
 		 420 aa  210  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  31.51 
 
 		 463 aa  209  6e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  31.51 
 
 		 463 aa  209  6e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  33.72 
 
 		 412 aa  209  8e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  30.02 
 
 		 412 aa  209  8e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  30.46 
 
 		 422 aa  209  9e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 419 aa  208  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  30.32 
 
 		 403 aa  208  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.63 
 
 		 423 aa  208  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  29.28 
 
 		 406 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  27.71 
 
 		 402 aa  207  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  31.68 
 
 		 404 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  31.39 
 
 		 408 aa  206  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2894  general secretion pathway protein F  33.33 
 
 		 410 aa  206  6e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196755  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  30.46 
 
 		 423 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.46 
 
 		 405 aa  206  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3879  type II secretion system protein  34.95 
 
 		 397 aa  206  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  31.13 
 
 		 410 aa  205  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1352  pilin biogenesis protein, putative  30.18 
 
 		 401 aa  204  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.291747  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  28.75 
 
 		 408 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  30.58 
 
 		 408 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  30.38 
 
 		 409 aa  204  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  28.79 
 
 		 407 aa  204  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3255  type II secretion system protein  29.5 
 
 		 403 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  30.96 
 
 		 405 aa  203  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  28.39 
 
 		 405 aa  203  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  28.64 
 
 		 405 aa  202  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1164  type II secretion system protein  30.16 
 
 		 401 aa  202  6e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  29.37 
 
 		 405 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0150  type II secretion system protein  31.76 
 
 		 410 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  31.23 
 
 		 419 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  30.49 
 
 		 409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  29.31 
 
 		 422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  29.82 
 
 		 409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  29.72 
 
 		 420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  29.15 
 
 		 403 aa  201  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  28.78 
 
 		 422 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2682  type II secretion system protein  30.55 
 
 		 406 aa  199  7e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0414992  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.66 
 
 		 402 aa  199  9e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  30.38 
 
 		 405 aa  199  9e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  29.78 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  30.15 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1433  type II secretion system protein F  34.11 
 
 		 392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  27.01 
 
 		 403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  27.75 
 
 		 404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2420  type II secretion system protein  36.32 
 
 		 393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  31.67 
 
 		 417 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1134  type II secretion system protein  29.89 
 
 		 401 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  31.09 
 
 		 416 aa  197  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  31.27 
 
 		 404 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  29.87 
 
 		 424 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  28.61 
 
 		 407 aa  196  7e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  30.35 
 
 		 401 aa  196  7e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58760  type 4 fimbrial biogenesis protein pilC  30.42 
 
 		 373 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.95906  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  29.55 
 
 		 421 aa  195  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  29.56 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.62 
 
 		 419 aa  195  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2338  type II secretion system protein  34.51 
 
 		 396 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2001  type IV pilin biogenesis protein PilC  29.22 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>