More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2420 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2420  type II secretion system protein  100 
 
 
393 aa  776    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1433  type II secretion system protein F  52.28 
 
 
392 aa  383  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1294  type II secretion system protein F  55.3 
 
 
389 aa  381  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0082723  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1342  type II secretion system protein  52.15 
 
 
395 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2589  type II secretion system protein  50.89 
 
 
394 aa  357  9.999999999999999e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28630  Type II secretion system protein F  45.71 
 
 
396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3879  type II secretion system protein  46.46 
 
 
397 aa  335  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1972  type II secretion system protein  45.71 
 
 
395 aa  328  7e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603788  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2516  type II secretion system protein  47.74 
 
 
396 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.136161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3424  type II secretion system protein  47.49 
 
 
403 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2793  type II secretion system protein  46.73 
 
 
396 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289636  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2338  type II secretion system protein  47.24 
 
 
396 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3222  type II secretion system protein  44.3 
 
 
394 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.333811 
 
 
-
 
NC_003296  RS02971  general secretion pathway GSPF-like transmembrane protein  44.47 
 
 
395 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1865  type II secretion system protein  35.88 
 
 
402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.334713 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4712  Type II secretory pathway, gspf-related transmembrane protein  36.57 
 
 
413 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.992517  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1923  type II secretion system protein  33.67 
 
 
402 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.919085  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2309  putative GSPF-related transmembrane protein  35.57 
 
 
400 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.281801  normal  0.163088 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1432  type II secretion system protein  37.12 
 
 
393 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1685  type II secretory pathway, component PulF  35.09 
 
 
402 aa  216  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381238  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1784  type IV pilus biogenesis protein PilC, putative  34.68 
 
 
402 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1450  type II secretion system protein  35.66 
 
 
405 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1278  type II secretion system protein  34.27 
 
 
401 aa  199  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2613  type II secretion system protein  36.51 
 
 
382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.95954 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  28.42 
 
 
404 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  27.91 
 
 
406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  30.4 
 
 
401 aa  184  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_003296  RS00345  putative general secretion pathway GSPF-related transmembrane protein  32.59 
 
 
397 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.604529 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0130  type II secretory pathway, component PulF  31.38 
 
 
401 aa  179  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  27.6 
 
 
406 aa  177  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  27.91 
 
 
405 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1317  type II secretory pathway protein LspF  27.37 
 
 
399 aa  176  5e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  26.82 
 
 
405 aa  176  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1314  type II secretory pathway protein LspF  27.37 
 
 
399 aa  175  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  30.49 
 
 
403 aa  175  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3005  type II secretion system protein  33.93 
 
 
401 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00232151 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2421  type II secretion system protein  34.43 
 
 
402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.610249  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  30 
 
 
404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  28.9 
 
 
422 aa  173  3.9999999999999995e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1575  type II secretion system protein  31.25 
 
 
403 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377421  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  27.76 
 
 
407 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4159  type II secretion system protein  29.76 
 
 
427 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287604 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  27.2 
 
 
401 aa  170  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  28.12 
 
 
405 aa  169  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  29.02 
 
 
405 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3255  type II secretion system protein  28.14 
 
 
403 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  29.27 
 
 
405 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  27.88 
 
 
403 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  27.92 
 
 
405 aa  168  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  30.51 
 
 
401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  30.27 
 
 
405 aa  166  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  27.91 
 
 
405 aa  166  9e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18690  type II secretion system protein  28.65 
 
 
410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  28.02 
 
 
419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  30.05 
 
 
417 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1071  general secretion pathway protein F  29.01 
 
 
405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2031  general secretion pathway protein F  30.58 
 
 
405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.76 
 
 
402 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  30.3 
 
 
417 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  28.61 
 
 
405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  28.61 
 
 
405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  28.61 
 
 
405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  28.61 
 
 
405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  28.61 
 
 
405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  28.61 
 
 
405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  27.04 
 
 
401 aa  162  7e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3394  general secretion pathway protein F  29.69 
 
 
405 aa  162  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955056  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03178  general secretory pathway component, cryptic  30.9 
 
 
398 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0386  general secretion pathway protein F  30.9 
 
 
398 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0386  general secretion pathway protein F  30.9 
 
 
398 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  29.32 
 
 
417 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  28.31 
 
 
403 aa  162  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3521  general secretion pathway protein F  30.9 
 
 
398 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03129  hypothetical protein  30.9 
 
 
398 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  28.35 
 
 
405 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  27.54 
 
 
408 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24010  general secretion pathway protein F  30.65 
 
 
405 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  30.81 
 
 
406 aa  160  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3072  general secretion pathway protein F  28.61 
 
 
405 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000734436 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  28.35 
 
 
405 aa  160  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3242  general secretion pathway protein F  28.1 
 
 
405 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  28.33 
 
 
406 aa  158  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  27.86 
 
 
409 aa  159  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2209  general secretion pathway protein F  29.77 
 
 
399 aa  158  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616736  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2182  general secretion pathway protein F  31.03 
 
 
399 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  26.77 
 
 
463 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0061  general secretion pathway protein F  27.85 
 
 
405 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  26.29 
 
 
405 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2922  general secretion pathway protein F  28.8 
 
 
405 aa  157  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  26.77 
 
 
463 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  27.5 
 
 
409 aa  157  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  27.34 
 
 
405 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3231  general secretion pathway protein F  29.84 
 
 
405 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0101612  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  26.32 
 
 
424 aa  155  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  26.32 
 
 
420 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0079  general secretion pathway protein F  27.34 
 
 
405 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  28.86 
 
 
402 aa  155  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0060  general secretion pathway protein F  27.59 
 
 
405 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0050  general secretion pathway protein F  27.59 
 
 
405 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899692  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0060  general secretion pathway protein F  27.34 
 
 
405 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>