More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1342 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1342  type II secretion system protein  100 
 
 
395 aa  784    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1294  type II secretion system protein F  58.33 
 
 
389 aa  412  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0082723  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2420  type II secretion system protein  52.15 
 
 
393 aa  393  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1433  type II secretion system protein F  51.52 
 
 
392 aa  390  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2589  type II secretion system protein  55.89 
 
 
394 aa  386  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28630  Type II secretion system protein F  52.02 
 
 
396 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3879  type II secretion system protein  48.62 
 
 
397 aa  359  6e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1972  type II secretion system protein  50.75 
 
 
395 aa  358  9e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603788  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3424  type II secretion system protein  48.23 
 
 
403 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2338  type II secretion system protein  47.87 
 
 
396 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2516  type II secretion system protein  47.98 
 
 
396 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.136161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2793  type II secretion system protein  46.97 
 
 
396 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289636  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02971  general secretion pathway GSPF-like transmembrane protein  46.58 
 
 
395 aa  300  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3222  type II secretion system protein  46.99 
 
 
394 aa  294  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.333811 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1432  type II secretion system protein  36.13 
 
 
393 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2309  putative GSPF-related transmembrane protein  37.41 
 
 
400 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.281801  normal  0.163088 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4712  Type II secretory pathway, gspf-related transmembrane protein  36.41 
 
 
413 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.992517  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1278  type II secretion system protein  36.54 
 
 
401 aa  220  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1865  type II secretion system protein  32.4 
 
 
402 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.334713 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1923  type II secretion system protein  33.67 
 
 
402 aa  211  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.919085  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1450  type II secretion system protein  36.06 
 
 
405 aa  208  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1685  type II secretory pathway, component PulF  33.43 
 
 
402 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381238  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1784  type IV pilus biogenesis protein PilC, putative  33.33 
 
 
402 aa  203  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3005  type II secretion system protein  37.44 
 
 
401 aa  202  9e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00232151 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  29.38 
 
 
406 aa  197  3e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2613  type II secretion system protein  35.53 
 
 
382 aa  196  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.95954 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.53 
 
 
402 aa  193  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  30.87 
 
 
401 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  28.21 
 
 
405 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00345  putative general secretion pathway GSPF-related transmembrane protein  32.57 
 
 
397 aa  186  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.604529 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  29.37 
 
 
405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  29.77 
 
 
422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  30.97 
 
 
405 aa  185  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  27.59 
 
 
406 aa  184  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0130  type II secretory pathway, component PulF  34.19 
 
 
401 aa  184  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.7 
 
 
423 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  27.34 
 
 
404 aa  182  7e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  28.57 
 
 
417 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  29.44 
 
 
423 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  27.55 
 
 
405 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.07 
 
 
405 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  30.31 
 
 
410 aa  180  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  28.57 
 
 
417 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  28.32 
 
 
417 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  28.87 
 
 
405 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  30.68 
 
 
422 aa  177  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  31.18 
 
 
417 aa  177  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  28.57 
 
 
407 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  30 
 
 
406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  27.41 
 
 
401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  27.99 
 
 
403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  29.71 
 
 
419 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  28.08 
 
 
407 aa  173  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  28.36 
 
 
409 aa  172  6.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  30 
 
 
463 aa  172  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  28.45 
 
 
407 aa  172  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18690  type II secretion system protein  29.31 
 
 
410 aa  172  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  28.97 
 
 
405 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  30 
 
 
463 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  26.81 
 
 
405 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1317  type II secretory pathway protein LspF  29.46 
 
 
399 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02677  general secretion pathway protein F  30.08 
 
 
405 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  29.08 
 
 
420 aa  170  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4061  type II secretion system protein  29.52 
 
 
423 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.505472 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2421  type II secretion system protein  34.72 
 
 
402 aa  170  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.610249  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  25.53 
 
 
407 aa  170  5e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3943  type II secretion system protein  30.36 
 
 
423 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1314  type II secretory pathway protein LspF  28.87 
 
 
399 aa  169  7e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  28.03 
 
 
409 aa  169  7e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3394  general secretion pathway protein F  29.92 
 
 
405 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955056  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  29.15 
 
 
421 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  31.55 
 
 
404 aa  168  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  26.99 
 
 
419 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  26.76 
 
 
419 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  28.35 
 
 
419 aa  168  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  30 
 
 
403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  27.59 
 
 
422 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  30.08 
 
 
417 aa  166  5.9999999999999996e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  28.97 
 
 
406 aa  166  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0770  type II secretion system protein  32.74 
 
 
405 aa  166  8e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  28.36 
 
 
401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  28.97 
 
 
406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  27 
 
 
405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0857  general secretory pathway protein F  32.74 
 
 
405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  30.09 
 
 
409 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  26.41 
 
 
410 aa  163  5.0000000000000005e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0862  type IV pilus biogenesis protein PilC  27.71 
 
 
405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0424  type II secretion system protein  27.34 
 
 
421 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440885 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0664  type IV pilin biogenesis protein  29.64 
 
 
400 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1575  type II secretion system protein  27.79 
 
 
403 aa  162  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377421  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3606  type II secretion system protein  30.81 
 
 
421 aa  162  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  28.75 
 
 
404 aa  162  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58760  type 4 fimbrial biogenesis protein pilC  28.15 
 
 
373 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.95906  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0774  type II secretion system protein  29.32 
 
 
405 aa  162  9e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  27.76 
 
 
402 aa  162  9e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  27.57 
 
 
419 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4159  type II secretion system protein  29.8 
 
 
427 aa  162  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287604 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0418  type II secretion system protein  29.77 
 
 
423 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.11378  hitchhiker  0.00766616 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.09 
 
 
419 aa  162  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  26.53 
 
 
405 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>