More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0774 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  77.78 
 
 		 405 aa  657    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  72.84 
 
 		 405 aa  635    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  76.79 
 
 		 405 aa  635    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0774  type II secretion system protein  100 
 
 		 405 aa  816    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  72.84 
 
 		 405 aa  625  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  74.81 
 
 		 405 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58760  type 4 fimbrial biogenesis protein pilC  81.18 
 
 		 373 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.95906  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2682  type II secretion system protein  66.91 
 
 		 406 aa  526  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0414992  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  61.52 
 
 		 403 aa  508  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0862  type IV pilus biogenesis protein PilC  60.79 
 
 		 405 aa  496  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  57.53 
 
 		 419 aa  491  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  56.28 
 
 		 402 aa  486  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0068  type II secretion system protein  62.53 
 
 		 407 aa  486  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000163403  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  55.67 
 
 		 406 aa  475  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0063  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilC  61.52 
 
 		 407 aa  474  1e-132  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000657868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  57.29 
 
 		 401 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  57.64 
 
 		 417 aa  468  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  54.57 
 
 		 402 aa  463  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  54.7 
 
 		 407 aa  460  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  54.81 
 
 		 405 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  54.57 
 
 		 405 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  58.25 
 
 		 404 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  52.5 
 
 		 423 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  53.48 
 
 		 463 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  55.72 
 
 		 408 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  54.95 
 
 		 405 aa  454  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  53.73 
 
 		 463 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  51.5 
 
 		 422 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  51.5 
 
 		 423 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  52.46 
 
 		 419 aa  448  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  52.25 
 
 		 420 aa  450  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  53.63 
 
 		 422 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  52.72 
 
 		 407 aa  446  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  52 
 
 		 422 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  52.87 
 
 		 408 aa  442  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  53.75 
 
 		 409 aa  443  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  52.88 
 
 		 421 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  54.21 
 
 		 405 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  52.78 
 
 		 419 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  54.73 
 
 		 405 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3943  type II secretion system protein  52 
 
 		 423 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  54.21 
 
 		 405 aa  435  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2903  type II secretion system protein  54.23 
 
 		 405 aa  436  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4061  type II secretion system protein  52 
 
 		 423 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.505472 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3606  type II secretion system protein  53.38 
 
 		 421 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  52.49 
 
 		 419 aa  434  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  51.13 
 
 		 419 aa  432  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2185  Type II secretion system F domain protein  58.59 
 
 		 403 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.170941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3424  type II secretion system protein  52.88 
 
 		 421 aa  429  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.760778  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0418  type II secretion system protein  52.75 
 
 		 423 aa  431  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.11378  hitchhiker  0.00766616 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  49.75 
 
 		 421 aa  425  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  52.49 
 
 		 408 aa  422  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0481  type II secretion system protein, type IV pilus biogenesis protein PilC  54.68 
 
 		 410 aa  423  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0424  type II secretion system protein  53.13 
 
 		 421 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440885 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  49.75 
 
 		 420 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  53.03 
 
 		 406 aa  418  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  49.75 
 
 		 424 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  52.78 
 
 		 406 aa  416  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0150  type II secretion system protein  49.25 
 
 		 410 aa  415  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  52.15 
 
 		 409 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  50.37 
 
 		 424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3390  type II secretion system protein  51.25 
 
 		 422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2175  type II secretion system protein  49.11 
 
 		 410 aa  401  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357882  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  49.38 
 
 		 421 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  49.87 
 
 		 412 aa  386  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  44.14 
 
 		 405 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  40.49 
 
 		 405 aa  329  6e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0972  type IV pilus biogenesis protein PilC  44.25 
 
 		 419 aa  329  7e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.910627  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1087  type II secretion system protein  44.25 
 
 		 419 aa  329  7e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  41 
 
 		 407 aa  328  9e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2001  type IV pilin biogenesis protein PilC  41.23 
 
 		 408 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148255  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  42.14 
 
 		 404 aa  325  7e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0633  type IV pili biogenesis protein PilC  43.29 
 
 		 402 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.360472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  40.9 
 
 		 405 aa  323  4e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0674  type II secretion system protein  43.58 
 
 		 402 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471277 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  41.35 
 
 		 407 aa  320  3e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  41.9 
 
 		 405 aa  318  9e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  42.04 
 
 		 403 aa  317  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  40.59 
 
 		 417 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  39.07 
 
 		 406 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  41.09 
 
 		 417 aa  316  5e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  40.35 
 
 		 417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  41.4 
 
 		 405 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4537  type II secretion system protein  42.11 
 
 		 402 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  39.4 
 
 		 405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  40.15 
 
 		 401 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  40.05 
 
 		 407 aa  300  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  39.6 
 
 		 403 aa  296  5e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  41.16 
 
 		 419 aa  296  6e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  36.36 
 
 		 404 aa  285  8e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  37.22 
 
 		 417 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  38.75 
 
 		 411 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  37.53 
 
 		 402 aa  283  5.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  36.91 
 
 		 409 aa  280  5e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  37.16 
 
 		 410 aa  276  4e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  35.1 
 
 		 406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  34.01 
 
 		 401 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  36.63 
 
 		 406 aa  272  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  35.07 
 
 		 408 aa  271  1e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0505  type II secretion system protein  37.5 
 
 		 401 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.23347  normal  0.637616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>