More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1865 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1784  type IV pilus biogenesis protein PilC, putative  82.59 
 
 		 402 aa  674    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1865  type II secretion system protein  100 
 
 		 402 aa  801    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.334713 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1923  type II secretion system protein  69.9 
 
 		 402 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.919085  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1278  type II secretion system protein  64.18 
 
 		 401 aa  526  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3005  type II secretion system protein  63.09 
 
 		 401 aa  489  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00232151 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2421  type II secretion system protein  61.69 
 
 		 402 aa  481  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.610249  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1450  type II secretion system protein  57.6 
 
 		 405 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1685  type II secretory pathway, component PulF  38.65 
 
 		 402 aa  320  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381238  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0130  type II secretory pathway, component PulF  39.45 
 
 		 401 aa  310  4e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  35.09 
 
 		 405 aa  281  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  35.56 
 
 		 405 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  33.17 
 
 		 405 aa  269  5e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  34.79 
 
 		 401 aa  268  1e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  34.22 
 
 		 405 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  33.25 
 
 		 406 aa  266  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1575  type II secretion system protein  35.5 
 
 		 403 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377421  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  33.07 
 
 		 404 aa  262  8e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  36 
 
 		 405 aa  256  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  34.68 
 
 		 417 aa  256  7e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  34.43 
 
 		 417 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  34.35 
 
 		 417 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  33.67 
 
 		 403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  36.14 
 
 		 406 aa  253  3e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  35.89 
 
 		 408 aa  254  3e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  32.42 
 
 		 407 aa  247  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  33.42 
 
 		 419 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 406 aa  246  4e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  33.94 
 
 		 406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  31.09 
 
 		 405 aa  242  9e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  33.66 
 
 		 401 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  36.05 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  30.85 
 
 		 405 aa  232  8.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2420  type II secretion system protein  37.54 
 
 		 393 aa  230  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  31.71 
 
 		 408 aa  230  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  30.95 
 
 		 407 aa  229  5e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  30.75 
 
 		 411 aa  229  5e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  31.99 
 
 		 404 aa  229  6e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  31.67 
 
 		 405 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  30.03 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  30.54 
 
 		 405 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  30.91 
 
 		 419 aa  223  4e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  32.7 
 
 		 417 aa  223  4.9999999999999996e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  28.93 
 
 		 406 aa  223  6e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  31.12 
 
 		 401 aa  222  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  30.18 
 
 		 409 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  28.11 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  29.92 
 
 		 408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  30.91 
 
 		 419 aa  220  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.5 
 
 		 405 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  30 
 
 		 412 aa  219  7e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  31.46 
 
 		 412 aa  219  7.999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  33.82 
 
 		 409 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  31.9 
 
 		 402 aa  219  8.999999999999998e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  28.32 
 
 		 402 aa  218  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  30.18 
 
 		 403 aa  216  8e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  30.81 
 
 		 403 aa  215  9e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0150  type II secretion system protein  30.83 
 
 		 410 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  29 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  27.88 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  29.23 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58760  type 4 fimbrial biogenesis protein pilC  31.75 
 
 		 373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.95906  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  31.59 
 
 		 407 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  27.88 
 
 		 405 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3879  type II secretion system protein  35.91 
 
 		 397 aa  213  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  30.46 
 
 		 463 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  30.46 
 
 		 463 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  31.33 
 
 		 417 aa  213  5.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.18 
 
 		 419 aa  212  7e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  30.85 
 
 		 407 aa  212  7.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  30.6 
 
 		 416 aa  212  9e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  28.93 
 
 		 404 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  30.25 
 
 		 410 aa  212  1e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  28.93 
 
 		 404 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  28.5 
 
 		 404 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  29.48 
 
 		 401 aa  212  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  31.63 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1294  type II secretion system protein F  35.47 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0082723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  30.15 
 
 		 404 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  29.01 
 
 		 406 aa  211  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  28.75 
 
 		 406 aa  211  3e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2894  general secretion pathway protein F  28.92 
 
 		 410 aa  210  4e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196755  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  28.64 
 
 		 409 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  32.23 
 
 		 409 aa  209  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  30.86 
 
 		 410 aa  209  5e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  30.86 
 
 		 404 aa  209  6e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1409  type II secretion system protein  30.34 
 
 		 405 aa  209  6e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205741  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.37 
 
 		 402 aa  209  9e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  27.06 
 
 		 405 aa  208  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  29.18 
 
 		 409 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  28.9 
 
 		 420 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  29.9 
 
 		 401 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  28.9 
 
 		 424 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  28.95 
 
 		 406 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.57 
 
 		 419 aa  207  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  28.97 
 
 		 405 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  26.78 
 
 		 401 aa  206  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  28 
 
 		 422 aa  206  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2516  type II secretion system protein  33.67 
 
 		 396 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136161 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  28.39 
 
 		 422 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0774  type II secretion system protein  30.43 
 
 		 405 aa  206  7e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>