More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0130 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0130  type II secretory pathway, component PulF  100 
 
 		 401 aa  809    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1450  type II secretion system protein  43.49 
 
 		 405 aa  326  3e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1865  type II secretion system protein  39.65 
 
 		 402 aa  326  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.334713 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1685  type II secretory pathway, component PulF  41.94 
 
 		 402 aa  319  6e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381238  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1784  type IV pilus biogenesis protein PilC, putative  39.4 
 
 		 402 aa  316  4e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1923  type II secretion system protein  38.65 
 
 		 402 aa  310  4e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.919085  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1278  type II secretion system protein  40.94 
 
 		 401 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2421  type II secretion system protein  39.5 
 
 		 402 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.610249  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3005  type II secretion system protein  40.2 
 
 		 401 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00232151 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  32.43 
 
 		 405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  31.28 
 
 		 406 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  31.52 
 
 		 401 aa  238  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  31.19 
 
 		 405 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  30.69 
 
 		 405 aa  232  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.39 
 
 		 405 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  31.28 
 
 		 407 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  31.27 
 
 		 417 aa  225  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  29.38 
 
 		 404 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  30.77 
 
 		 405 aa  219  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  29.82 
 
 		 405 aa  219  6e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1575  type II secretion system protein  31.17 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377421  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.9 
 
 		 405 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  30.2 
 
 		 404 aa  216  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  30.3 
 
 		 405 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  31.82 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  31.71 
 
 		 403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  32.23 
 
 		 417 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  31.73 
 
 		 417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  30.25 
 
 		 401 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  29.82 
 
 		 407 aa  212  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  31.37 
 
 		 405 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  32.99 
 
 		 403 aa  209  5e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  29.77 
 
 		 402 aa  209  6e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  30.53 
 
 		 419 aa  209  7e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  31.65 
 
 		 417 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  30.08 
 
 		 409 aa  209  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  27.68 
 
 		 401 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  30.85 
 
 		 419 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  31.14 
 
 		 409 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  33.09 
 
 		 409 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  30.27 
 
 		 412 aa  206  5e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0718  general secretion pathway protein F  33.01 
 
 		 409 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  30.96 
 
 		 419 aa  205  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0719  general secretion pathway protein F  33.01 
 
 		 409 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.975907  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58760  type 4 fimbrial biogenesis protein pilC  30.4 
 
 		 373 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.95906  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  31.94 
 
 		 410 aa  204  3e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  29.14 
 
 		 412 aa  203  4e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  30.26 
 
 		 408 aa  203  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  28.64 
 
 		 408 aa  202  6e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  28.86 
 
 		 407 aa  202  7e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  29.82 
 
 		 408 aa  202  8e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  29.06 
 
 		 403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  27.86 
 
 		 403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  30 
 
 		 420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  31.44 
 
 		 402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  28.87 
 
 		 405 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  29.56 
 
 		 408 aa  199  6e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2101  type II secretion system protein  30.08 
 
 		 404 aa  199  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  31.73 
 
 		 409 aa  199  6e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2175  type II secretion system protein  32.27 
 
 		 410 aa  199  7e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357882  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  29.85 
 
 		 463 aa  199  7e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  28.5 
 
 		 406 aa  199  7e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  29.85 
 
 		 463 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2001  type IV pilin biogenesis protein PilC  28.57 
 
 		 408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148255  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  27.76 
 
 		 406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  28.97 
 
 		 405 aa  197  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  28.16 
 
 		 404 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  28.64 
 
 		 407 aa  197  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  28.97 
 
 		 405 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  32.23 
 
 		 424 aa  196  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  28.07 
 
 		 409 aa  196  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3086  type II secretion system protein  30.48 
 
 		 439 aa  196  8.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  32.23 
 
 		 420 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1087  type II secretion system protein  29.7 
 
 		 419 aa  195  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2894  general secretion pathway protein F  28.89 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196755  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1972  type II secretion system protein  33.25 
 
 		 395 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0972  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.7 
 
 		 419 aa  195  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.910627  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  28.72 
 
 		 419 aa  195  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  27.79 
 
 		 407 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3424  type II secretion system protein  32.99 
 
 		 403 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  29.49 
 
 		 405 aa  194  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2338  type II secretion system protein  33.08 
 
 		 396 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  28.82 
 
 		 422 aa  194  3e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  29.21 
 
 		 404 aa  193  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3242  general secretion pathway protein F  29.68 
 
 		 405 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  28.79 
 
 		 405 aa  193  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  30.53 
 
 		 407 aa  193  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  29.93 
 
 		 405 aa  192  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  32.38 
 
 		 407 aa  192  9e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  29.93 
 
 		 405 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  30.49 
 
 		 424 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2420  type II secretion system protein  31.27 
 
 		 393 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  31.43 
 
 		 411 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  29.68 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0079  general secretion pathway protein F  29.43 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  28.13 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0862  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.23 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0060  general secretion pathway protein F  29.43 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211909  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  29.68 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  30.28 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>