More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0664 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0664  type IV pilin biogenesis protein  100 
 
 		 400 aa  811    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0625  type IV pilin biogenesis protein  62.91 
 
 		 401 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3764  type IV pilin biogenesis protein  55.36 
 
 		 401 aa  430  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3577  type IV pilin biogenesis protein  53.12 
 
 		 401 aa  422  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.261993  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3372  type IV pilin biogenesis protein  44.89 
 
 		 399 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1043  type IV pilin biogenesis protein  44.64 
 
 		 399 aa  345  7e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0343376 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0776  type IV pilin biogenesis protein  47.98 
 
 		 399 aa  331  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3500  type IV pilin biogenesis protein  45.6 
 
 		 378 aa  329  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0162  type IV pilin biogenesis protein  36.97 
 
 		 400 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00079869  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0155  type IV pilin biogenesis protein  36.72 
 
 		 400 aa  259  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000866014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0156  type IV pilin biogenesis protein  36.72 
 
 		 400 aa  258  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0805411 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0159  type IV pilin biogenesis protein  36.72 
 
 		 400 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0154  type IV pilin biogenesis protein  36.72 
 
 		 400 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0112  type IV pilin biogenesis protein  36.5 
 
 		 400 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0263524  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00105  assembly protein in type IV pilin biogenesis, transmembrane protein  36.25 
 
 		 400 aa  246  6e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3496  type II secretion system protein  36.25 
 
 		 400 aa  246  6e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3553  type IV pilin biogenesis protein  36.25 
 
 		 400 aa  246  6e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520074 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00104  hypothetical protein  36.25 
 
 		 400 aa  246  6e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0110  type IV pilin biogenesis protein  36.25 
 
 		 400 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000393014  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0098  type IV pilin biogenesis protein  36.25 
 
 		 400 aa  245  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00354832  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0650  type IV pilin biogenesis protein  37.5 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.82 
 
 		 405 aa  240  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  31.57 
 
 		 405 aa  235  9e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0109  type IV pilin biogenesis protein  35.73 
 
 		 400 aa  233  6e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0111048  normal  0.534441 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  31.31 
 
 		 405 aa  230  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2001  type IV pilin biogenesis protein PilC  32.83 
 
 		 408 aa  227  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148255  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  32.51 
 
 		 420 aa  225  9e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  32.42 
 
 		 422 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 422 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  32.26 
 
 		 423 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.53 
 
 		 419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  33.16 
 
 		 419 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.14 
 
 		 402 aa  219  6e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  32.75 
 
 		 422 aa  219  6e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  32.91 
 
 		 423 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3943  type II secretion system protein  32.75 
 
 		 423 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  30.63 
 
 		 403 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  31.31 
 
 		 405 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  30.9 
 
 		 407 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  32.24 
 
 		 419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  31.91 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4061  type II secretion system protein  32.75 
 
 		 423 aa  213  7e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.505472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0418  type II secretion system protein  33.25 
 
 		 423 aa  211  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.11378  hitchhiker  0.00766616 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  30.3 
 
 		 405 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  32.66 
 
 		 421 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3606  type II secretion system protein  32.08 
 
 		 421 aa  209  8e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0424  type II secretion system protein  31.31 
 
 		 421 aa  208  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440885 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  30.89 
 
 		 401 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  31.66 
 
 		 417 aa  207  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0774  type II secretion system protein  30.13 
 
 		 405 aa  206  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  30.05 
 
 		 406 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  30.25 
 
 		 424 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3424  type II secretion system protein  31.91 
 
 		 421 aa  202  6e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.760778  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  31.59 
 
 		 404 aa  202  7e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0862  type IV pilus biogenesis protein PilC  27.75 
 
 		 405 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  31.22 
 
 		 405 aa  200  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3390  type II secretion system protein  32.66 
 
 		 422 aa  200  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58760  type 4 fimbrial biogenesis protein pilC  30.73 
 
 		 373 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.95906  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 402 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  29.01 
 
 		 405 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  28.75 
 
 		 405 aa  197  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2682  type II secretion system protein  30.54 
 
 		 406 aa  197  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0414992  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  30 
 
 		 405 aa  197  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0548  type II secretion system protein  30.71 
 
 		 406 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00110848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  29.9 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  30.56 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  29.95 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  28.61 
 
 		 463 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  28.61 
 
 		 463 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  28.33 
 
 		 410 aa  194  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  29.88 
 
 		 406 aa  194  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  29.95 
 
 		 406 aa  193  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  30.15 
 
 		 404 aa  193  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  27.65 
 
 		 406 aa  193  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  28 
 
 		 403 aa  193  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0481  type II secretion system protein, type IV pilus biogenesis protein PilC  31.74 
 
 		 410 aa  193  6e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  29.32 
 
 		 405 aa  192  7e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  29.1 
 
 		 419 aa  192  8e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  28.88 
 
 		 417 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  30 
 
 		 409 aa  191  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  28.47 
 
 		 405 aa  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  28.5 
 
 		 421 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  29.03 
 
 		 420 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  29.03 
 
 		 424 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  29.98 
 
 		 417 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  29.13 
 
 		 417 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  29.01 
 
 		 405 aa  190  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  30.89 
 
 		 409 aa  190  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  28.1 
 
 		 407 aa  190  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  27.83 
 
 		 408 aa  190  5e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  27.48 
 
 		 409 aa  190  5e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4108  MSHA biogenesis protein MshG  29.58 
 
 		 406 aa  188  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00255  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshG (pilus type IV)  31.78 
 
 		 411 aa  188  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  29.98 
 
 		 405 aa  188  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  28.93 
 
 		 404 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  27.41 
 
 		 408 aa  187  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  28.96 
 
 		 406 aa  187  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3831  type II secretion system protein  28.61 
 
 		 406 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00398408  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  26.24 
 
 		 406 aa  186  8e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2175  type II secretion system protein  30.73 
 
 		 410 aa  186  8e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>