More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0156 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B0162  type IV pilin biogenesis protein  98.75 
 
 		 400 aa  799    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00079869  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0155  type IV pilin biogenesis protein  99.25 
 
 		 400 aa  801    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000866014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0159  type IV pilin biogenesis protein  99 
 
 		 400 aa  796    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0156  type IV pilin biogenesis protein  100 
 
 		 400 aa  805    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0805411 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0154  type IV pilin biogenesis protein  99 
 
 		 400 aa  798    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00105  assembly protein in type IV pilin biogenesis, transmembrane protein  67.75 
 
 		 400 aa  541  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3496  type II secretion system protein  67.75 
 
 		 400 aa  541  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00104  hypothetical protein  67.75 
 
 		 400 aa  541  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3553  type IV pilin biogenesis protein  67.75 
 
 		 400 aa  541  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520074 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0098  type IV pilin biogenesis protein  67.5 
 
 		 400 aa  540  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00354832  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0110  type IV pilin biogenesis protein  67.5 
 
 		 400 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000393014  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0112  type IV pilin biogenesis protein  66.5 
 
 		 400 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0263524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0109  type IV pilin biogenesis protein  67 
 
 		 400 aa  532  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0111048  normal  0.534441 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0650  type IV pilin biogenesis protein  55.53 
 
 		 398 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3577  type IV pilin biogenesis protein  38.9 
 
 		 401 aa  276  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.261993  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3372  type IV pilin biogenesis protein  38.69 
 
 		 399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0776  type IV pilin biogenesis protein  41.9 
 
 		 399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1043  type IV pilin biogenesis protein  38.44 
 
 		 399 aa  272  6e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0343376 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3764  type IV pilin biogenesis protein  39.15 
 
 		 401 aa  271  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3500  type IV pilin biogenesis protein  40.8 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0664  type IV pilin biogenesis protein  36 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0625  type IV pilin biogenesis protein  40.25 
 
 		 401 aa  246  6.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.92 
 
 		 402 aa  215  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  30.48 
 
 		 419 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.72 
 
 		 405 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  30.36 
 
 		 407 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2001  type IV pilin biogenesis protein PilC  30.42 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148255  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  31 
 
 		 419 aa  209  7e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  31.25 
 
 		 407 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  29.55 
 
 		 403 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.09 
 
 		 423 aa  205  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  29.22 
 
 		 405 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  30.47 
 
 		 405 aa  202  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  30.48 
 
 		 406 aa  202  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  29.57 
 
 		 422 aa  200  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  29.6 
 
 		 405 aa  200  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  30.23 
 
 		 406 aa  199  5e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  29.4 
 
 		 406 aa  199  7e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  28.78 
 
 		 417 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.49 
 
 		 419 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  28.32 
 
 		 422 aa  197  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  29.59 
 
 		 401 aa  197  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  29.85 
 
 		 423 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 409 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  28.64 
 
 		 406 aa  196  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  29.68 
 
 		 422 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2175  type II secretion system protein  31.22 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357882  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  29.22 
 
 		 421 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  29.75 
 
 		 420 aa  195  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0862  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.32 
 
 		 405 aa  193  6e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0424  type II secretion system protein  28.61 
 
 		 421 aa  192  9e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440885 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  27.39 
 
 		 419 aa  192  9e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  29.1 
 
 		 409 aa  192  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  28.36 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3424  type II secretion system protein  30.51 
 
 		 421 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.760778  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  29.03 
 
 		 404 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  30.82 
 
 		 404 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  27.65 
 
 		 405 aa  189  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  27.39 
 
 		 419 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  31.4 
 
 		 410 aa  187  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0418  type II secretion system protein  30.85 
 
 		 423 aa  188  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.11378  hitchhiker  0.00766616 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  31.14 
 
 		 405 aa  186  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  28.72 
 
 		 402 aa  186  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  28.9 
 
 		 405 aa  186  7e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  29.16 
 
 		 405 aa  186  7e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3943  type II secretion system protein  29.6 
 
 		 423 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  26.58 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3606  type II secretion system protein  29.48 
 
 		 421 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  29.52 
 
 		 424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  25.19 
 
 		 401 aa  184  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  29.52 
 
 		 420 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  28.53 
 
 		 407 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2682  type II secretion system protein  28.49 
 
 		 406 aa  183  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0414992  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4061  type II secretion system protein  29.85 
 
 		 423 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.505472 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  29.25 
 
 		 406 aa  182  8.000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  29.26 
 
 		 421 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  30.36 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  29.04 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3390  type II secretion system protein  30.79 
 
 		 422 aa  181  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  26.3 
 
 		 404 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  28.68 
 
 		 408 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0481  type II secretion system protein, type IV pilus biogenesis protein PilC  31.16 
 
 		 410 aa  180  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  28.9 
 
 		 424 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  27.81 
 
 		 407 aa  180  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  26.45 
 
 		 417 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  29.15 
 
 		 405 aa  179  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  26.7 
 
 		 417 aa  179  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  28.64 
 
 		 407 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  29.19 
 
 		 409 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  27.75 
 
 		 412 aa  177  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  26.42 
 
 		 417 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  28.46 
 
 		 405 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  26.7 
 
 		 417 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  29.85 
 
 		 409 aa  177  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  29.53 
 
 		 411 aa  177  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  26.25 
 
 		 405 aa  177  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.74 
 
 		 405 aa  176  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  26.41 
 
 		 463 aa  176  7e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  26.41 
 
 		 463 aa  176  9e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58760  type 4 fimbrial biogenesis protein pilC  27.45 
 
 		 373 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.95906  normal  0.743894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>